研究提出蛋白质变构路径预测的深度学习模型
近日,中国科学技术大学物理系汪骞课题组和上海科技大学免疫化学研究所白芳课题组合作,提出了蛋白质变构路径预测的深度学习模型。该成果在线发表于《先进科学》。?近年来,以AlphaFold为代表的深度学习模型在预测蛋白质的静态结构方面取得了巨大成功。然而,蛋白质的功能取决于其动力学特性。研究人员目前正在积极探索其他深...
2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
FM又称从头计算方法,利用能量函数计算氨基酸空间相互作用,最终从所有可能结构中选取最佳形式,依靠分子动力学模拟获得蛋白质折叠方式,该法对小分子量蛋白质结构预测还算准确,但随着蛋白质复杂性增加逐渐变得无能为力。1994年,美国计算生物学家莫尔特(J.Moult)和菲德利斯(K.Fidelis)为推动蛋白质结构预测领域的快速发...
【中国科学报】研究提出蛋白质变构路径预测的深度学习模型
近日,中国科学技术大学物理系汪骞课题组和上海科技大学免疫化学研究所白芳课题组合作,提出了蛋白质变构路径预测的深度学习模型。该成果在线发表于《先进科学》。深度学习模型PATHpre建立流程。中国科大供图近年来,以AlphaFold为代表的深度学习模型在预测蛋白质的静态结构方面取得了巨大成功。然而,蛋白质的功能取决于其动...
从计算机跨界生物学,坐了10年冷板凳后,他开创蛋白质预测新范式
然而,由于蛋白质结构繁杂且变化多端,自然界中的蛋白质能在几毫秒内自发折叠,无数生物学家在其中深耕几十年而无果。但尽管如此,考虑到蛋白质结构预测问题的难度和重要性,生物知识仅有高中水平的许锦波,还是决定接过导师给的课题,开始一篇一篇啃生物学论文。“当时觉得这个问题很有趣,也非常重要,并且非常难,...
Cell:刘绮丽课题组揭示编码果蝇蛋白质饮食量设定点的神经生物学机制
这项研究揭示了编码果蝇蛋白质饮食量设定点的神经生物学机制,可能为饮食相关的体重调控和肥胖症的研究与治疗提供了一个新的策略。来自加州大学旧金山分校的刘绮丽团队在Cell上发表了题为OpposingGPCRSignalingProgramsProteinIntakeSetpointinDrosophila研究论文,揭示了果蝇大脑中两个起相反作用的GPCR信号通路通过...
哈工大生命科学和医学学部胡颖课题组发现内质网应激与DNA损伤应答...
胡颖课题组通过生物信息学分析发现,内质网应激与DNA损伤修复通路相关(www.e993.com)2024年10月16日。经过进一步的实验结果表明,内质网应激诱导多种肿瘤细胞发生DNA损伤,并伴有DNA-PK-NHEJDDR信号通路特异性激活,但在持续应激下,DNA-PK-NHEJ则被抑制,经后续研究发现DNA-PK-NHEJ信号的动态变化主要由KU70/KU80蛋白水平的改变所致。
苏州大学戴建锋团队发现寨卡病毒NS1蛋白泛素化功能
2024年8月20日,苏州大学戴建锋教授团队在1区top期刊AdvancedScience发表文章:UbiquitinationofNS1confersdifferentialadaptationofZikavirusinmammalianhostsandmosquitovectors。本研究发现了寨卡病毒NS1蛋白上的泛素化修饰在病毒感染哺乳动物宿主和蚊虫媒介中发挥了不同的功能,对病毒的流行进化起到了一定...
【前沿进展】Molecular Cell | 北京大学王伟课题组发现蛋白酶体...
该研究通过探究蛋白酶体进入SG、组装、酶活,以及对底物水解能力,阐明蛋白酶体可被招募进入SG,维持SG内的蛋白平衡、调控其稳态,提高植物耐高温的重要生物学意义。值得一提是,近两年王伟课题组的工作(NaturePlants,2023;MolecularCell,2024)深入解析了植物SG的功能和生物学意义,其涉及的技术和方法为该研究领域提供了...
JACS | 上海药物所开发蛋白质N端选择性的可逆修饰新策略
其中,蛋白的可逆修饰是通过对蛋白结构进行可控的笼化/脱笼过程实现其功能更精确的操纵,在可逆共价抑制剂的开发、抗体前药的设计、蛋白化学合成及蛋白的功能获得研究等多方面均有应用。正文上海药物所黄蔚课题组长期从事多肽蛋白质药物相关的研究,致力于发展新颖、实用的修饰新方法,助力多肽蛋白质药物的开发(Angew....
大连工业大学食品学院杜明教授课题组在蛋白质界面可控组装及功能...
主要研究方向为1)食品蛋白质资源开发与利用;2)蛋白质可控聚集与界面组装调控。主持国家自然科学基金、国家重点研发计划项目子课题、辽宁省自然科学基金等项目10余项。以第一作者或通讯作者在NanoTaday、Small、Biomacromolecules等杂志发表SCI收录论文40余篇。获辽宁省自然科学学术成果奖三等奖1项、辽宁省研究生教学成果...