...沈阳农业大学武俊瑞教授等:枯草芽孢杆菌SNBS-3全基因组测序...
沈阳农业大学食品学院的纪帅奇、乌日娜、武俊瑞*等对从豆酱中分离的1株具有优良抑菌特性的枯草芽孢杆菌SNBS-3进行全基因组测序,获得基因组信息的同时,结合直系同源集(COG)、基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、碳水化合物活性酶(CAZyme)、抗生素耐药性数据库(CARD)和致病毒力因子数据库(VFDB)等,详...
Nature子刊:戴俊彪团队构建全基因组SCRaMbLE重排酵母,加速菌株...
综上所述,该研究成功构建了一个包含83个分布在16条染色体上的loxPsym位点的工程酵母菌株,并以此为研究对象,通过对SCRaMbLE之后所得菌株进行高通量测序及染色体结构分析,证明了带有全基因组分布loxPsym位点的酵母菌株可以作为研究基因组重排的有力工具,并且能够驱动菌株快速进化,获得环境胁迫耐受性。该研究提供的方法也为...
...等:1株牦牛乳源产细菌素融合魏斯氏菌ZW21全基因组测序及序列分析
如表1所示,W.confusaZW21全基因组中编码基因总长度为1947771bp,有2175个编码基因,平均长度为896bp,占基因组的87.57%;转座子30个,总长度为1908bp,平均长度64bp,占基因组的0.086%;长散在重复序列40个,总长度为2415bp,平均长度61bp,占基因组的0.109%;短分散重复序列18个,总长度为1122bp,平均长度...
...技术研究院戴俊彪团队构建全基因组SCRaMbLE重排酵母,加速菌株...
综上所述,本研究成功构建了一个包含83个分布在16条染色体上的loxPsym位点的工程酵母菌株,并以此为研究对象,通过对SCRaMbLE之后所得菌株进行高通量测序及染色体结构分析,证明了带有全基因组分布loxPsym位点的酵母菌株可以作为研究基因组重排的有力工具,并且能够驱动菌株快速进化,获得环境胁迫耐受性。该研究提供的方法也为...
11月,最值得看的30篇肠道健康文献! | 热心肠日报
①靶向分离技术和大规模宏基因组分析结合确定13个与Segatellacopri(Sc)菌相关的物种,且Sc复合体(ScC)包括4个以上不同的系统发育分支;②13个菌株(来自7个物种)全基因组重建发现大多数ScC物种中存在遗传多样性大圆形染色体外元件,有助于种内和种间多样性;③人体中存在的9个物种级进化枝流行率和物种内基因组...
快报| 基于全基因组测序的四川彝族人群结核分枝杆菌耐药情况研究
1.人口学及临床特征:2019年3月至2021年3月,布拖县人民医院共确诊784例彝族肺结核患者,得到培养物146株(www.e993.com)2024年9月17日。133株为结核分枝杆菌,进行了全基因组测序。7株测序失败,最终纳入116例患者的菌株进行分析。116例患者中,男性79例(68.10%,79/116),中位年龄为38岁(7~83岁);患者多为当地居民(94.39%,101/116)。以...
我省完成人工培育寒菌全基因组测序 为突破寒菌人工培育瓶颈奠定基础
华声在线10月26日讯(全媒体记者彭雅惠通讯员谭著明)今天,省林业科学院发布消息,该院科研团队与中国农科院麻类研究所相关团队合作完成了对纯人工培育红汁乳菇菌株JH5全基因组高质量测序,为突破寒菌人工培育瓶颈奠定基础。该全基因组测序成果已发表在国际遗传学术期刊上。
全基因组测序改变细菌性传染病监测和调查模式
在过去的十年里,借助基因组测序和数据分析技术的快速发展,使得细菌全基因组测序在常规监测实验室均可实现,也催生了细菌性传染病领域一个新的学科——基因组流行病学,以深入分析和解决传统流行病学和实验室手段不能解决的问题。中国疾病预防控制中心传染病预防控制所、传染病预防控制国家重点实验室徐建国院士、阚飙研究...
我国科学家牵头 拟对全球微生物基因组进行全测序
新华社北京10月12日电(记者董瑞丰)由我国科学家牵头的全球微生物模式菌株基因组和微生物组测序合作计划12日在北京正式启动,预计于5年内完成超过1万种微生物模式菌株基因组测序、超过1000个微生物组样本测序。该计划由世界微生物数据中心和中国科学院微生物研究所牵头,联合美国、德国、日本等共12个国家的微生物资...
Illumina和生物梅里埃合作推出首个进行细菌性感染的全基因组测序...
近日,Illumina公司和生物梅里埃公司(bioMerieux)就通过联合研究推出了一项全基因组测序服务,目的在于改善医源性感染的控制和流行病学的监测。抵御抗生素耐药性意味着临床医生们需要小型工具来鉴别出哪种感染是细菌性的,以及引发感染的细菌种类,同时还要揭示出这些细菌对于多种抗生素是否是敏感性的。近日,Illumina公司和生物...