国内首个!《动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...

微生物高通量测序(High-throughputSequencing,HTS)方法主要包括全基因组测序、宏基因组测序、靶向测序。其中,宏基因组高通量测序技术不依赖于传统的微生物培养,无需特异性扩增,直接对临床样品中的核酸进行高通量测序,通过与数据库进行比对分析,根据比对到的序列信息来判断样品包含的病原微生物种类,能够快速、客观地检...

国内抑郁患者近亿,高学历男性死亡率更高 | 科技周览

信息读取使用便携式纳米孔测序仪,实现了对DNA模板上复杂表观比特信息的高通量读取,并通过单次超240种不同修饰模式的并行解析,无损还原了原始数据。实验结果验证了该创新型分子存储技术的可行性和准确性,还展示了表观比特的稳定性。大规模表观比特DNA存储和读取结果分析。|PKUCQB值得关注的是,新研究还展示了这项...

指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

纳米孔测序是将单分子检测和电流信号传导相结合的测序方法,测序原理上摆脱了NGS的洗脱和PCR扩增(边合成边测序)过程,通过连接接头的马达蛋白将双链核酸解开,在电场力的驱动下使单链核酸分子穿过纳米蛋白孔道,由于不同的碱基通过纳米孔道时会产生不同阻断程度的电流信号,测序仪通过记录电流信号的变化,就可推导出碱基信息...

江南大学杨瑞金教授等:Bifidobacterium pseudolongum JNFEN6低聚...

乙酸含量的升高与双歧杆菌独特的代谢途径有关,该代谢能够产生乙酸而不产生气体,以此提高碳的转化率。3细胞形态及木糖苷酶活性分析通过透射电子显微镜对不同碳源培养条件下菌体形态进行观察,如图3所示,在XOS碳源培养基和葡萄糖碳源培养基上生长的菌株细胞膜、细胞壁均保持完整。细胞为椭圆状,边缘光滑完整,无运动性,...

cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量

同样,AselLubotzky等人招募了65名健康供体、85名局部癌症(非肝脏)患者、55名非肝脏转移性癌症患者和63名有肝脏转移的癌症患者,以验证基于cfDNAPCR测序分析的检测方法在区分肝脏转移方面的表现。结果表明,通过这种方法检测到的肝细胞的AUC浓度为0.81(95%置信区间=0.74–0.87,P=0.0001)。肝脏转移检测的特异性和灵敏...

牛津纳米孔公司报告纳米孔蛋白测序关键概念验证结果

ONT公司在去年IPO时把蛋白测序定为其长期发展的目标之一，意味着未来五到十年会重点发展的方向(www.e993.com)2024年11月3日。然而，最近ONT公司明显在蛋白测序方面更加活跃，过去一段时间内发布了不少跟蛋白测序开发相关的职位，此次Clive在主场展示其重要验证结果，可见ONT在蛋白测序上明显提速了。注：ONT此次更新蛋白测序，打得有点意外，似乎为了...

单细胞转录组测序助力解析小鼠不同器官γ δ T细胞异质性图谱

以上结果表明,Gzma+γδT细胞可能是先于Ifng+γδT细胞和Il17a+γδT细胞存在的一类早期γδT细胞。5.基于单细胞ATAC测序探究组织特异性的γδT细胞染色质可及性图谱Figure5.基于单细胞ATAC测序分析γδT图谱特征由于高通量单细胞转录组在检测低丰度基因包括转录因子上的不足,而开放区染色...

转录组测序结果qpcr验证

转录组测序结果qpcr验证启因生物转录组测序的研究对象为特定组织细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于基础...

关于病原体宏基因组高通量测序产品的几点考虑

因此即使在检测结果中某种胞内菌/厚壁菌检出序列数不高,也要考虑其为致病病原体的可能。mNGS信息量大,临床应用过程中,检验机构依据检测结果出具检验报告时,有些情况下不可能在结果中列举出所有检测到的病原体,对于罕见病原体、胞内菌等,可能因检出序列数少、微生物丰度低,在报告中未能列举,如果临床有疑似特殊病...

Cancer Cell | 血小板 RNA 测序有望用于泛肿瘤早筛

本研究基于TEPRNA的血液检测,利用算法检测能够识别出多达18种癌症类型,且具有较高的检测准确性。但泛癌种算法的持续优化仍需要通过不断扩充血小板RNA样本量进行验证;由于非癌症有症状对照组中的高假阳性率结果,使得算法的运用人群和领域受限。此外,还需要考虑包括患者临床信息在内的多方面混杂因素的影响,需...