Nat Commun | 张赫团队揭示DNA-lncRNA三链体“招募促癌”新机制
为了研究DNA-lncRNA三链体在肿瘤发生中的作用和调控机制,首先确定了此前课题组发现并命名的促癌lncRNAGAU1作为三链体候选分子。通过预测发现,GAU1在整个基因组中有48,086个三链体潜在形成位点。利用ChIP-qPCR技术,还发现在肿瘤细胞中,GAU1的启动子区域有大量的p300蛋白富集,引起GAU1启动子区域的H3K27乙酰化水平...
沃信VOSHIN07-IIC:紫外交联仪可用于DNA和RNA及核酸凝胶电泳等
一、DNA和RNA研究DNA印迹杂交实验:紫外交联仪常用于此类实验中,通过紫外线照射使DNA变性并固定在膜上,进而与特定的探针进行杂交,以检测和量化DNA样品中的特定序列。这种方法在基因表达分析、遗传病诊断、基因多态性研究等方面具有重要意义。RNA分析:紫外交联仪也用于将RNA固定在膜上,以便进行后续的杂交和分析,如Nort...
...上发文揭示DNA-lncRNA三链体“招募促癌”新机制-同济大学新闻网
DNA-RNA三链体是双链DNA与单链RNA相互作用形成的异源三链杂交体,在DNA-RNA三链体形成过程中,单链RNA与富含嘌呤的双链DNA通过碱基互补配对,利用Hoogsteen氢键形成并维持三链体的稳定性。已有研究报道表明,DNA-RNA三链体广泛参与基因表达调控、DNA损伤修复、染色体稳定维护和肿瘤发生发展等多个重要的生理和病理过程。...
新应用 │ 国自然新热点:R-loop CUT&Tag实验指南
而R-loopCUT&Tag实验,建议额外增加一种阴性对照:先加入RNaseH或RNaseA消化R-loop中的RNA链,此时R-loop的丰度大幅减少或消失,再加入一抗S9.6,则S9.6抗体的结合减少或不能结合,信号相比阳性样本减少或消失,从而发挥了阴性对照的作用,以此说明阳性信号的真实性。部分高GC的DNA-RNA杂交体对RNaseH具有抗性,因此...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
在short-readRNA-seq建库前利用唯一分子标识符(UMI)标记cDNA分子,从而解决短读长问题做到测序全长mRNA。基于这个技术可以对长达4kb的转录本异构体进行鉴定和定量。从根本上解决short-cDNA测序固有限制的最有效的方法还是long-readcDNA测序和dRNA-seq方法。
Nature子刊:同济大学张赫团队揭示DNA-lncRNA三链体“招募促癌”新...
该研究率先揭示了肽基脯氨酰异构酶A(PPIA)指导的DNA-lncRNA三链体“招募促癌”机制,首次提出了异构酶辅助DNA-RNA杂交体形成的创新概念(www.e993.com)2024年11月3日。为了研究DNA-lncRNA三链体在肿瘤发生中的作用和调控机制,研究团队确定了他们此前发现并命名的促癌lncRNAGAU1作为三链体候选分子。通过预测发现,GAU1在整个基因组中有48086个...
沃信图文科普:紫外交联仪可用于修复DNA分子中的单链断裂
紫外交联仪在DNA和RNA研究中具有广泛的应用,主要体现在以下几个方面:一、DNA研究中的应用DNA印迹杂交紫外交联仪常用于DNA印迹杂交实验中,通过紫外线照射使DNA变性并固定在膜上,进而与特定的探针进行杂交,以检测和量化DNA样品中的特定序列。这种方法在基因表达分析、遗传病诊断、基因多态性研究等方面具有重要意义。
首次从灭绝生物中提取RNA,距离复活它还有多远?
但想要做到这一点并不容易,DNA在动物死亡后就开始分解,即便在最适合的环境下也只能保存约150万年,而RNA比DNA更脆弱,分解速度也更快,此前科学家们认为,RNA无法保存较长时间。报道强调说,这是生物学家首次从一种早已灭绝的生物中分离并解码了RNA。复活已灭绝动物思路不少...
...杂交法,可对临床样本的靶核酸(DNA/RNA)进行全自动化定性检测分析
公司基于微流控技术的HPV核酸芯片检测仪,检测原理是基于PCR-斑点杂交法,可对临床样本的靶核酸(DNA/RNA)进行全自动化定性检测分析。该仪器也可实现病原微生物(呼吸道、胃肠道、生殖道等)、人类基因检测(耐药基因检测、用药指导检测等)等项目,检测通量24人份,主要使用地点在医院、第三方检测机构等。公司的qPCR全自动...
Nat Commun | 张鹍团队开发多重RNA原位杂交技术DART-FISH,可准确...
DART-FISH是通过锁式探针捕获目标转录本和滚环扩增(RCA)来产生原位特征,然后通过序列等温杂交进行高度稳健的解码。为评估人体组织中的RNA含量以及cDNA分子的原位保留情况,研究团队在反转录引物上添加了一个5’handle,以使所有具有荧光寡核苷酸的cDNA分子可视化,并将这一方法命名为“RiboSoma”。此外,为实现高复用性,研...