中国农业科学院谷物加工与品质调控创新团队从蛋白质相互作用角度...
团队通过系统梳理国内外相关研究数据报道,从蛋白质相互作用视角解析了大豆蛋白聚集和凝胶形态的变化机制。研究发现,蛋白质中的二硫键、疏水相互作用、静电相互作用和氢键等相互作用力的占比对大豆蛋白的聚集和凝胶形态影响各有不同。结果表明,pH诱导下的静电相互作用和氢键、NaCl协同诱导的静电相互作用、温度诱导下的疏水...
AlphaFold3迎来革命性进展!国内大佬手把手教授!|蛋白|蛋白质|多肽...
蛋白质-蛋白质相互作用预测:深度学习模型可以预测蛋白质和蛋白质之间的相互作用,从而帮助设计新的蛋白质复合物和抗体。蛋白质功能注释和预测:深度学习可以进行蛋白质功能注释和预测,识别蛋白质的功能域、结构域和功能位点等。这有助于预测蛋白质的功能和相应的生物学作用。蛋白质优化和筛选:深度学习可以用于优化...
质谱解码蛋白质之间的密语:蛋白相互作用质谱技术深度解析
蛋白质相互作用是细胞内生物过程的基础,通过相互作用形成的复合物调控着细胞的功能和代谢。蛋白质相互作用对于细胞信号传导、基因调控、药物研发等领域都具有重要意义。解码蛋白质相互作用可以揭示细胞内的调控机制和疾病发生的分子基础。2.蛋白质相互作用质谱技术的基本原理:蛋白质相互作用质谱技术是基于质谱分析的方法,...
探索蛋白质相互作用的奥秘:GST-Pulldown质谱的应用
通过与目标蛋白质相互作用的其他蛋白质可以通过质谱分析鉴定和定量,从而揭示蛋白质相互作用网络的组成和动态变化。2.蛋白质功能研究:GST-Pulldown质谱技术可用于筛选与目标蛋白特定功能相关的结合蛋白。通过富集结合蛋白并使用质谱分析鉴定,可以揭示目标蛋白在细胞中的功能和调控机制。3.药物研发:GST-Pulldown质谱技术...
动态追踪蛋白质结构:深入了解氢氘交换质谱的原理与应用
这有助于我们理解蛋白质的结构演化和折叠机制,为揭示蛋白质的功能提供重要线索。三、探究蛋白质相互作用和配体结合蛋白质的相互作用和配体结合对于其功能发挥和药物设计至关重要。氢氘交换质谱技术可以帮助科学家们研究蛋白质与配体或其他分子之间的相互作用。通过比较蛋白质与配体结合前后的氢氘交换情况,我们可以了解...
蛋白质与核酸相互作用的奥秘——欧倍尔虚拟仿真软件
蛋白质与核酸相互作用是生物体内许多重要生命过程的基础,如转录、翻译、DNA修复等(www.e993.com)2024年7月25日。为了深入理解蛋白质与核酸相互作用的机制和功能,科学家们开发了一种虚拟仿真软件,可以帮助研究人员模拟和分析这些相互作用的过程。虚拟仿真软件通过模拟和重现蛋白质与核酸相互作用的过程,可以帮助研究人员更好地理解和揭示这些相互作用的...
填补AlphaFold3空白,字节跳动提出物理引导的方法让蛋白质动起来
世界是变化的,分子是运动的,从预测静态单一结构走向动态构象分布是揭示蛋白质等生物分子功能的重要一步。探索蛋白质的构象分布,能帮助理解蛋白质与其他分子相互作用的生物过程;识别蛋白质表面下的潜在药物位点,描绘各个亚稳态之间的过渡路径,有助于研究人员设计出具有更强特异性和效力的目标抑制剂和治疗药物。但传统的...
Cell Systems封面论文:曾坚阳团队提出蛋白质口袋结构表征新方法
蛋白质-配体相互作用是许多重要细胞活动的分子基础,如信号转导、基因调控和细胞代谢等。鉴定和预测蛋白质-配体相互作用对于理解生命活动机理和开发新药具有重要意义。尽管已经有多种实验技术可用于测量和分析蛋白质-配体相互作用,但基于计算的研究方法,特别是深度学习方法,凭借其成本低、速度快的优势,正逐渐成为蛋白质-配...
构建心律之桥:揭秘肠道微生物与心律失常之间的联系
肠道微生物参与胆汁酸的代谢,胆汁酸诱导的心律失常发生的可能机制是与细胞膜和细胞膜离子通道或转运蛋白的相互作用。研究发现牛磺胆酸通过刺激心肌中的钠钙交换诱导膜电位变化,导致内向电流密度增加和静息膜电位去极化,进而影响心肌电活动。然而,也发现熊去氧胆酸在诱导心律失常方面无效,熊去氧胆酸偶联保护富含胆固醇的...
曾坚阳课题组提出蛋白质口袋结构表征新方法
蛋白质-配体相互作用是许多重要细胞活动的分子基础,如信号转导、基因调控和细胞代谢等。鉴定和预测蛋白质-配体相互作用对于理解生命活动机理和开发新药具有重要意义。尽管已经有多种实验技术可用于测量和分析蛋白质-配体相互作用,但基于计算的研究方法,特别是深度学习方法,凭借其成本低、速度快的优势,正逐渐成为蛋白质-配...