科学家基于AI构建蛋白质组时钟,为预测衰老和治疗疾病提供新工具

机器学习相比于传统统计方法所依赖的严格假设，能够捕捉非线性关系、蛋白质间的相互作用关系等生物学特性。其已开始在疾病早期诊断和标志物识别等领域发挥作用，特别是在处理高维度复杂数据时表现出色。这使机器学习在构建包括癌症、阿尔茨海默病等多种疾病的早期筛查模型中展现出优势，尤其是在面对大量数据（如数千个蛋...

更有效地解析和设计蛋白质

比如说我们可以设计出一种和某种毒药分子发生作用会发光的蛋白质,然后利用它进行毒药检测;还可以设计其他功能,比如说设计疫苗。既然现在已经预测了自然界所有的蛋白质,我们就可以直接去数据库里查找对某种特定功能有帮助的结构。AlphaFold2出现仅仅4年时间,现在世界上已经有190多个国家的200多万个科学家都在使用这个工具...

科学家基于AI构建蛋白质组年龄时钟,发现衰老与18种疾病风险密切...

机器学习相比于传统统计方法所依赖的严格假设,能够捕捉非线性关系、蛋白质间的相互作用关系等生物学特性。其已开始在疾病早期诊断和标志物识别等领域发挥作用,特别是在处理高维度复杂数据时表现出色。这使机器学习在构建包括癌症、阿尔茨海默病等多种疾病的早期筛查模型中展现出优势,尤其是在面对大量数据(如数千个蛋白...

中国科学技术大学结合计算预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标...

在该研究成果中,作者先用基于二氢叶酸还原酶的蛋白质互补分析体系来高效检测无序片段间的相互作用,系统研究了位点突变和截短对互作的影响,发现实验结果与AlphaFold2预测的α/β型复合物结构模型吻合;作者进一步用蛋白质序列设计深度学习模型ABACUS-R基于结构设计了多个突变体,成功获得一个突变体的晶体并解析了其结构。...

...垂青AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质...

他的研究重点是蛋白质结构的预测和设计、蛋白质折叠机制、蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-核苷酸相互作用以及蛋白质-配体相互作用。他通过实验来理解这些问题背后的基本原理,并基于这些见解开发简单的计算模型,还通过结构预测和设计来测试模型。近年来,Baker团队开发了可用于蛋白质结构预测的RoseTTAFold,该算法已扩展到...

MST 技术又添高光时刻:多元互作检测的 “黑神话”

Monolith系列分子互作仪器无需固定蛋白,可以在溶液中表征多元互作,有利于多元分子平衡,实验操作简洁高效,可获得更加准确的亲和力检测结果(www.e993.com)2024年11月3日。MonolithX分子互作仪「轻松、快速、精准检测分子间相互作用」????双技术模块:光谱位移(SpectralShift)和微量热泳动(MST),可灵活升级????无需固定样品:可直接...

Sci Adv丨核内RNA的时空定位:剪切效率的新视角

作者首先利用了芝加哥大学何川组近期研发的用于检测与RNA结合蛋白相互作用的RNA测序方法——ARTR-seq(reversetranscription–basedRNAbindingproteinbindingsitessequencing)。该方法基于原位逆转录,利用核斑体的标志蛋白SON的抗体富集逆转录酶,从而对核斑体内的RNA进行测序。通过将测序结果与未使用一抗的对照组比较...

中国科大在听力系统耳毛细胞静纤毛发育分子机制研究中取得新进展

研究团队首先研究了Gpsm2-Gαi复合物介导的蛋白相互作用网络的分子机制,揭示了Gpsm2-Whirlin复合物的详细相互作用机理和三维结构基础(图1)。研究发现Whirlin通过一段保守的多肽序列GBD(Gpsm2bindingdomain)结合Gpsm2的TPR结构域(图1)。图1.Gpsm2-Whirlin复合物的三维结构...

中药单体发9分+: 浙大儿院基于多组学和网络药理学揭示石杉碱甲...

通过网络药理学寻找HupA和DN靶点蛋白的交集,作者发现了33个共同靶点,并用于进一步分析。为了进一步探索HupA与DN靶蛋白之间的相互作用,作者将获得的33个共同靶点导入STRING数据库,构建包含33个节点和145条边的PPI网络。结果表明,凋亡相关蛋白(Bax、Bcl-2和Caspase3)可能是DN的潜在靶点。基于11种算法的网络模型拓扑分...

分子互作|蛋白与蛋白、核酸、小分子互作检测技术介绍、应用及资料...

1、确定两种蛋白是否有相互作用,一般在后面接WB实验;2、确定两个蛋白的结合的结构域或者位点,一般结合片段截短或者突变实验;??相关资料03Biacore??原理Biacore技术是一种基于表面等离子共振(SPR)原理检测生物分子相互作用的技术,可以用来检测蛋白和蛋白,蛋白和核酸,蛋白和小分子,抗原和抗体等之间的相互作...