...集美大学黄琪琳教授等:鲢鱼糜漂洗液中不同回收方式肌浆蛋白的...
由表2可知,6种提取方式的肌浆蛋白均含有所测得的16种氨基酸,除CP之外,其余5种提取方式回收的肌浆蛋白所含必需氨基酸含量丰富,在总氨基酸中的占比为41.25%~42.69%,均符合联合国粮农组织/世界卫生组织的理想模式推荐的比例(必需氨基酸/总氨基酸比值为40%),是理想的优质蛋白。CP的总氨基酸质量分数仅为51.52%,...
AI面临的五个蛋白质设计问题,Nature找了一群专家来讨论
蛋白质-蛋白质结合算法之所以成功,是因为它们的语言很简单:所有天然蛋白质都由相同的20种氨基酸组成。马萨诸塞州萨默维尔的GenerateBiomedicines公司使用AI设计疗法,其计算机科学家JohnIngraham表示,PDB中有数十万种结构和蛋白质-蛋白质相互作用,「这就像是机器学习的理想情况」。科学家们一直在研究...
因为一个“很难,很重要的问题”,我从计算机转向研究蛋白质
蛋白质由很多氨基酸通过化学键串在一起。这里我用一些小球去表示这些氨基酸,每种颜色的小球表示一种氨基酸。从数学角度,你也可以用一个字符串去表示一个蛋白质的氨基酸序列。每个氨基酸都是由几十个原子形成的,在这页幻灯片的下半部分,我画了一些原子结构,大家可以对蛋白质的分子式有一个直观的认识。现在我们只要知...
他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事
拿一个由300个氨基酸组成的蛋白质来说,以前的预测方法每次只关注某几个位置的氨基酸信息,比如第一个氨基酸、第十个氨基酸或者第一百个氨基酸;也可能只关注某一个局部区域,比如第20个到第30个氨基酸……总之,关注的都是一些局部信息。许锦波的想法是,一定要让AI把从第1到第300个氨基酸的全局信息全用上,当然,难...
他们用AI破译蛋白质结构“密码”
该模型能测试拥有不同结构元素的设计组合,并从头开始产生蛋白质。该模型还能执行不同的任务,设计氨基酸、寡聚体(多亚基聚体)、有治疗或工业应用前景的复杂结构。精准预测蛋白质结构在蛋白质的世界里,氨基酸以长链的形式相连,折叠成复杂的三维结构,赋予蛋白质重要功能。自20世纪70年代以来,科学家一直致力于根据...
他们用AI破译了蛋白质复杂结构的密码!解读2024年诺贝尔化学奖
蛋白质通常由20种不同的氨基酸组成,这些氨基酸如同组成生命的“积木”(www.e993.com)2024年11月20日。2003年,贝克利用“积木”,成功创造出一种前所未有的新蛋白质,开启了构建全新蛋白质的大门。此后,贝克的研究小组不断发挥创意,创造出一系列富有想象力的蛋白质。这些蛋白质正在药物、疫苗、纳米材料和微型传感器等多个领域“大展拳脚”...
诺贝尔化学奖揭晓!国际象棋AI大师破解了蛋白质的密码
答案是蛋白质的存在,蛋白质可以说是一种出色的化学工具。它们通常由20种氨基酸组成,可以以无数种方式组合。利用DNA中存储的信息作为蓝图,氨基酸在我们的细胞中连接在一起形成长链。然后,蛋白质的神奇之处就出现了:氨基酸链扭曲并折叠成独特的(有时是独一无二的)三维结构。正是这种结构赋予蛋白质功能。
为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?
蛋白质通常由20种不同的氨基酸组成,可以说是生命的基石。天然蛋白质的范围是有限的。为了增加获得具有全新功能的蛋白质的可能性,贝克的研究小组想从零开始创造它们。上世纪90年代末,戴维·贝克开始开发能够预测蛋白质结构的计算机软件:罗塞塔(Rosetta)。贝克所说,“如果你想造一架飞机,你不能从改造一只鸟...
人工智能又“赢”了,专家解读:2024诺贝尔化学奖为何颁给蛋白质的...
蛋白质结构预测和设计是什么?想要搞清楚这些,需要先认识一下蛋白质这条“珍珠项链”。据估计,人体内至少存在2万种不同类型的蛋白质,这些蛋白质的结构和功能千差万别。张贵军说:“蛋白质是由20中不同种类的氨基酸组成的长链,如同由20种不同形状的珍珠串成的‘项链’。然而,其神奇之处在于这串‘珍珠项链’可以...
AI精准预测蛋白质结构,结构生物学何去何从?颜宁等人点评
2020年第14届国际蛋白质结构预测竞赛(CASP14)共有84个常规(Regular)题目,其中有14个题目因为生物实验没给出确定结构等原因被取消或延缓,其他70个题目的单体和复合物蛋白质所含有的氨基酸个数从73到2180不等。19个国家的215个小组参加了CASP14。最终,谷歌旗下DeepMind公司的人工智能系统AlphaFold2在2018年的Alphafol...