蛋白组学测序数据表怎么看
1、蛋白质ID(ProteinID)唯一标识每个蛋白质的编号,通常是数据库中的标识符,如UniprotID。2、蛋白质名称(ProteinName)蛋白质的通用名称或描述性名称。3、谱图计数(SpectralCount)检测到的谱图数量,反映了蛋白质在样本中的相对丰度。4、肽段序列(PeptideSequence)用于识别蛋白质的特定肽段的氨基酸序...
揭秘强直性脊柱炎治疗新靶点:血浆蛋白组学的突破性发现
本研究是一项基于蛋白质组学的孟德尔随机化研究,旨在识别AS的潜在治疗靶点并评估药物靶点的潜在不良反应。研究纳入了来自英国生物银行药物蛋白质组学项目(UKBiobankPharmaProteomicsProject,UKBPPP)数据库的2940种血浆蛋白的全基因组关联研究(Genome-WideAssociationStudies,GWAS)数据,以及芬兰数据库R9版本中包含的...
规模最大蛋白质组学研究成果发布:“一滴血”预测六十多种疾病风险
该项目是迄今为止规模最大的蛋白质组学研究。团队使用了英国生物库制药蛋白质组学项目的数据,测量了从英国生物库随机选择的40000多名参与者中收集的约3000种血浆蛋白。蛋白质数据与参与者的电子健康记录相关联。使用先进的分析技术,团队针对每种疾病精确地确定了5到20种对预测最重要的蛋白质的“特征”。研究报告称...
迄今最大规模的单细胞蛋白质组数据库SPDB
为弥补上述不足,哈尔滨工业大学研究团队联合腾讯人工智能实验室团队构建了一个全面的单细胞蛋白质组学数据库SPDB,可用于一般单细胞蛋白质组学数据,包括基于抗体或基于质谱的单细胞蛋白质组学,提供了从单细胞角度研究蛋白质组学的强大工具。SPDB具有标准化的数据处理流程和友好的web界面,提供统一的数据格式,方便与下游分...
Nat Aging 脑内皮细胞蛋白质组学图谱解析大脑衰老过程的动态特征
综上所述,研究人员应用系统的蛋白质组学分析,揭示了衰老过程中大脑内皮细胞的多种生物学过程的重大转变,特别是囊泡运输途径在衰老过程中表现出严重失调,并确定了Arf6可作为介导衰老过程中囊泡转运变化的候选因子,以及Apoe缺乏对BEC衰老的加速作用。此外,研究团队建立了小鼠BEC随年龄增长的蛋白质动力学在线数据库...
蛋白质组学驱动精准医学加速发展
为此,作为我国“人类肝脏蛋白质组计划”的发起人和领导者,贺福初率先提出了建立蛋白质组“两谱、两图、三库”的战略科学目标,即建立肝脏蛋白质组表达谱、修饰谱、连锁图、定位图、样本库、数据库和抗体库(www.e993.com)2024年10月5日。基于我国先行者的工作,2002年,国际学界启动“人类蛋白质组计划”时,将“人类肝脏蛋白质组计划”列入首批行...
...腾讯AI Lab姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组学?
他们解释道,这三篇论文的创新之处在于,它们首次为单细胞蛋白质组提供了全面的数据知识库和系统的AI分析方法。论文一中建立的SPDB数据库,通过标准化处理不同来源的单细胞蛋白质组学数据,使得数据易于比较和分析,是目前全球数据量最大、覆盖技术和数据集最为广泛的单细胞蛋白质数据库。论文二中的scPROTEIN框架...
专访姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组学
论文一中建立的SPDB数据库,通过标准化处理不同来源的单细胞蛋白质组学数据,使得数据易于比较和分析,是目前全球数据量最大、覆盖技术和数据集最为广泛的单细胞蛋白质数据库。论文二中的scPROTEIN框架,针对单细胞蛋白组数据的特殊性提出了解决方案,能够处理数据中的不确定性、缺失值、批次效应和噪声问题。为基于...
华大基因获8家机构调研:公司自主开发的“Dr.Tom多组学数据挖掘...
答:公司自主开发的“Dr.Tom多组学数据挖掘系统”可以快速、深度地挖掘基因、蛋白和代谢数据,该系统整合了多个国际常用的基因数据库和生物信息分析工具,并优化了数据挖掘的方式和展现形式,还结合了云计算、人工智能和机器学习技术。通过该系统,科研用户可以方便的进行自助式多组学数据挖掘。专利布局方面,公司在生物信息异构...
Cell | 上海药物所合作绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱
该研究对小细胞肺癌患者的肿瘤组织和配对癌旁组织样本进行了蛋白基因组学(proteogenomics)分析,通过整合基因组、转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组等多维组学数据,系统揭示了小细胞肺癌的分子特征,提出新的分子分型及其针对性的个体化治疗策略,为深入理解小细胞肺癌的发病机制和改善临床治疗策略奠定了坚实的基础。