西南大学研究人员发现调控寿命新基因
代方银介绍,FOXO是目前已确定的少数几个人类长寿基因之一。FOXO转录因子调节与衰老相关的途径并影响寿命,但其具体作用靶点仍待深入探索。对此,团队首先查明,寿命调节因子FOXO在不同模式动物间的二级结构具有较高保守性,这为利用家蚕筛选FOXO靶基因提供了依据。团队利用线虫高效干涉平台,对家蚕中FOXO的42个候选靶基因...
EMBO REP | 清华大学生命学院颉伟团队总结合子基因组激活调控因子...
05作者提出了鉴定ZGA许可因子的四条标准,部分可能的ZGA许可因子包括斑马鱼的核孔复合体组分和小鼠转录机器的部分调控因子如CyclinT1等。以上内容由腾讯混元大模型生成,仅供参考合子基因组激活(zygoticgenomeactivation,ZGA)作为生命起始后的第一个转录事件,是启动胚胎发育程序、推动早期胚胎发育由母源基因组控制转变...
Nature | 揭示转录因子位置依赖性:解密基因调控的空间密码
该研究发现在转录起始点周围,TF结合位点的偏好位置是这些因子功能的反映,体现了它们在调控转录起始中的多种机制作用。该研究揭示了如何通过结合位点的空间配置来解码基因组中的调控信息,这对于理解基因调控和非编码DNA突变如何导致疾病有重要意义。在基因组中,转录因子(TranscriptionFactors,TFs)通过特定序列的结合位点...
...湾国家实验室罗杰团队揭示脂肪酸代谢基因簇对水稻产量的调控机制
与已报道的植物代谢基因簇负责合成相比,FGC3由编码合成酶及转运蛋白的基因构成,同时控制合成及转运,进而调控角质单体羟单酰甘油(HMGs)的含量和水稻产量。同时该研究还鉴定到2个转录因子OsMADS6和OsMADS17调控这一关键代谢过程。图1FGC3的定位研究发现HMGs依次由OsFAR2、OsKCS11、OsGPAT6、OsCYP704B2在内质网中合...
Nature连发10篇论文:曾红葵/庄小威/何志刚/任兵/王潇等绘制小鼠...
通过迭代聚类和与全脑转录组和染色质可及性数据集的集成,构建了一个基于甲基化的细胞分类体系,包括4673个细胞组和274个跨模态注释的亚类。发现了全基因组中260万个差异甲基化区域(DMRs),代表潜在的基因调控元件。全脑细胞类型比较使构建包含转录因子、调控元件及其潜在下游基因靶点的调控网络成为可能。最后,基因内DNA...
...等构建迄今最为全面的哺乳动物全脑甲基化和三维基因组的分子图谱
通过整合包含四个组学数据的数据集,研究人员构建了一个全脑基因调控网络——其中包括转录因子(TranscriptionFactor)、调控元件(CisRegulatoryElement)及其潜在下游基因靶标(TargetGene)的全脑调控网络(www.e993.com)2024年10月23日。主要方法是,利用基因上mCH甲基化和基因表达负相关、以及DMRs上的mCG甲基化和染色质可及性负相关的关系,计算出...
中国菰米花青素合成 关键调控基因找到
“从生物强化的角度挖掘中国菰米花青素合成的关键基因,对于选育功能型水稻品种具有重要意义。”论文通讯作者、中国农业科学院副研究员闫宁告诉记者。本研究在系统鉴定中国菰米转录因子家族的基础上,通过基因组共线性分析,克隆到两个花青素合成的关键调控基因ZlMYB1和ZlMYB2。其超量表达能够显著提高水稻种子总黄酮、总花青素...
血管内皮细胞机械敏感基因在动脉粥样硬化形成和治疗中的研究进展
LF激活NRF2的表达,这对内皮细胞适应氧化应激和亚硝化应激很重要。此外,KLF2和NRF2可协同调节LF诱导的内皮基因表达。因此,了解NRF2基因活性和下游通路的调控对人类健康具有重要意义。ID1分化抑制剂1(ID1),又称DNA结合抑制因子,属于螺旋-环-螺旋(HLH)转录因子家族成员之一。ID1可能通过炎症和血管...
Plant Cell | 武汉大学杨红春课题组揭示转录因子相分离调控水稻...
转录调控是真核生物发育过程中不可或缺的基因表达调控机制。转录因子通过调控基因表达,控制植物发育。液-液相分离(liquid-liquidphaseseparation)在细胞内形成无膜的细胞器,参与细胞内众多活动并调控许多发育过程。越来越多的研究表明,转录因子的相分离在基因调控中起着至关重要的作用。然而,对于哪些转录因子具有相分离...
.../陈嘉瑜揭示小鼠早期胚胎发育中以TFAP2C为核心的转录因子调控...
小鼠早期胚胎发育过程中以TFAP2C为核心的代谢、表观印记和遗传信息三元调控模型综上所述,该研究工作不仅刻画了转录因子TFAP2C的全基因组结合图谱,鉴定并验证了其下游转录因子TEAD4和KLF5,还从代谢、表观印记和基因组突变三个不同角度证明了其对转录因子结合的影响,刻画了以TFAP2C为核心的转录因子调控网络,为转录因子...