iMeta|生信分析技术类文章合集

生信宝典2023年6月15日12:00北京iMeta微生物组分析技术类文章合集自iMeta发行以来,已发表分析技术类文章31篇,包括imageGP、MajorbioCloud、Sangerbox、ComplexHeatmap、iNAP、MetOrigin、ggClusterNet和Parallel-MetaSuite等高被引工具和在线分析平台。免责声明本文来自腾讯新闻客户端创作者,不代表腾讯新闻的观...

太卷?纯生信分析类文章不好发怎么破?

??首先,对于生信的分析不要流于表面,要找到重要的问题。如果是要寻找marker或predictor,让AUC和准确性(accuracy)尽可能的高。如果是要寻找target,需要通过多种方法论证其因果性(比如CNV和mutation)。一般来说,同一篇文章里不要试图同时做这两件事(只做了相关性分析,并没有揭示内在的机制,号称自己的可以作为靶点,...

这篇6+文章告诉你m6A生信分析还能这么做!

选择一个miRNA-m6A调因子-m6A靶基因通路初步验证为了确定生物信息学分析的结果的可靠性,作者首先检测了三个选定的m6A调控因子(VIRMA、IGF2BP1和HNRNPA2B1)在OC组织中的表达。PCR和IHC检测结果显示,与low-stageOC组织相比,high-stageOC组织中VIRMA和IGF2BP1表达下调,而与low-stageOC组织相比,HNRNPA2B1中HNRNPA2...

掌握单细胞测序生信分析,用 R 语言挖掘数据发高分文章!

课程可以帮助你了解生信,知道二代测序,掌握多组学基本概念;理解单细胞转录组的测序本质,并了解到单细胞技术的未来突破方向;掌握8个单细胞领域的优质数据库使用并能自己下载数据完成全套的分析;掌握单细胞领域的课题设计的技巧,并收获5个数据挖掘思路;掌握如何分三步完成一篇数据挖掘的文章。图源:课程制作图片...

数据不够?生信分析帮你凑!学会深度挖掘快速发文章

图片来源:文献3.机器学习R语言能够使用机器学习的方法完整地构建预测模型,能够很好地完成特征选择、建模、模型测试以及预测效果的评价。4.数据挖掘与生物信息学R语言是数据挖掘神器,可以很快从GEO,TCGA等数据库里提取到想要的数据,还能进一步寻找、分析差异基因,进行相关研究。

【生殖学】duang!生信分析文章的小小套路

通过对此文的解读,我们可理出这篇传统实验结合生信分析文章的研究方法如下:1.以活检法从不孕妇女身上抽取少许子宫内膜组织,再从子宫内膜组织分离内膜基质细胞和上皮细胞后培养(www.e993.com)2024年11月26日。2.抽取内膜基质和上皮细胞的RNA,做RT-PCR鉴定。3.用RIsearch-2.0软件预测lncRNA和mRNA之间的相互作用。

生信宝典:生物信息分析作图 - R、网络图及文章图形排版

活动发起人活动组织者系中科院遗传所生物信息专业多名毕业博士骆观正(中山教授,Cell、NCB一作)、陈同(CellStemCell长城封面一作)、刘永鑫(生信宝典、宏基因组主编)代表性系列教程总结R统计和作图Cytoscape网络图Python学习5000+3000+1000+...

想发“肿瘤预后”纯生信文章?真不难!这篇9+文章给您思路,复制性极强

方法:首先,研究者收集了治疗前和治疗早期患者的血浆样品,并使用ELISA多重阵列具体分析血浆样品中的蛋白质组情况;接着,收集患者的蛋白质组学和临床数据,作为机器学习分析的数据集,提取响应治疗的预测特征;最后,采用生物信息学分析法对蛋白质组进行表征分析,深入了解治疗反应和耐药机制。

10文聚焦:值得关注的菌群生信分析新方法+新工具|热心肠日报

12月21日的《热心肠日报》,我们解读了10篇文献,关注:生信,宏基因组,MAG,分析工具,数据库,CRISPR,病毒,酶,产SCFA菌,代谢组,可视化。香港大学:纳米孔宏基因组学助力恢复高质量基因组Microbiome——[16.837]①借助纳米孔测序开发出NanoPhase,可从宏基因组中重建完整和高质量MAGs,探索其代谢潜力;②使用Zymo...

外泌体实验如何开展?这篇11分文章教您深入浅出玩转外泌体!

上述的生信分析和验证是确定了研究的主角分子。一般筛选做到上述内容已经比较完整,但是除此之外作者还发现circTRPS1表达水平与膀胱癌患者总体存活率呈负相关。检测了尿源性外泌体中不同膀胱癌临床阶段的circTRPS1表达水平,发现circTRPS1可以作为诊断膀胱癌进展的临床标志物。这两个部分的内容为整体人体样本的内容增色不...