云南农业大学王雪峰副教授等:辣木籽ACE抑制肽的分离纯化、结构鉴定
通过对吸收峰面积变化计算蛋白质二级结构相对含量,得出该肽由22.8%α-螺旋、33.3%β-折叠和43.9%β-转角构成。研究发现,通常肽二级结构中β-转角中含有较多的氢键是较有序、规则的结构,表明肽QGPRPQ结构较为稳定。06肽QGPRPQ的酶抑制动力学分析通过Lineweaver-Burk双倒数图探究肽QGPRPQ抑制ACE的动力学模式。...
本期荐读丨李旭等:锦鲤浮肿病毒热休克蛋白的生物信息学分析
对蛋白质结构的研究无法避免对其结构域的预测,因为结构域也是蛋白质的重要组成部分,在较大蛋白质分子的比较中尤为常见。可以使用SMART软件进行HSP70结构域的在线预测,以此确定其空间结构。2结果2.1CEVHSP70的理化性质通过软件EXPASYproparam对HSP70的理化性质进行分析,推测出HSP70的氨基酸为614...
FSAP|海南大学于志鹏教授:基于虚拟筛选和分子对接鉴定鸡蛋蛋白源...
采用ExPASyPeptideCutter(httpweb.expasy/peptide_cutter/)对鸡蛋蛋白进行虚拟酶解,并且通过peptidepropertycalculator(httpinnovagen/proteomics-tool)对得到的肽序列进行水溶性、生物活性以及毒性预测(见表1),筛选出来的水溶性好、生物活性好以及无毒性的肽序列。表1蛋清蛋白活性肽活性...
这11 个可以预测蛋白质结构的网站,通通都安利给你!
蛋白质三级结构预测1.同源建模(SWISS-MODEL)蛋白质结构同源模建(又称同源模拟、同源建模)的理论基础是蛋白质的三级结构比蛋白质的一级结构更为保守。2.折叠识别基本原理:从蛋白质结构数据库中识别与待测序列具有相似折叠类型,进而实现对待测序列的空间结构预测。自然界中蛋白质折叠类型的数目是有限的,许多...
联合科研团队:2019新型冠状病毒所有关键蛋白质同源模建结果和方法...
蛋白质同源建模是指当未知结构的蛋白和已知结构的蛋白质在一级序列上比较相似的时候,可以把已知结构的蛋白作为模板,通过计算机的模拟和计算,基于未知结构蛋白的一级序列预测其三维空间结构。同源建模基于两个假设:1.蛋白质的结构由其氨基酸序列唯一决定,如果已经知道一级序列,在理论上就可以获取其二级结构以及三级结构...
Dr. X 亲测 AlphaFold 2 :浅谈蛋白结构预测原理及应用拓展
蛋白质高级结构预测的方法蛋白质结构预测的方法可根据有无参考序列大致分成模板依赖(Templatedependent)和非模板依赖(Templateindependent)两大思路,常用的同源建模(Homologyconstruction)方法就属于前者,该法简便易用,但精确度由与参考蛋白的同源程度决定,影响较大(www.e993.com)2024年7月25日。Swiss-model是较为常用的全自动在线工具。
基因研究笔记|可视化|蛋白|分析工具_新浪新闻
通过在线分析工具SWISS-MODEL(httpsswissmodel.expasy/interactive)进行三级结构预测分析。蛋白二级结构预测-CFSSP蛋白二级结构预测-SOPMA蛋白二级结构预测-PredictProtein蛋白三级结构预测-SWISS-MODEL蛋白特性分析是指蛋白的一些物理和化学参数,如分子量、等电点、氨基酸和原子组成、消光系数、半衰期、不稳定...
错失诺奖,只因太听大牛的话丨病毒超话
Stanley认为,烟叶上的滤过性病原体可能是一种蛋白质分子,并首先通过X射线衍射观察到了从病叶榨汁中分离出的病毒晶体(其实最清晰的烟草花叶病毒X射线衍射图像是由发现DNA双螺旋结构的RosalindFranklin获得的,这位女科学家简直非同小可),同时了解到这个晶体当中还含有核酸成分,这一发现为他赢得了1946年的诺贝尔化学奖。
生物信息学必备网站大全
Brutlag生物信息学研究组是斯坦福大学的一个研究团体,主要研究从蛋白质一级结构预测蛋白质结构和功能,其开发了EMOTIF、EMATRIX和3MOTIF软件应用于非鉴定的基因组序列的功能确定,另外还开发了LOCK和3DSEARCH软件用于比较蛋白质结构和蛋白质结构数据库的搜索。生物GBF信息学小组主页:httptransfac.gbf.de/生物信息学...
来一场蛋白与蛋白间的“风花雪月”
OsFD1与拟南芥FD是功能相似的蛋白,可能是OsMADS15的转录因子。如下图,进行转录水平分析时发现,单独存在Hd3a和OsFD1都无法激活OsMADS15的表达,只有两者共存时才可以。图1Hd3a和OsFD1调控OsMADS15表达水平。实验二:GSTpull-down结果表明(图2),Hd3a与GF14c(也叫14-3-3c)互作,GF14c与OsFD1互作,Hd3a...