填补AlphaFold3空白,字节跳动提出物理引导的方法让蛋白质动起来
造成现有模型难以预测动态构象分布的主要原因是,蛋白质结构数据集仅有实验解析的单一静态结构或结合态结构,结构数据集的偏置导致了模型难于预测真实的分布。另一方面,物理知识的缺失导致模型无法模拟分子动力学行为,从而与真实世界对齐。在此,来自字节跳动ByteDanceResearch的研究人员提出了一种物理信息引导的蛋白质构象...
Cell | 结构之美:探索结构生物学的真相与幻象
重组蛋白质通常在体外表达和纯化,这可能会导致缺乏或错误的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化,这些修饰在调节蛋白质功能中扮演着关键角色。此外,体外环境缺少细胞内的相互作用网络,这可能会影响蛋白质的结构稳定性和活性。因此,虽然重组蛋白提供了一个便利的工具,但它们的使用需要谨慎,以避免对蛋白质功能的误解。结构生物...
Nature Methods | 张阳团队开发远超AlphaFold2精度的蛋白互作结构...
并且,因为技术上的限制(如结构的稳定性以及高阶复合物的尺度等),某些蛋白质相互作用的结构并不能通过传统的结构生物学实验手段获得。近年来,随着AlphaFold2等AI算法在蛋白质结构预测问题上的突破,通过计算手段获得高质量的蛋白质及复合物结构已经成为可能。然而,目前绝大多数AI算法都是通过对已知蛋白结构和基因进化关...
《食品科学》:哈尔滨工业大学王振宇教授等:食源性蛋白酪氨酸磷酸...
瘦素是一种分泌性蛋白类激素,主要由脂肪组织产生和分泌,以单体形式存在于血浆中。瘦素与瘦素受体结合后使Janus激酶2(JAK2)磷酸化,从而将信号传导至下游信号分子——信号传导与转录激活因子3(STAT3)来调节机体的物质和能量代谢。瘦素还能够刺激脂肪酸的氧化和胰岛素的释放。PTP1B使经瘦素活化的JAK2去磷酸化而失活,进而...
景书谦点评 | GPCR药物研发:繁花似锦,未来可期
GPCR的功能多样性GPCR根据其结构和功能特点可分为A类、B类、C类、F类和T类。A类GPCR即视紫红质样家族,是占比最大、研究最广泛的超家族。A类GPCR可按功能进一步分为胺类、肽类、蛋白类、脂类、褪黑素类、核苷酸类、类固醇类、二羧酸类、感觉类和孤儿类亚群,其对应的适应症范围从高血压、心血管疾病、肺部疾病...
为什么只有一颗精子进入卵细胞?最新《细胞》找到了关键原因!
一支联合研究团队首先结合X射线晶体学和冷冻电镜,对ZP蛋白的三维结构展开研究(www.e993.com)2024年7月10日。我们知道,蛋白质的两端分别是含氮的氨基端(N端)和含碳的羧基端(C端)。对于ZP家族蛋白,不同成员的功能多样性取决于其N末端区域(NTR)结构,其中包含了不同数量与种类的蛋白质结构域。
蛋白sumo化的分子机制:探索修饰的多样性与重要性
3.SUMO化修饰的多样性SUMO化修饰具有多样性的特点,表现在以下几个方面:(1)多个修饰位点:一个目标蛋白可以在不同的赖氨酸残基上发生SUMO化修饰,这种多位点修饰可以进一步调节蛋白的功能和相互作用。(2)多重修饰形式:同一个蛋白质可以同时被多个SUMO蛋白修饰,形成多重SUMO化修饰,进一步增加了修饰的复杂性和多样性...
单身狗暴击!谈恋爱能减重?绿瘦教你如何甜蜜享「瘦」
油脂是高热量的食物,过多的摄入会导致热量的过剩。在减重期间,可以适度减少食用油的用量,选择健康的油脂来源,如橄榄油、亚麻籽油等。5.饮食结构的多样性为了获得各种营养物质,保持饮食结构的多样性是非常重要的。绿瘦营养顾问建议将饮食结构分为主食、蛋白质食物、蔬菜水果和其他辅助食品,确保每一餐都包含各种不...
专访姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组学?
据我们所知,目前全球范围内尚无其他团队或企业开展与我们完全相同的工作。其他机构主要在进行单细胞转录组或蛋白质结构的研究,这些研究当然也很重要,但我们的工作填补了单细胞蛋白组学领域的一个空白,具有创新性和前瞻性,未来必将吸引更多研究聚焦于此领域。
构建心律之桥:揭秘肠道微生物与心律失常之间的联系
房性心律失常:包括房性早搏、房性心动过速、房室折返性心动过速、房室结折返性心动过速、房扑、房颤等;交界性心律失常:包括交界性早搏、交界性心动过速、房室传导阻滞等;室性心律失常:包括室性早搏、室性心动过速、室扑、室颤、室内传导阻滞等;