国内首个!《动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...

NGS以DNA纳米球测序和边合成边测序技术为主,测序数据量大,准确性高,测序成本低,但测序读长较短,拼接复杂、长基因组时较困难;TGS以纳米孔测序和单分子荧光信号测序两种技术为主,测序读长长,可拼接长基因组序列,但数据产出量较低,准确性较低、测序成本较高,可实时产出数据,设备可便携[2]。各实验室可根据自身测...

专家共识丨动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...

NGS以DNA纳米球测序和边合成边测序技术为主,测序数据量大,准确性高,测序成本低,但测序读长较短,拼接复杂、长基因组时较困难;TGS以纳米孔测序和单分子荧光信号测序两种技术为主,测序读长长,可拼接长基因组序列,但数据产出量较低,准确性较低、测序成本较高,可实时产出数据,设备可便携。各实验室可根据自身测序样品...

NAR | 最全植物基因组数据平台 IMP中文教程( 核基因组更新到 1000...

IMP针对收录的数据提供了10个功能分析模块,示例性结果如下图,包括多基因表达图谱的绘制、共表达基因的搜寻和鉴定、基因簇的展示、BLAST序列搜索、多序列比对、在线差异基因分析(样品相关性热图、差异基因热图和火山图)、GO/KEGG富集分析、GSEA富集分析、IGV基因组浏览器展示、引物设计、序列提取等。IMP数据...

CRISPR后基因编辑底盘工具开发成功。海藻提取物作用机理有新发现

1月31日消息，人们对海藻源植物用生物刺激素作用机理的认识存在一个常见的误区，认为海藻提取物依靠其含有的植物激素成分发挥作物。但近期的研究显示，海藻提取物中天然的糖类、多酚类等物质才是此类产品发挥功效的活性成分，这些物质能够刺激植物天然的生理机能，以此改善植物的生长、产量、品质和抗逆能力。为了扫除这...

中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生

2006年，下一代测序技术（二代测序）首次应用于16SrRNA基因扩增子测序。虽然下一代测序技术只能检测最多600bp左右长的16SrRNA基因序列，但它对能够检测的基因数量提高了几个数量级，由于细菌菌群中存在大量细菌，因此通量的提升对于细菌菌群的分析至关重要。此外，使用下一代测序技术后无需再做DNA克隆，简化了16S...

Science经典:植物基因组的同线性与共线性分析思路

全基因组测序的应用使我们能够使用统一的理论框架来分析不同物种的进化关系,尤其是染色体的对应关系(www.e993.com)2024年11月10日。在被子植物中,同线性和古多倍化分析密切相关,因为被子植物的比较基因组学分析必须考虑到基因组复制和分散分布的影响。以拟南芥为例,它经历了三次古多倍化事件(2次二倍化和1次三倍化),导致祖先染色体组产生了12个拷...

...医科大学王建昌正高级兽医师等:基于行业标准中马和驴成分检测...

结果如图2所示,对于马成分检测,以驴基因组DNA作为阴性对照,未见扩增曲线,以马基因组DNA作为阳性对照,出现特异性扩增曲线;对于驴成分检测,以马基因组DNA作为阴性对照,未见扩增曲线,以驴基因组DNA作为阳性对照,出现特异性扩增曲线。对9份样品分别进行马、驴成分检测,结果显示,样品H1～H3、L1～L3均检出马成分,且Ct...

考古2023|科技考古:科技赋能,考古新知

2023年,科技考古学界围绕百万年人类史、一万年文化史与五千多年文明史,发表了一系列精彩的论述,成果丰硕。其中,既有围绕某一问题开展的多视角研究,比如植物考古、动物考古、同位素、古DNA等多个领域学者发文讨论史前与早期历史石器粟作农业人群沿半月形地带四向扩散的过程与影响,又有新技术、新思路支撑下的创新性认识...

iMeta | 东北林业大学冯富娟组发现丛枝菌根真菌诱导削弱镉的迁移

根际土壤细菌基因组DNA的提取和PCR扩增采用CTAB法对样品的基因组DNA进行提取,之后使用琼脂糖凝胶电泳检测提取出的DNA纯度和浓度;随后取适量DNA于离心管中,并用无菌水稀释至1ng/μl。以稀释后的基因组DNA为模板,根据扩增区域选择使用带barcode的特异性引物、High-FidelityPCRMasterMixwithGCBuffer(NewEnglan...

深圳华大智造科技股份有限公司2023年年度报告摘要

MGIEasy植物基因组DNA提取试剂套装,能够获取高纯度、高得率和完整性好的高质量植物样本中的DNA,同时适配不同通量的自动化核酸提取设备,最快可在35min内完成384个样本提取,可搭配高通量自动化核酸提取系统MGISP-NE384和高通量自动化样本制备系统MGISP-960。