Nature:揭示古老基因入侵者在人类机体DNA中栖息的分子机制
然而,当细胞中的LINE-1被激活时,其就好像一种病毒模拟物,其能制造出RNA:DNA杂交体,当被感知时其看起来就像病毒感染一样,这种病毒模拟过程就为阐明ORF2p如何激活机体的先天性免疫系统,从而诱发自身免疫性疾病等疾病的发生提供了一种可能性的解决方案。研究者发现,与细胞质中的遗传物质相互作用或能激活cGAS/STING...
全RNA介导的精准基因写入技术!Cell:我国科学家开创基于逆转录病毒...
长期以来,高效准确地在基因组中插入基因大小的DNA片段,一直是基因编辑领域的难题。目前的技术主要依赖DNA模板作为基因整合的供体。然而,DNA供体在实际生物医学应用中面临诸多挑战,如高免疫原性、递送障碍以及随机整合的风险。相比之下,RNA供体则展现出明显优势,低免疫原性、易于非病毒载体递送,并且其能在细胞内迅...
专访清华大学刘俊杰:为基因编辑做减法,无需蛋白质的基于RNA核酶的...
刘俊杰团队对公开可用的细菌基因组序列进行初步筛选,发现许多缺乏ORF的GII-C型内含子,其中一些还在细菌基因组中存在多个拷贝,这表明,这些内含子编码的为唯一组分——RNA分子,可能在不依赖蛋白质的情况下仍然具有扩增位点识别和切割DNA的能力,从而通过“复制-粘贴”机制在基因组中进行拷贝扩增。不含蛋白组分的GII内含子...
《iMeta》综述 | 多组学在肿瘤微生物研究中的应用
DNA、RNA和组蛋白的共修饰是调控特定基因激活和抑制的关键机制。表观遗传调控在研究与人类疾病特别是癌症密切相关的DNA复制、转录和损伤修复过程中起重要的调控作用。DNA甲基化在不改变基因序列的情况下调控转录,而肿瘤抑制相关基因表达的关闭会导致肿瘤的发生。大量研究表明DNA异常甲基化与多种肿瘤的发生发展密切相关,...
新应用 │ 国自然新热点:R-loop CUT&Tag实验指南
部分高GC的DNA-RNA杂交体对RNaseH具有抗性,因此阴性对照的信号可能不会完全消失。图3.RNaseH消化R-loop的CUT&Tag阴性对照[3]区别二:转座后的产物目标蛋白结合的双链DNA被Tn5转座后得到的是含有接头序列的双链DNA;S9.6结合的DNA:RNA杂合链被Tn5转座后得到的则是含有接头序列的DNA:RNA杂合链和双链DNA(...
国自然撰写:经典分子机制研究(一)|位点|质粒|扩增|dna|rna|聚合酶...
结果显示,加入转录因子A抗体后可以特异地沉淀基因组DNA,通过PCR反应可以特异性扩增出基因B启动子上的目的片段,而加入IgG的阴性对照未扩增出相应条带(www.e993.com)2024年7月24日。ChIP实验结果在体内证实了转录因子A与基因B启动子区的结合。同时我们也发现在基因B高表达的cell-1细胞中转录因子A结合到基因B启动...
TCR候选药物的发现及其安全性和有效性
在由体细胞突变和转化肿瘤病毒产生的表位的情况下,off-tumor毒性风险被降至最低,因为正常组织不表达这些蛋白质。对于其他抗原类别,可以使用公开可用的转录组和蛋白质组数据库进行表达的初步评估。RNA-seq具有高敏感性、高特异性和大的动态范围。RNA-seq数据库,例如GTEx,提供了来自多个正常组织的高质量测序结果。人类...
疫苗前沿 | NMPA最新发文:mRNA疫苗质量控制研究进展
在体外转录和mRNA制备过程中产生不同结构和长度的dsRNA。此外,saRNA疫苗在体内复制,使得靶mRNA序列也会在体内形成dsRNA结构。这种情况导致先天免疫反应的激活,这可能与线性mRNA疫苗不同。因此,saRNA疫苗中残留dsRNA的质量标准可能与线性mRNA疫苗不同,需要进一步研究。与线性mRNA疫苗一样,应进行残留T7RNA聚合酶的质量控制...
三花猫、蜜蜂,荷兰大饥荒……揭秘基因表达的“出牌套路”
在微观尺度,主要有三个因素来调控染色质结构,从而改变基因表达。它们分别是,DNA甲基化修饰、组蛋白修饰以及非编码RNA。这是表观遗传影响个体表型最为重要的三种机制。三者共同决定染色质的结构,进而影响基因的表达。DNA甲基化修饰DNA甲基化(DNAMethylation)修饰,是目前被人们研究得较为充分的表观遗传机制。
Cell封面 | 张余研究组合作解析了叶绿体基因转录机器构造
2024年3月1日(北京时间),中国科学院分子植物科学卓越创新中心张余团队和华中农业大学周菲团队合作在Cell上以“Cryo-EMstructuresoftheplantplastid-encodedRNApolymerase”为题发表了封面研究论文。研究团队基于叶绿体转化技术,成功建立了烟草叶片中纯化内源PEP的方法,解析了叶绿体RNA聚合酶PEP复合物和PEP转录延伸...