科学家解码多种养殖哺乳动物携带的病毒基因组遗传多样性

研究团队对5个动物目的哺乳动物进行了系统的宏基因组研究,鉴定出125种病毒基因组,其中39种可推定为新的病毒种。研究人员进一步遴选出诺如病毒、盖塔病毒等多种频繁发生“宿主跳跃”的潜在“风险”病毒,对其潜在跨物种传播风险进行解析,并从空间聚类、动物类群、种群、组织等维度揭示了这些病毒的生态学与流行病学特征。

科学网—科学家解码多种养殖哺乳动物携带的病毒基因组遗传多样性

研究团队对5个动物目的哺乳动物进行了系统的宏基因组研究,鉴定出125种病毒基因组,其中39种可推定为新的病毒种。研究人员进一步遴选出诺如病毒、盖塔病毒等多种频繁发生“宿主跳跃”的潜在“风险”病毒,对其潜在跨物种传播风险进行解析,并从空间聚类、动物类群、种群、组织等维度揭示了这些病毒的生态学与流行病学特征。

多种养殖哺乳动物携带的病毒基因组遗传多样性被解码—新闻—科学网

研究团队对5个动物目的哺乳动物进行了系统的宏基因组研究,鉴定到125种病毒基因组,其中39种可推定为新的病毒种。进一步地,研究人员遴选出诺如病毒、盖塔病毒等多种频繁发生“宿主跳跃”的潜在“风险”病毒,对其潜在跨物种传播风险进行解析,并从空间聚类、动物类群、种群、组织等维度揭示了这些病毒的生态学与流行病学特征。

宏基因组研究新突破!复旦Nature+1

团队对来自5个动物目的哺乳动物进行了系统的宏基因组研究，鉴定了125种病毒基因组，其中39种可推定为新的病毒种，丰富了养殖哺乳动物携带病毒的种类（图1）。使用生态学地理分布、进化动力学、公共大数据等多学科交叉方法，团队遴选出诺如病毒、盖塔病毒等多种频繁发生“宿主跳跃”的潜在“风险”病毒，解析其跨物种传播...

红豆树基因表达在代谢过程中有什么作用?

从中国中山市五桂山采集了一株红豆树和一株半缘红豆树个体。从叶组织中分离出它们的基因组DNA和总RNA。接下来,构建了长读段和短读段全基因组测序(WGS)以及短读段RNA测序(RNA-seq)文库。使用纳米孔蛋白酶测序仪进行了长读段WGS测序,而短读段WGS和RNA-seq则使用MGIDNBSEQ-T7测序仪,在150碱基对(bp)配对末端...

以考古探究优秀传统文化基因

人类作为早期的生活种群独自演化了数百万年,由于文明史上的交往交融相互影响,构筑了很多的共同特征并形成了独特的文化和可以勘察的文明遗迹(www.e993.com)2024年11月10日。站在新时代的起点上,我们来探讨文明的多样性有着重要的意义。随着科技不断发展,技术手段不断更新,考古变得更加精准、安全、有效,不仅可以为我们提供更丰厚更珍贵的历史资料,还...

宏基因组研究新突破,复旦最新研究发Nature

研究在166个单组织文库里鉴定到2种以上的病毒,发现星状病毒、细小病毒等与其他病毒频繁发生共感染。通过对低丰度病毒片段的精准拼接,避免了真阳性病毒因丰度阈值而被过滤,实现了多个病毒的90%基因组完成度(图2)。“我们采用的新方法可以精确地在个体层面解析病毒共感染状况,并能更灵敏地检测低丰度病毒,揭示出动物...

宏基因组研究新突破,复旦最新研究发Nature—新闻—科学网

研究在166个单组织文库里鉴定到2种以上的病毒,发现星状病毒、细小病毒等与其他病毒频繁发生共感染。通过对低丰度病毒片段的精准拼接,避免了真阳性病毒因丰度阈值而被过滤,实现了多个病毒的90%基因组完成度(图2)。“我们采用的新方法可以精确地在个体层面解析病毒共感染状况,并能更灵敏地检测低丰度病毒,揭示出动物...

指南共识丨纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识

中国药理学会治疗药物监测研究专业基层委员会和广东省药学会临床治疗精准用药专家委员会联合发起并组织多学科专家,采用名义群体法、德尔菲法等,制订了《纳米孔测序在病原微生物检测中的应用专家共识》,对纳米孔测序(涵盖靶向测序、宏基因组测序和全基因组测序等方向)的样本采集与运输保存、检测过程、生物信息学分析、报告...

见证恐龙灭绝和大熊猫进化的它,如今子孙遍布全球

1.母树衰老、繁殖率低、中幼林世代交替失衡(天然更新苗木极少),导致水杉群落自然更新能力差、野生种群日益缩小(物种自身层面);2.植物群落逆向演替,自然分布地或逐渐丧失(群落层面的影响);3.物种遗传机制受限,遗传多样性逐步降低(自身基因层面);4.遗传基因(DNA文库)保护尚未成熟(保护策略层面);...