金匙医学申请一种靶标病原或耐药基因多重数字PCR引物探针设计与...

专利摘要显示,本申请涉及生物信息学技术领域,具体公开一种靶标病原或耐药基因的多重数字PCR引物探针的设计与评估方法。本申请通过自定义算法先对单目标病原或耐药基因所有的引物探针进行评分和排序,然后按照逐次增加靶标数或重数方式添加单目标病原或耐药基因的较优引物探针,并评估每次增加引物探针后整个组合体系的二级结构...

达瑞生物取得一种MALDI-TOF质谱检测密集单核苷酸变异位点的引物和...

专利摘要显示,本发明公开了一种MALDI??TOF质谱检测密集单核苷酸变异位点的引物和探针的设计方法,通过本发明提供的一种设计MALDI??TOF质谱检测平台的密集SNV位点各突变类型特异性检测杂交探针的方法,利用该方法设计的引物,可以快速准确地对密集单碱基突变位点进行检测,对突变序列具有高度的特异性,并且能用于突变序列丰度的...

圣湘生物获得发明专利授权:“一种设计引物的方法、设备、可读介质...

本发明提供一种设计引物的方法,所述方法包括:S1、获取目标物种序列数据,构建序列数据集;S2、过滤短序列及序列比对;S3、根据所述碱基信息,重新构建兼并碱基的参考序列;S4、对所述S3所构建的参考序列进行引物模板筛选,设计引物。本发明的方法采用种子序列定位及延伸算法比对,其时间复杂度远低于多序列比对,耗时短,可以最...

北京大学申请基于深度学习的16SrRNA基因测序引物设计方法及系统...

确定符合测序平台要求的候选扩增区域用于引物设计,针对每个候选扩增区域确定对应的正向引物结合区序列集和反向引物结合区序列集,基于两种序列集分别进行多序列比对得到候选特异性引物对,最后筛选得到目标细菌群落特异性引物对。

从此再也不用自己设计qPCR引物了,包括66种植物3331426个基因引物...

但该方法的准确性和一致性与设计引物的特异性和扩增效率密切相关。虽然,qPCR引物可以人工设计,但该过程非常耗时,且很难保证引物的特异性、扩增效率一致性。该研究团队设计了基于热动力学的基因特异qPCR引物设计流程,并对人、小鼠、家蚕、斑马鱼、线虫、酵母、拟南芥、水稻、玉米和油菜等共147个已完成全基因组测序物种...

鹰谷InSequence序列编辑器新品发布,引物设计、序列比对软件,不止...

5、引物设计与质粒设计:内置引物设计和质粒设计模块,支持PCR、qPCR和测序引物的设计(www.e993.com)2024年11月18日。6、整合到鹰谷电子实验记录本中:InSequence同时具备客户端版和网页版,其中网页版已整合至鹰谷电子实验记录本中。InSequence免费下载:请搜索“上海鹰谷”访问鹰谷官方网站...

走进PCR小世界,常见问题知多少

一、引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。二、靶序列或扩增产物的交叉污染:整个基因组或大片段的交叉污染或者是空气中的小片段核酸污染。

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

其它方法如多聚腺苷酸位点测序(polyadenylationsitesequencing,PAS-seq)法,首先将mRNA打断为150bp左右的片段,然后使用带有oligo-dT的引物进行模板置换生成cDNA用于后续测序,其中的80%的测序序列来源于3??UTR。TAIL-seq则避免使用oligo-dT,RNA打断前,先移除rRNA,然后在转录本poly(A)尾巴连接3??接头。片段化...

2025天津医科大学《810生物学基础》全国硕士研究生入学统一考试大纲

二、引物设计的原则三、PCR的应用基因的功能分析一、基因表达的分析(1)mRNA表达分析:逆转录聚合酶链式反应、实时PCR和差异分析(2)蛋白表达分析:蛋白印迹和二维电泳二、功能的获得引入表达、瞬时转染、稳定转染、调节表达三、功能的缺失定点突变、反义RNA、RNA干扰...

基因工厂云探秘系列2--免费序列优化,提升载体构建成功率 解锁高效...

优化原则(1)密码子偏好性密码子适应指数CAI是指异源mRNA序列中密码子和宿主细胞最佳密码子使用频率相符合的程度,理论上此值越接近1,外源mRNA在宿主细胞中的蛋白表达越高,通常CAI<0.8时,被认为需要进行密码子优化。使用宿主细胞中使用频率高的同义密码子替换外源mRNA序列中的密码子,例如,在大肠杆菌中,某些密码子如...