2024年全基因组测序捕获和文库构建试剂
一、项目基本情况1、项目编号:SZBM-2024-G0110(市网)、SDGP370800000202402000467(省网)2、项目名称:2024年全基因组测序捕获和文库构建试剂3、采购方式:公开招标4、预算金额:37.3万元5、采购需求:本项目为2024年全基因组测序捕获和文库构建试剂,具体内容详见招标文件第三章技术标准和要求。6、合同履行期限...
【本月之星】人全基因组文库、鼠激酶组文库、 RNA结合蛋白文库
研究人员利用包含123,411个单导向RNA(sgRNAs)的人类基因组规模的CRISPR敲除库(GeCKOlibraryv2)对19,050个基因进行敲除,并使用edgeR算法分析下一代测序获得的每个sgRNA的读数,通过cBioPortalforCancerGenomics数据库分析了EGFR突变状态与最相关抗性基因的关系。研究结果揭示了266个可能负责EGF诱导的细胞凋亡的基因,并...
I.DOT 经济化土壤样品中DNA的宏基因组和扩增子文库的制备
所有土壤类型的DNA提取都很成功,进一步使用纳升级移液系统I.DOTone将Illumina扩增子和宏基因组文库制备体积分别缩小了5倍和10倍,对观察到的微生物群落没有显著影响。通过这些方案,DNA提取,宏基因组文库制备或扩增子文库制备耗时大约分别为3小时、5小时和6小时。此外,扩增子和宏碁因组文库制备的小型化将化学和塑料成...
家蚕90%基因功能未知!西南大学科学家花8年建突变体文库解密
家蚕全基因组CRISPR文库是科学家第一次在农业昆虫上建立规模化文库创制的技术体系。马三垣表示，家蚕之前选育和饲养的主要目标是生产纺织原料，其在医药、食品等方面的应用特性都需要改进，以适用于新的需求。对前述文库的利用，主要包括两个方面：一是鉴定家蚕的突变体，进行高通量的功能基因组研究；二是进行遗传筛选，...
Nature Genetics | 癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型...
使用带有条形码的慢病毒库(BarcodeLentiviralLibraries):研究者构建了含有癌症相关基因事件的慢病毒库,并通过条形码来标记每种基因事件。这些慢病毒随机并高效地感染原代上皮细胞,使得每个细胞可能包含不同的基因组合。原代上皮细胞(PrimaryEpithelialCells)的使用:研究中用到了来自小鼠膀胱和前列腺的原代上皮细...
2024 ASCO精彩回顾,基因检测引领精准医学新浪潮
因美纳研发团队在本次ASCO2024上分享了其全新的TruSightOncologyMRDWGS检测(TSOMRD,仅供科研使用),该检测基于tumor-informed路线,针对多种癌症类型cfDNA开展全基因组测序WGS(www.e993.com)2024年11月14日。方法介绍TSOMRD基于因美纳强大的WGS文库构建、生信分析和测序技术。主要包括检测过程分为两个主要步骤——分子指纹分析和ctDNA检测。
我科研团队实现对家蚕的高通量基因编辑
该研究在家蚕个体水平上首次构建了全基因组CRISPR文库，并对部分突变体进行了表型组学鉴定和功能筛选，获得了大量具有明显表型的突变体，以及具有潜在育种价值的候选基因。相关成果日前在《基因组研究》上发表。育种技术经历了驯化育种、遗传育种、分子育种3个阶段。近年来，随着基因编辑技术的发展及应用，种业发展进入“...
天津工生所开发基于碱基编辑的全基因组扰动文库构建与筛选技术
但基于DNA双链断裂(Doublestrandbreak,DSB)的CRISPR/Cas基因编辑方法由于受DSB的毒性影响,需要添加外源DNA模板且对同源重组效率要求较高,在微生物基因组的文库构建中具有一定的局限性,特别是在同源重组效率普遍偏低的原核生物中更是难以推广。而基于CRISPR干扰(CRISPRinterference,CRISPRi)的文库构建技术则受干扰效率...
NGS文库构建的关键酶!
文库构建的本质是将片段化后的基因组DNA两端加上通用接头序列,通过PCR扩增获取足够多能够上机测序的文库核酸分子。根据样本类型,又分为DNA建库和RNA建库。在DNA文库构建过程中,TA克隆连接接头建库是目前商业技术中最常用的技术手段,主要建库流程如下:图2.Illumina平台DNA文库构建流程...
新型双碱基编辑器助力基因饱和突变文库构建—新闻—科学网
结果表明,与单独的ABE和CGBE相比,AGBE极大地拓宽编辑窗口(从4-8到3-13),在此基础上通过将不同类型的碱基转换进行组合,可以大幅度地增加编辑产物的多样性,从而构建出含有更多基因突变类型的突变文库。令人惊喜的是,研究人员通过分析全基因组和转录组测序数据,发现AGBE并不会引起明显的DNA或RNA水平的脱靶效应,证明...