中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生

此外，使用下一代测序技术后无需再做DNA克隆，简化了16SrRNA基因扩增子测序的步骤。因此目前主流的16SrRNA基因扩增子测序方法仍采用下一代测序技术。2013年，16SrRNA基因扩增子测序技术采用单分子测序技术（三代测序）实现了对16SrRNA基因全长序列的高通量测序。2022年，基于单细胞的16SrRNA基因扩增子测序方法研...

市场报告:2023年中国单细胞测序行业市场规模同比增长19.3%

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。单细胞测序技术是指能够对基因组、转录组和表观遗传物质进行高通量的测序分析，从而揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，在肿瘤、发育生物学、免疫学、神经科学等领域发挥重要作用，使其成为生命科学研究的重点。我国的单...

用单细胞与空间转录组测序技术解析膝关节骨性关节炎软骨细胞异质

为了建立膝关节骨性关节炎患者和正常对照软骨细胞的细胞图谱景观,研究人员首先对8例骨关节炎患者中承重区(磨损严重区域,WB)与非承重区(轻度磨损区域,NWB),以及3例正常对照个体膝关节软骨进行了scRNA-seq单细胞转录组测序(10XGenomics)分析,研究发现前肥大软骨细胞(preHTC)、纤维软骨性软骨细胞(FC)、稳态性软骨细胞(...

...新一代Microwell-seq3.0平台用于单细胞总RNA和染色质可及性测序

发布了新一代低成本、高通量、高兼容性的微孔板平台(Microwell-seq3)来检测单细胞中的总RNA表达与染色质开放性,系统比较了该技术在全长转录组范围及染色质可及性灵敏度提升的

浙江大学良渚实验室沈宁团队发布实现单细胞水平肿瘤细胞群突变与...

然而,单细胞基因组水平体细胞突变(somaticmutation)等基因组突变方面的检测分析,受单细胞基因组测序技术的发展限制依然存在重重困难。由于scRNA-seq实验本身在单细胞水平所覆盖的基因组区域较少,造成了可检测突变的稀疏性。而实验过程中又会引入大量伪信号与噪音信号,进一步增加了在这一数据类型中高精准度检测体细胞...

【首发】星赛生物完成近亿元A轮融资,开辟单细胞拉曼流式分选赛道

星赛生物自主研发了一系列单细胞分析仪器(拉曼组仪器系列),包括高通量流式拉曼分选仪FlowRACS、单细胞拉曼光镊分选仪RACS-Seq、单细胞微液滴分选仪EasySort、临床单细胞拉曼药敏快检仪CAST-R,以及多款用于微生物组分析、单细胞全基因组/痕量核酸扩增、单细胞培养/分选等的试剂盒、微流控分选芯片(www.e993.com)2024年11月15日。

Sci Adv:单细胞RNA测序和空间转录组学绘制金鱼端脑细胞类型图谱

1空间分辨率的金鱼端脑细胞类型图谱单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够完全基于全基因组基因表达谱(转录组)来比较不同物种间特定组织细胞类型的分子相似性和差异。而空间转录组(ST)可以保留mRNA分子在组织中的位置信息,并实现基因谱的空间定位。本研究结合这两种技术,生成了金鱼端脑的空间注释细胞类型图谱(图1A)。

Nature子刊:张翼/王行环团队开发精确测定单细胞年龄的时钟算法

该研究建立了一种基于时钟位点染色质可及性推断单细胞复制年龄的生物信息学方法——EpiTrace,实现了对单细胞染色质可及性(ATAC-seq)数据集的细胞年龄推断,为单细胞测序数据集提供了时间参考系。已有研究表明,特定基因组区域中的CpG位点上的DNA甲基化水平随着个体年龄变化而匀速改变,因为这些特定基因组区域的DNA甲基化...

Nature:王凌华团队等通过单细胞和空间转录组揭示肺腺癌最早的细胞...

通过对比在不同取样时间点的单细胞RNA测序数据,他们发现小鼠KACs的出现在Kras突变型肿瘤出现之前。此外,研究者还对来自小鼠模型的肺癌样本进行了空间转录组测序分析。空间转录组测序数据也呈现出和人肺腺癌样本的空间转录组数据相似的特征,即小鼠肿瘤组织和肿瘤周围邻近组织中存在高水平的KACs特征基因的表达。

单细胞可视化分选培养系统—isoCell-iotaSciences-新品

使用isoCell可以温和且自动化地将人类诱导多能干细胞(hiPSCs)进行单细胞分选并进行培养,高效地培养hiPSCs单克隆细胞系,显著提高了细胞分离与克隆效率(如下图所示)。K562细胞单细胞测序传统单细胞测序需对单细胞进行全基因组扩增(WGA),但传统单细胞WGA受限于如何获得单个细胞并转移到小体积的WGA反应中。