Science | 浙大林世贤团队开发一种稀有密码子重编码技术,实现非...
哺乳动物细胞中ncAA结合的罕见密码子编码示意图(Credit:Science)通过系统的工程改造和核酸序列的大数据模型预测,稀有密码子重编码技术以接近天然氨基酸的编码效率高效合成系列带有非天然氨基酸的功能蛋白质,并在哺乳动物细胞中首次成功合成带有6个位点非天然氨基酸和4种不同类型非天然氨基酸的蛋白质,充分展示了稀有密码子...
浙大细胞“黑客”技术登上《科学》:改写氨基酸“代码”,创造全新...
在高中生物学教科书上,我们应该都见过一张“20种氨基酸的密码子表”。每个密码子由3个碱基组成,A、C、U、G四种碱基按不同的排列组合方式形成了64个密码子,其中61个对应编码了20种天然氨基酸,还有3个意味着终止符。这张密码子表是几乎所有生物都通用的“单词表”,从细菌到大象、从爬虫到人类,都用这20个氨基酸...
“冷门”密码子编码为非天然蛋白质制造提供新平台
从细菌到大象,从爬虫到人类,表上的氨基酸“单词”就这固定的20种。密码表上的谷氨酸等天然氨基酸可能被细胞捕获进入翻译过程,组成蛋白质的一级结构;而非天然氨基酸则可能在翻译后“修饰”到蛋白质分子上。“蛋白质的多样性是生物功能多样性的基础。”林世贤说,人和小鼠在基因组规模上差别不大,但是人类的蛋白质的...
Science:浙江大学林世贤团队报道稀有密码子重编码技术
因此可通过使用有义密码子替换终止密码子用于编码非天然氨基酸,来规避翻译释放因子的竞争。而有义密码子的冗余性为重新分配简并密码子用于编码新的氨基酸提供了操作空间。且在61种有义密码子中,存在一类使用频率低于1%的密码子——稀有密码子,稀有密码子往往对应较低水平的解码tRNA(Decoding-tRNA,Dec-tRNA)。研究团队...
南加大团队揭示全新snoRNA-tRNA互作网络,捕获7000多种snoRNA靶点
而CRISPR敲除snoRNAD97/D133家族之后,会显著降低tRNA的活性和水平,包括参与延伸过程的(e)Met-CAU,进而改变转录翻译过程之中密码子的识别。HEK293细胞中的D97/D133单敲除和双敲除,则会抑制富含甲硫氨酸(Met)等增殖相关基因的表达,不过也会促进Met含量较少的基因的表达。
专家点评Science丨林世贤团队报道稀有密码子重编码技术
图1.左:经典的遗传密码表;右:RCR技术重构的遗传密码表(图片设计:朱原之,于微)在这项研究中,研究者首先指出遗传密码扩展技术(GeneticCodeExpansion,GCE)中非天然氨基酸的低效率编码是翻译释放因子的强劲竞争所致(www.e993.com)2024年10月28日。因此可通过使用有义密码子替换终止密码子用于编码非天然氨基酸,来规避翻译释放因子的竞争...
两个圈外人的前卫实验,引发了一场不凡俗的科学革命
在20世纪50年代DNA双螺旋结构被发现后,人们希望知道基因是如何具体表达的,特别是翻译过程中密码子的碱基数量和对应的氨基酸序列。世界顶级实验室中的科学家一度处于迷茫的状态,但在60年代初,两位“圈外人”,海因里希·马特伊与马歇尔·尼伦伯格通过一种独特的实验方法,破译出第一个遗传密码,证明RNA密码子与氨基酸之间的...
人造生命体是否能在实验室创造?浙大《科学》发文来解答
已有研究表明,自然生命体的翻译系统通过识别通用的64个三联遗传“密码子”,按照基因编码的信息,将20种天然氨基酸聚合成蛋白质,进而不断演化成为复杂的生命体。自从发现了生命体的翻译规律,科学家们就一直在探索,能否通过改写遗传密码表,从而使得生命体能够编码20种氨基酸以外的非天然氨基酸?
iMeta | 高被引分子系统发育树分析教程PhyloSuite
1.4.3.密码表:在“CodeTable”的下拉菜单中选择与数据匹配的密码表,以正确识别终止密码子和正确翻译基因序列。Gyrodactylidea的线粒体基因组使用第9套密码表(棘皮动物和扁形动物门线粒体密码表)。1.4.4.统一基因别名。提取功能主要通过基因名称来识别同源基因,但同一基因通常在不同数据集中以不同的名称注释:...
浙大重磅科研成果,又上新了!
已有研究表明,自然生命体的翻译系统通过识别通用的64个三联遗传“密码子”,按照基因编码的信息,将20种天然氨基酸聚合成蛋白质,进而不断演化成为复杂的生命体。自从发现了生命体的翻译规律,科学家们就一直在探索,能否通过改写遗传密码表,从而使得生命体能够编码20种氨基酸以外的非天然氨基酸?