打破传统蛋白质进化方法局限性:MIT团队设计新型蛋白质大模型,发现...

此前，他在工程CRISPR系统进行研究，利用理性工程和结构生物学来指导蛋白设计，发现在真核生物及其病毒中广泛存在可编程的RNA引导的DNA内切酶，并展示了III-E型CRISPR核酸酶-蛋白酶通过RNA触发的蛋白质切割和细胞生长抑制[3-4]。凭借“利用生物多样性与机器学习技术开发细胞工程技术工具箱，在疾病治...

让李子柒严重过敏的物质,是你买不到带壳腰果的原因

漆酚为淡黄色油状液体,化学结构多样,主要由不同烃链长度的儿茶酚类组成。接触漆酚后,最常见的表现是皮炎。目前研究认为,这种皮炎是一种变应性接触性皮炎反应,属于过敏反应。这不同于由物质直接刺激导致的皮炎,如接触硫酸引起的损伤。因此,只有对漆酚过敏的人,接触漆酚后才会出现严重皮炎。据估计,50%至75%的...

华中农大近期科学研究进展

综上所述,本研究解析了植物免疫受体MIK2识别自身分泌的SCOOP小肽以及尖孢镰刀菌来源的SCOOPL小肽的结构基础,并阐述了蛋白质N-糖基化修饰可直接介导植物细胞膜表面受体复合物组装,激活免疫响应的全新作用机制。华中农大生命科学技术学院博士研究生吴慧敏、万里豪及美国密歇根大学分子、细胞和发育生物学系的博士后刘尊勇为...

AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光

人类现在已知组成蛋白质的氨基酸有20余种,如果它们可以以任意顺序和长度链接、并折叠形成不同的蛋白质,那么理论上可能存在的蛋白质数量会达到约10^1300,比整个宇宙中的原子数量还要多很多倍,功能更是因此丰富而复杂。换言之,理想的情况下,如果我们可以测清氨基酸在组成蛋白质时折叠构成的三维结构,就可以了解清楚蛋白...

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

一旦多肽链组装完成,蛋白质就可以在千分之一秒内折叠成自己的结构——这让分子生物学家CyrusLevinthal感到困惑。在他于1969年发表的论文HowtoFoldGraciously中,他计算出,如果一个蛋白质要尝试每一种可能的折叠方案,其组装时间将长得不可想像。他认为,显然有某种机制可以更直接地引导蛋白质走向正确的折...

“地下”蛋白:菌丝体发酵技术

内容来源:2024年6月27日,InfiniteRoots创始人兼CEOMazenRizk博士于FBIF2024科技创新分论坛,进行了题为"‘地下’蛋白:菌丝体发酵技术"的演讲(www.e993.com)2024年11月24日。你是否想过,有一种蛋白质,来源于埋藏在地下的蘑菇根部,具有天然的"类肉"结构,甚至可以保护环境?来自德国的科技公司InfiniteRoots利用发...

马剑鹏:“如果没有今年的化学奖,可能就没有物理学奖”

原因很简单,因为蛋白质结构已经有几十年的发展史,很多代的科学家做实验积累了很多的数据。有个数据库叫PDB(proteindatabasebank)提供了很多蛋白质结构的准确信息,才有可能让AI去学一把。所以这个蛋白质结构数据就建得比较好,这是数据驱动(datadriven)的科学问题。

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生_腾讯新闻

一旦多肽链组装完成,蛋白质就可以在千分之一秒内折叠成自己的结构——这让分子生物学家CyrusLevinthal感到困惑。在他于1969年发表的论文HowtoFoldGraciously中,他计算出,如果一个蛋白质要尝试每一种可能的折叠方案,其组装时间将长得不可想像。他认为,显然有某种机制可以更直接地引导蛋白质走向正确的折叠路...

北京好年华于建华:是谁偷走了你的胶原蛋白

当阳光照到脸上的时候,紫外线会加快皮肤中的破坏酶的产生,同时产生大量的自由基,从而破坏胶原蛋白形成的网状结构,使之断裂、分解,胶原蛋白随之流失。三、糖化、氧化羟基化酶是胶原蛋白合成的必要“工人”,它会因为自由基和身体的糖化反应失去活性,导致胶原蛋白合成原料短缺,从而降低胶原蛋白的生产效率。

DMFold:精确到氨基酸的互作蛋白结合位点预测分析工具

今天要分享的是由密西根大学张阳教授团队开发的蛋白质互作结构预测工具DMFold(httpszhanggroup/DMFold/),免费的,可以直接在网站内提交蛋白质氨基酸序列,约2-5天出结果,分析结果的链接会发送到提交的邮箱中。分子生物学相关研究中,蛋白质互作经常会涉及到,通过Co-IP、酵母双杂交、GST-pulldown、BiFC、荧...