Nature | 女跨男性别确认睾酮治疗过程中的免疫适应
进一步通过质谱流式细胞术和单细胞RNA和单细胞ATAC测序,研究人员揭示了激素治疗后的免疫学特征,包括:1)总白细胞数量没有显著变化。但浆细胞样树突状细胞(plasmacytoiddendriticcells,pDCs)、CD8粘膜相关恒定T细胞(CD8+mucosa-associatedinvariantTcells,CD8+MAITs)和CD24+CD8+中央记忆T细胞(centralmemory...
云南农业大学单细胞转录组测序、单细胞ATAC测序、转录组测序项目...
云南农业大学单细胞转录组测序、单细胞ATAC测序、转录组测序项目采购项目的潜在供应商应在云南通拓招标有限公司(昆明市盘龙区金江路与志强路交叉口同德昆明广场B区4栋501)。获取采购文件,并于2024年07月01日09点30分(北京时间)前提交响应文件。一、项目基本情况项目编号:校采.2024-35号项目名称:云南农业大学...
Nature | 揭示肌肉老化的分子秘密:细胞间交流与干细胞在肌肉衰退...
研究团队采用了单细胞和单核RNA测序技术来分析细胞和核的异质性。他们对肌肉样本进行了处理,通过机械和酶解的方法分离出单细胞和单核,然后构建了scRNA-seq和snRNA-seq文库。染色质可及性测序(ATAC-seq)此外,研究中使用了单核ATAC测序(snATAC-seq)来评估基因表达调控区域的染色质开放性。这有助于理解转录调控...
追问|如何老当益壮?科学家绘制迄今最完整肌肉衰老图谱
研究者们使用了多种指标评估了肌肉功能,并进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)和单核ATAC测序(snATAC-seq)。研究将这些信息分析整合,形成了迄今为止最完整的骨骼肌多模态单细胞图谱。该研究发现肌肉衰老过程中的多种细胞变化和调节机制。比如随着年龄的增长,具有爆发力的快速肌纤维会逐渐减少,更...
Nat Genet | 王红梅/肖振宇/陆发隆/李蓉团队通过人胎盘合体滋养层...
该研究对妊娠早期和晚期人类胎盘进行了单核RNA测序和单核ATAC测序分析。研究结果证明了STB核的动态异质性和发育轨迹,以及它们与人类滋养细胞干细胞(hTSC)衍生的STB的对应关系。此外,通过基因调控网络确定了与多种STB核谱系相关的转录因子,并通过实验证实了它们在hTSC和滋养细胞类器官来源的STB中的功能。总之,该研究提供...
...新一代Microwell-seq3.0平台用于单细胞总RNA和染色质可及性测序
单细胞染色质可及性分析(singlecellATAC-seq,scATAC-seq)和单细胞转录组(singlecellRNA-seq,scRNA-seq)测序是单细胞多组学中应用最广泛的两个组学技术(www.e993.com)2024年9月30日。主流的微流控体系和微孔板体系为高通量的单细胞或单细胞核分离提供了有效的方案。但微流控平台的封闭特性使得单细胞分隔之后很难再对其进行多步加样或其他...
...Cell》发布高通量、低成本、高信噪比CH-ATAC-seq技术并绘制跨...
单细胞染色质可及性测序(singlecellATAC-seq,scATAC-seq)可以提供与转录组互补的表观调控信息,有助于我们更为深刻地理解跨物种的保守调控机制。人、小鼠的全身多组织染色质可及性景观已经相继问世,但其它模式生物如斑马鱼、果蝇和蚯蚓仍缺乏全身染色质可及性景观。
苗振等开发解决单细胞ATAC-seq定量不一致的新方法
苗振等开发解决单细胞ATAC-seq定量不一致的新方法单细胞ATAC-seq技术(scATAC-seq)被广泛应用于研究基因表达的调控,包括发掘潜在启动子和增强子(promotersandenhancers),比较转录因子(Transcriptionfactorenrichment)富集等。然而,单细胞ATAC-seq数据的分析流程存在诸多不一致。不一致的数据处理会导致下游结果的不一致,...
EMBO J丨解云礼团队揭示胶质细胞异质性机制
基于前期研究中发现的TCF4调控嗅球少突胶质细胞数量控制这一成果5,团队利用小鼠模型,结合Cut-Tag,单细胞测序和ATAC-seq等组学技术,发现TCF4能够抑制少突胶质细胞中星形胶质细胞基因的表达,实现腹侧端脑来源的胶质细胞命运限定在少突胶质细胞,避免了腹侧端脑来源的星形胶质细胞分布在背侧新皮层。通过结合组织透明...
Nat Genet : 王红梅/肖振宇/陆发隆/李蓉团队通过人胎盘合体滋养层...
该研究对妊娠早期和晚期人类胎盘进行了单核RNA测序和单核ATAC测序分析。中国科学院动物研究所王红梅、北京理工大学肖振宇、中国科学院遗传与发育生物学研究所陆发隆及北京大学李蓉共同通讯在NatureGenetics(IF30.8)在线发表题为“Single-nucleusmulti-omicprofilingofhumanplacentalsyncytiotrophoblastsidentifies...