通过探究豇豆轻斑驳病毒,研究其基因组结构及其编码,有何特征?

以豇豆轻斑驳病毒作为研究对象,对其全基因组结构及其编码蛋白在寄主作物的功能展开分析,也将为豇豆轻斑驳病毒的有效防控提供有力的科学支持。大豆病毒病简介由于大豆生产规模的不断扩大,种植模式和栽培环境因素的改变易导致大豆病害大发生,发生多样多类病害共同侵染的现象,影响大豆的安全生产,严峻减少了大豆的种植经济...

Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿

LRGASP(长读长RNA测序基因组注释评估项目)的概览,包括数据生成、读长分布、合作设计、各工具在不同数据类型上的表现,以及独特剪接链(UJC)的相对重叠情况(Credit:NatureMethods)a.LRGASP项目的数据生成用于LRGASP项目的数据生成情况。研究团队使用多种文库制备方法和测序平台,包括:CapTrap-ONT(OxfordNanoporeTe...

解决方案 | 感染高发,病原NGS检测全流程原料解决方案助力更快更准...

建库耗时短:cDNA合成仅需25min,DNA建库仅需1.75h,TR转座酶共建库仅需2h灵敏度高:建库性能优良,低丰度物种实现更好检出同流程管理:兼容RNA单检和DNA&RNA共检??tNGS建库新增防污染系统,含多重扩增模块和二轮文库扩增模块,助力病原tNGS检测UltraCleanPathogenMultiplexAmpSeqPrepKitforDNA(U...

MobiNova-100单细胞测序建库系统-墨卓生物-新品

本产品可高效无偏好性地完成反转录、cDNA扩增及文库构建,显著提高测序文库产物得率及同等测序深度下的基因检出率,从而完成对数百至数万个细胞中的mRNA进行测序。MobiVision生信分析软件MobiVision生信分析软件,可从二代测序下机的原始fastq数据开始处理,经过细胞标签的提取、质控与校正,测序数据质控,参考基因组比对,基...

酵母文库——对于突变你了解多少?(科普系列)

酵母文库——对于突变你了解多少?(科普系列)关于突变?所有突变都包含DNA序列的改变。突变率?每代发生突变的数量,根据观察单元的层次,可分为基因组突变率,基因座突变率,碱基突变率。举个栗子,细菌基因组的突变率是每代3×10-3。突变类型?1、根据突变发生性质,可分为自发突变和诱发突变,自发突变是由于...

NGS文库构建的关键酶!

文库构建的本质是将片段化后的基因组DNA两端加上通用接头序列,通过PCR扩增获取足够多能够上机测序的文库核酸分子(www.e993.com)2024年11月16日。根据样本类型,又分为DNA建库和RNA建库。在DNA文库构建过程中,TA克隆连接接头建库是目前商业技术中最常用的技术手段,主要建库流程如下:图2.Illumina平台DNA文库构建流程...

探索关于微孢子虫病原体与宿主蚊子的相互作用原理和基因组点位

为了证实微孢子虫RNA的成功提取,我们按照基因组DNA的方法对总RNA合成的cDNA进行了qPCR,使用dUTP第二链标记方法为poly(A)选择的RNA样本构建了链特异性文库。在IlluminaHiSeq上对文库进行测序,每个样本平均产生7600万对末端reads(101-nt);所有样本的测序质量得分都很高,平均得分在29.2到34.6之间。

三代测序可能正在成为基因分型的新标准,为抗癌药物的使用提供证据...

此外,三代测序技术仍然缺乏针对少量样品的高产量文库制备和测序规范流程。虽然可以使用全基因组或转录组扩增方法来增加DNA/RNA的数量,但首选仍是对原始分子进行直接测序,以避免扩增引起的样本片段大小限制,并检测分子中的所有碱基修饰。开发可以充分利用三代测序的分析方法已成为目前生物信息学中最重要的问题之一。我们现...

RNA的提取和cDNA合成(酸-苯酚法)

从真核生物的组织或细胞中提取mRNA,通过酶促反应逆转录合成cDNA的第一链和第二链,将双链cDNA和载体连接,然后转化扩增,即可获得cDNA文库,构建的cDNA文库可用于真核生物基因的结构、表达和调控的分析;比较cDNA和相应基因组DNA序列差异可确定内含子存在和了解转录后加工等一系列问题。总之cDNA的合成和克隆已成为...

ODNs寡核苷酸荧光探针/cDNA链探针/eDNA-链探针

常用的克隆载体是λ噬菌体DNA。用载体可以得到包含104以上的转化子的文库,再经前面介绍的筛选方法筛选特定基因克隆。用这种技术获得的DNA探针不含有内含子序列。因此尤其适用于基因表达的检测。荧光标记脱氧核糖核酸荧光探针eDNA-链探针eDNA是指在环境样品中所有被发现的不同生物的基因组DNA的混合。DNA荧光探针的灵敏...