成都市妇女儿童中心医院全基因组测序(WGS)遗传病检测服务采购项目...

代理服务费收费标准:按照成本加合理利润原则,本项目代理服务费16600元,由成交供应商向代理机构支付。(收款单位、开户行银行账号详见招标文件)代理服务费金额:合同包1:1.66万元。收取对象:中标(成交)供应商。七、公告期限自本公告发布之日起1个工作日。八、其他补充事宜1.本项目备案号:51010024210200029903[2...

mNGS、NGS和WGS三种基因测序方式的区别

而mNGS测所有致病微生物,比如可以检测细菌、真菌、寄生虫、DNA病毒和RNA病毒等,一般24小时出数据,针对病原体检测,一个样本大概几千到1万的费用。mNGS实验流程NGS全称是Next-generationsequencingtechnology,也就是“下一代”测序技术(二代测序技术),属于短读长测序(可读取的序列长度一般在300个碱基以内),主要包括...

Nature|基于100kGP计划的WGS数据绘制全面的结直肠癌体细胞突变图谱

研究人员对来自英国十万基因组项目参与者的2023份CRC样本进行了全基因组测序,绘制了详细的CRC体细胞突变图谱。综合分析确定了250多个假定的CRC驱动基因,其中许多基因以前未发现与CRC或其他癌症有关,包括编码基因组外的几种复发性变化。研究人员分析了参与CRC发展的分子途径,根据基因组特征定义了四个新的微卫星稳定(MSS)...

指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

不同应用方向的测序技术,其建库方式不同,例如,tNGS要保证病原微生物的特异性扩增或捕获效率;mNGS更注重无偏倚扩增;WGS则可在不打断核酸的情况下测序,纯菌液样本只需1μg即可直接进行WGS,而低起始量的样本可在扩增后进行,例如COVID-19在循环数阈值(Ct值)仅为35时也可在扩增后进行WGS。是否进行PCR扩增和片段化...

Nature | 基因组学新纪元:超快速测序技术加速个性化医疗

WGS能够提供最全面的遗传信息,包括非编码区域的变异,这对于理解复杂疾病的遗传基础至关重要。相比之下,WES专注于编码区域的变异,成本较低,但可能遗漏对疾病同样重要的调控区域变异。未来,随着测序成本的进一步降低和数据分析能力的提升,WGS有望成为临床诊断的标准配置,为患者提供更全面、更精准的遗传信息。

算力+存力:优化基因测序的关键所在

高性能算力集群采用戴尔PowerEdgeR750机架式服务器,主要进行全基因组测序(WGS),靶向测序(Panel)等,这些分析工作对算力和内存要求都非常高,建议配置Intel8系CPU,1TB以上内存,采用4块1.92TBNVME硬盘存储参考基因组文件,二级分析时产生的临时文件等(www.e993.com)2024年11月18日。并可根据二、三级分析加速需求,AI建模/推理需求等选配GPU加速卡。

2024 ASCO精彩回顾,基因检测引领精准医学新浪潮|免疫|实体瘤|特异...

因美纳研发团队在本次ASCO2024上分享了其全新的TruSightOncologyMRDWGS检测(TSOMRD,仅供科研使用),该检测基于tumor-informed路线,针对多种癌症类型cfDNA开展全基因组测序WGS。方法介绍TSOMRD基于因美纳强大的WGS文库构建、生信分析和测序技术。主要包括检测过程分为两个主要步骤——分子指纹分析和ctDNA检测。

精准前沿丨cfDNA低覆盖度WGS测序中的全基因组突变特征

本期《精准前沿》栏目分享美国MSK癌症研究中心研究团队发表在NatureCommunications(IF=17.694)上的一篇研究[1],研究开发了一种名为Pointy的方法,该方法能够从低覆盖度血浆WGS(深度0.3-1.5x)测序数据中分析全基因组的突变特征,通过对样本进行单碱基替换(SBS)的特征分析,并结合机器学习的方法进行癌症检测。

获得全基因测序的最优方案—低深度重测序(LcWGS)有奇招!

全基因组关联研究(GWAS)已经确定了数千种与人类和农业物种复杂性状相关的遗传变异。尽管测序成本不断下降,大规模的全基因组测序(几千个样本)的成本仍然很高。在许多情况下,基于参考面板填充的策略将低密度数据填充为高密度数据,为全基因组关联分析提供了一种经济有效的方法。

入选“十大创新产品”,0 PCR WGS引领高通量测序新时代

日前,华大基因基于自主平台DNBSEQ的“0PCR全基因组重测序(WGS)”产品成功入选生物通评选的“2019生命科学十大创新产品”。该活动旨在评选出年度令人耳目一新的创新产品,为科研人员提供更多元的选择。评选经由读者投票和专家评鉴,最终确定入选名单。DNBSEQ0PCR全基因组重测序(WGS)由于其独特的建库测序方法,颠覆了传...