AlphaFold3重磅开源,诺奖级AI颠覆世界!GitHub斩获1.8k星,本地即可...
AlphaFold项目的负责人Jumper最喜欢的一个AlphaFold2创新,是一个团队使用该工具识别出一种帮助精子附着在卵细胞上的关键蛋白。Jumper迫不及待地想看到在分享AlphaFold3后出现这样的惊喜。安装和运行安装AlphaFold3需要一台运行Linux的机器;AlphaFold3不支持其他操作系统。完整安装需要多达1TB的磁盘空间来存储基因数据库...
AlphaFold3开源了,诺奖AI工具人人可用,开启生物分子设计新时代
AlphaFold2的开源特性引发了其他科学家的大量创新。例如,最近一次蛋白质设计大赛的获胜者使用人工智能工具设计了能够结合癌症靶标的新蛋白质。Jumper最喜欢的AlphaFold2破解工具来自一个团队,该团队使用该工具识别了一种帮助精子附着在卵细胞上的关键蛋白质。在分享了AlphaFold3之后,Jumper迫不及待地想看到这样...
AlphaFold3 开源,任何人可下载使用,加速药物研发
在开源了AlphaFold3之后,DeepMindAlphaFold团队负责人JohnJumper非常期待人们用这个技术能做些什么。AlphaFold2于2021年公开发布,它促进了蛋白质工程的进步,帮助设计新的结合蛋白并揭示与疾病相关的蛋白质的机制。这一成功为AlphaFold3设定了期望,研究人员预计它将有各种新应用,从针对癌症的蛋白质设计到...
AlphaFold的含金量继续提升!颠覆传统认知,揭开精子-卵子成功结合...
AlphaFold从诞生到获得诺贝尔奖仅仅只有4年时间,2020年,DeepMind推出了基于人工智能(AI)的蛋白质结构预测工具——AlphaFold,2021年7月,DeepMind团队推出了AlphaFold2,其能够根据氨基酸序列来准确预测蛋白质的三维结构,但其对蛋白质复合物结构预测的效果不佳。2021年10月,DeepMind团队进一步推出了AlphaFold-Multimer,用于预测...
诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI
首先,作为AlphaFold2开发的一部分,这个AI模型已经在所有已知的氨基酸序列和已确定的蛋白质结构上进行了训练。工作流程分为四个主要步骤:1.数据录入和数据库搜索将一个结构未知的氨基酸序列输入AlphaFold2。系统会搜索数据库中类似的氨基酸序列和蛋白质结构。
2024年诺贝尔化学奖揭晓,AlphaFold开发者和David Baker斩获诺奖
目前,AlphaFold2系统在许多生物医学领域及相关领域产生了巨大的影响,通过应用AlphaFold2,研究人员重新设计了针对人类细胞的蛋白质,开辟了药物输送和基因治疗的新途径,学术实验室和公司正在利用AlphaFold2开发疫苗、设计药物、制造分解污染物的酶等,前景一片光明(www.e993.com)2024年11月15日。参考资料:AlphaFold—forpredictingproteinstructures.Laske...
AlphaFold3开源了!所有人均可下载代码,有望颠覆当前药物研发模式
AlphaFold2的开源,引发了科学家们大量创新。例如,今年8月份,蛋白质工程师AlexNaka利用他的笔记本电脑和大约80个基于云计算的AI处理器,设计了几十种蛋白质,这些蛋白质旨在靶向抑制肿瘤中发生突变的受体——EGFR(表皮生长因子受体),他选出了其中最有前景的10种设计,参加了一项新发起的蛋白质设计竞赛,并登上了排...
AI+Science新视野:用物理信息引导AlphaFold 2预测蛋白质动力学
1.基于AlphaFold2的蛋白质结构预测近年来,随着人工智能(AI)技术的发展,基于序列的蛋白质结构预测问题取得了许多重要的突破。其中,由DeepMind开发的AlphaFold2(以下简称为AF2),被誉为AI领域的一项革命性进展,在部分蛋白质的结构预测任务中,其对天然态三维静态结构预测的准确性逼近实验结果[1]。
不只是 AlphaFold,一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
不可否认的是,AlphaFold2改变了生物学家研究蛋白质的方式。然而,虽然AlphaFold2是一个强大的预测工具,但它并不是一个无所不知的机器。它非常巧妙地解决了蛋白质折叠问题的一部分,但不是以科学家的方式解决的。它并没有取代生物实验,而是强调了生物实验的必要性。
周耀旗看“后AlphaFold 2时代”:进展不断,新革命还在远方
例如,在蛋白质结构预测方面,AlphaFold3跟AlphaFold2一样,如果天然同源序列不多的话,预测结构的准确度会大幅度下降,因为深度学习严重依赖天然同源序列里面的进化和共进化信息来获取蛋白质主链的走向和氨基酸之间的距离。最近,我们团队正致力于用高通量实验方法来产生人工的同源序列蛋白质来代替天然同源序列,在BioRxiv预印...