Sci Adv丨成瘾大脑的”密码破译”:大脑中组蛋白改变如何调控成瘾...
ChIP-seq结果显示,戒断后H2A.Z在启动子和增强子区域的结合显著减少,这可能导致转录因子更容易结合并诱导基因表达。在戒断后可卡因复发时上调的基因,其启动子和增强子区域的H2A.Z结合也显著减少,这些基因参与突触可塑性、跨突触信号传导和神经元突起形态发生等过程。图3质谱分析显示可卡因诱导的NAc翻译后组蛋白修饰和...
安徽农大张照亮团队首次报道木本植物根系单细胞转录组图谱
图7转录因子CsLBD37调控茶氨酸合成在这项研究中,作者提出了一个单细胞RNA测序(scRNA-seq)衍生的茶树根图谱,该图谱能够对谷氨酸和乙胺的代谢以及茶氨酸的生物合成、储存和运输进行细胞类型特异性分析。作者的研究结果支持了一个模型,即茶氨酸生物合成途径通过多细胞区隔发生,转录因子调控基因不意味着需要二者在同一...
Nature | 揭示转录因子位置依赖性:解密基因调控的空间密码
该研究发现在转录起始点周围,TF结合位点的偏好位置是这些因子功能的反映,体现了它们在调控转录起始中的多种机制作用。该研究揭示了如何通过结合位点的空间配置来解码基因组中的调控信息,这对于理解基因调控和非编码DNA突变如何导致疾病有重要意义。在基因组中,转录因子(TranscriptionFactors,TFs)通过特定序列的结合位点...
Cell | 双功能转录因子维持中等水平的基因表达稳定性
作者提出了一种新的观点,认为在己释放可及区域内形成的凝聚体模式可能指示特定转录因子的存在,这些转录因子能够调节中等水平的转录。通过分析小鼠胚胎干细胞中的转录因子,作者鉴定了一组在己释放可及区域富含结合位点的转录因子,特别是那些含有能够促进动态分子间相互作用的大的内在无序区域的转录因子(图3A)。这些转录...
Cell | MYB相关转录因子调控植物叶绿体发育
通过对MYB转录因子突变体、过表达品系等的RNA-seq发现了MYB转录因子参与调节叶绿体发育以及光合作用基因表达,进一步通过DAP-seq确认了地钱中参与叶绿体生物合成的MYB转录因子的具体DNA核心结合基序,为叶绿体生物发生的调节和控制提供了新的研究方向。图4工作模型...
Plant Cell | 武汉大学杨红春课题组揭示转录因子相分离调控水稻...
转录调控是真核生物发育过程中不可或缺的基因表达调控机制(www.e993.com)2024年10月23日。转录因子通过调控基因表达,控制植物发育。液-液相分离(liquid-liquidphaseseparation)在细胞内形成无膜的细胞器,参与细胞内众多活动并调控许多发育过程。越来越多的研究表明,转录因子的相分离在基因调控中起着至关重要的作用。然而,对于哪些转录因子具有相分离...
.../陈嘉瑜揭示小鼠早期胚胎发育中以TFAP2C为核心的转录因子调控...
小鼠早期胚胎发育过程中以TFAP2C为核心的代谢、表观印记和遗传信息三元调控模型综上所述,该研究工作不仅刻画了转录因子TFAP2C的全基因组结合图谱,鉴定并验证了其下游转录因子TEAD4和KLF5,还从代谢、表观印记和基因组突变三个不同角度证明了其对转录因子结合的影响,刻画了以TFAP2C为核心的转录因子调控网络,为转录因子...
浙江大学研究团队揭示转录因子和DNA甲基化协同调控桃果实成熟的...
综上,该研究发现PpNAC1可以直接结合PpDML1的启动子并激活其表达,进而影响其自身和下游成熟相关基因的DNA甲基化水平。转录因子PpNAC1和DNA去甲基化酶PpDML1协同调控桃果实成熟和风味品质形成(图3)。图3PpNAC1与PpDML1协同调控桃果实成熟的作用模式图
...研究团队揭示染色质环境在哺乳动物胚胎谱系分化中协调转录因子...
综上所述,这项研究工作系统揭示了以TFAP2C为中心的转录因子调控网络在围着床期胚胎不同谱系分化过程中发挥的功能,阐明了TFAP2C与经典的谱系转录因子CDX2和NANOG/SOX2之间的协同调控关系,同时展示了染色质环境如何指导非先锋转录因子的结合,进而调控这段时期胚胎细胞的基因转录和命运状态。值得一提的是,该研究不仅是对...
.../李晶团队揭示增强子在卵子发生及早期胚胎发育中的转录调控机制
研究人员在卵子中鉴定了两个在增强子上最为富集的关键转录因子TCF3和TCF12。敲除TCF3和TCF12会导致卵泡发育和卵子发育的严重缺陷,并使卵子转录组停滞在原始卵泡阶段,无法激活如Zp1/2/3等卵子发育关键基因。上述结果表明,卵子中存在活跃的增强子,这些增强子帮助鉴定出调控卵泡发生和卵子发育的关键转录因子TCF3和TCF12。