中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生
在环境科学研究中,16SrRNA基因扩增子测序方法可用于分析废水、湖水等环境样品的细菌菌群组成,以评估环境污染和生态修复效果。本综述从梳理16SrRNA基因扩增子测序方法的重要发展历程开始,对目前用于鉴定与定量16SrRNA基因或细菌类型的16SrRNA基因扩增子测序方法的特性进行了比较和总结。接着,概述了16SrRNA基因扩增...
仁济医院马雄Med:解析原发性胆汁性胆管炎患者肠道菌群组成功能及...
最后,作者在仁济医院重新招募了46名初治患者,进行了粪便16SrRNA测序;以及与杭州西溪医院合作,重新分析了该团队此前发表的25名PBC初治患者和25名健康对照的16SrRNA数据3。在两个独立队列中,作者均发现PBC基线肠道菌群可划分为两个亚型。梭菌是驱动亚型形成的关键细菌,且Clostridialow组的UDCA不应答率更高。综合3个...
...教授等:草菇子实体多肽对小鼠急性酒精肝的预防作用及肠道菌群...
建立小鼠急性ALD模型,通过血清和肝脏多项指标检测,结合肝组织病理切片分析,探究VVFP对急性ALD的预防作用;同时利用16SrDNA基因高通量测序分析各样品中微生物菌群的生物多样性以及门和属水平的相对丰度,探究VVFP对ALD模型小鼠肠道菌群结构的影响,从而为揭示VVFP对小鼠肝脏的保护作用机制提供参考。
热点剖析:肠道菌群文献集锦
结果表明,砖茶对高脂饮食诱导的NAFLD的干预效果可能依赖于肠道菌群及其代谢物胆汁酸。此外,16SrRNA基因测序显示,砖茶能显著改善NAFLD小鼠的肠道菌群失调,具体表现为提高乳酸杆菌、异养普雷沃氏菌和瘤胃球菌科水平,同时降低拟杆菌水平。然后,共鉴定出23种胆汁酸,通过筛选得到17种差异性胆汁酸,砖茶提高了NAF...
乙肝治疗或有新策略?肠道菌群改变与隐匿性乙肝病毒感染有关
研究收集了18例HBV携带者、20例健康献血者和24例OBI献血者的粪便样本,利用16S测序分析三组肠道菌群组成的差异,发现与HBV携带者相比,OBI献血者肠道菌群中亚微颗粒菌的丰度显著增加,这可能刺激免疫激活,促进隐匿性感染的形成。本研究结果可能揭示肠道菌群在OBI形成中的作用,为HBV感染的治疗提供新的策略。
16S全长测序揭示运动性脑震荡肠道微生物菌群变化
全长16S测序读长大约1500bp,能够覆盖16SV1-V9高变区域(www.e993.com)2024年10月19日。测序结果通过PCoA分析显示三个时间点之间存在重叠,且ANOSIM分析评估的差异无统计学意义。基于辛普森和香农alpha多样性指数显示在时间点之间没有显著差异。比较门、科和属水平的肠道微生物群组成结果表明赛季中期和赛季后期流行类群的相对丰度相似。有17个物种在休...
东莞市十大肠道菌群检测中心大全(附2024年汇总鉴定)
现代测序技术主要包括16SrRNA测序和全基因组测序。16SrRNA测序是通过扩增并测序微生物的16SrRNA基因片段,来鉴定肠道微生物的种类和数量。这种方法具有高通量、高准确性、快速等优点,广泛应用于肠道菌群检测领域。全基因组测序则是对肠道微生物的整个基因组进行测序和分析,可以获得更全面的微生物信息,但成本较高。
Nature|肠道菌群成致癌暴露物帮凶,促进癌症发生发展
进一步结合16SrRNA测序,共鉴定出来自于8个不同属12个种细菌具备这一能力。并且与预期一致,由于该反应需要一定的氧气,所以这些细菌在肠道菌群中的丰度很低。上述结果表明,BBN的氧化是由肠道菌群中的一个独特亚群进行的。接着,作者研究了人类肠道菌群是否也能将BBN氧化为BCPN。结果表明,人类肠道菌群可在体外和小鼠...
肠道菌群移植的功效
同时,肠道菌群移植的菌群更加精准,更适合患者。菌群移植通过对粪便样本中细菌的16SrRNA基因序列进行测序,可以识别出肠道内存在的各种细菌种类及其相对丰度,并通过对菌群库进行供——受体配型后的“最优配置”,精准靶向干预肠道微生态环境,治疗效果更好。目前,对于抗生素耐药导致的超级细菌感染,比如艰难梭菌感染,国内外...
呼吸道菌群在呼吸机相关性肺炎中作用的研究进展
一、呼吸道菌群在VAP中的变化下呼吸道无菌的概念随着16SrRNA等测序方法的广泛应用而逐渐被推翻。目前认为下呼吸道存在菌群,主要由普氏菌属、韦荣球菌属和链球菌属组成。下呼吸道是外界气体交换的场所,同时受上呼吸道及消化道液体的影响,故下呼吸道菌群的组成处于一个动态平衡之中,即上、下呼吸道菌群分布存在“地貌...