...AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质结构...

他的研究重点是蛋白质结构的预测和设计、蛋白质折叠机制、蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-核苷酸相互作用以及蛋白质-配体相互作用。他通过实验来理解这些问题背后的基本原理,并基于这些见解开发简单的计算模型,还通过结构预测和设计来测试模型。近年来,Baker团队开发了可用于蛋白质结构预测的RoseTTAFold,该算法已扩展到...

上海应用技术大学2025考研招生入学考试大纲:846食品化学

蛋白质的组成、结构与分类,蛋白质在食品中的化学变化及对食品质量的影响,蛋白质在食品中的功能性质及对食品品质的影响。本章要求:1.了解氨基酸、多肽和蛋白质的结构和性质2.理解天然蛋白质的晶体结构及维持其结构的作用力3.掌握蛋白质的变性机理、影响因素及其对食品品质的影响,控制蛋白质变性的措施4.掌握...

英国学者Cell子刊:蛋白质也会老,原因在于它?这3个过程需关注

近期,1区TOP期刊TrendsinCellBiology刊登英国学者观点:翻译过程异常是衰老中蛋白质稳态丧失的核心原因[1]。图注:翻译是老龄化过程中蛋白质平衡的新制约因素支持细胞结构形成、参与多种物质转运和信号传导,身兼数个重职的蛋白质,首先要做的是保证自己一切正常,比如结构折叠正确、完成匹配功能的翻译后修饰[2]。

AI 填补蛋白质设计一大空白,或揭秘癌症、痴呆症发病机制,促进新药...

该算法利用粗粒度模拟和自由能计算,结合蒙特卡洛采样方法,在序列空间中进行搜索,生成具有目标结构特征的蛋白质序列。研究人员使用该算法设计了多种蛋白质变体,并对其进行了实验验证,结果表明该算法能够有效地设计具有不同紧密度、长程相互作用和相分离倾向的蛋白质变体。该算法通过搜索序列空间,并使用高效的粗粒度模拟将...

...郭增旺副教授等:乳脂肪球膜的结构特性及其体内代谢研究进展

SM中具有较长的饱和脂肪酸链,脂肪酸链间的范德华力导致SM具有极高的相变温度,分子间作用力极强,可以形成紧密的排列。脂筏的组成和结构特点有利于膜蛋白之间的相互作用和构象的变化,在信号转导和转运中起主导作用。1.1.2MFGM的蛋白组分MFGM中蛋白质约为25%～70%,占总乳蛋白的1%～4%,借助蛋白质组学分析...

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道(www.e993.com)2024年11月25日。“所有事情都在这里发生。”细胞通过将称为氨基酸的小分子串成长长的多肽链来制造蛋白质。选择哪种氨基酸取决于DNA提供的指令集。在生成后的瞬间,多肽链精确地弯曲、折叠成蛋白质的最终三维形状。一旦离开分子装配线,它就迅速开始执行其生...

AI 对科学探索推动的边界在哪?蛋白质、气象等领域专家共话AI4S |...

基因表达调控等比蛋白质结构预测更难一些,其中数据量少就是一个原因。临床数据和医学数据通常集中在医院和制药公司内部,由于商业价值高,这些数据并不容易公开共享。然而,为了推动生命科学和AI的发展,打通不同机构之间的数据壁垒,实现数据的标准化和共享变得尤为重要。通过体制优势和跨机构合作,推动数据标准化和共享,是...

填补AlphaFold3空白,字节跳动提出物理引导的方法让蛋白质动起来

造成现有模型难以预测动态构象分布的主要原因是,蛋白质结构数据集仅有实验解析的单一静态结构或结合态结构,结构数据集的偏置导致了模型难于预测真实的分布。另一方面,物理知识的缺失导致模型无法模拟分子动力学行为,从而与真实世界对齐。在此,来自字节跳动ByteDanceResearch的研究人员提出了一种物理信息引导的蛋白质构象...

疟原虫和弓形虫微孔的蛋白质组成及其潜在机制

基于微孔蛋白组分的荧光显微镜数据和缺陷后的电镜结构,该综述提出了I型微孔形成的关键事件顺序(图4)如下:首先内膜复合体形成一个孔;随即质膜在孔内形成一个标准的杯状内陷;最后形成完整的EDRs结构。主要证据是EPS15、K13和UBP1的敲降分别导致内膜复合体缺少孔且异常内陷,质膜内陷过大或缺乏以及微孔开口过宽等[5,...

突破AlphaFold3预测局限,超算安腾让科学家看到动起来的蛋白质

首先,由于分子动力学模拟计算的参数输入需要的正好就是蛋白质的静态构象文件(PDB文件等),因此通过AlphaFold3预测出来的大量蛋白质静态结构正好可以作为分子动力学模拟计算的输入,通过AlphaFold3+分子动力学模拟的组合拳,科学家和制药学家可以针对想要研究的生物现象或潜在的成药靶点和成药分子,在AI模型里面进行自由的探索和...