从无数基因碎片中,寻找国人的“生命密码”
历经3年探索,2023年底《GenomicsProteomics&Bioinformatics》杂志正式发表了关于“唐尧”基因组的论文,这是首个“从头到尾”来自中国人的二倍体、无间隙全基因组参考序列,为具有汉族特征的中国人提供了基因组数据。2024年8月19日,北京大学人民医院人类基因组研究中心正式揭牌。“未来,我们的患者就可能接受更精准的...
2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密
第二步:利用这个工具,他们针对随机生成的一系列氨基酸序列进行结构预测,这些序列都是在自然界中未被观察到的。如果预测结果显示出合理的蛋白质结构,那么这条氨基酸序列就会被保留下来,反之则抛弃该序列。第三步:他们合成了那些成功折叠的氨基酸序列所对应的编码基因序列,并在实验室中制造出相应的蛋白质。然后,他们使用...
Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...
我们最初从所有公共参考基因组中收集了所有蛋白质序列(长度超过35个氨基酸残基),并在IMG/M平台上组装了宏基因组和宏转录组。我们总共从89,412个细菌基因组、9,202个病毒基因组、3,073个古细菌基因组和804个真核基因组中提取了所有蛋白质序列,最终得到了94,672,003条序列的数据集。本研究中的...
《基因彩票》第一部分第六章:大自然的随机分配
因此,我从母亲那里继承的染色体有百分之百独特的DNA序列,它由可以追溯到我外祖母或外祖父的交替片段组成。当我母亲的身体在制造成为我弟弟迈卡的卵子时,同样的过程也在上演。而这整个过程又进一步加倍,因为我们还有一个父亲。那么,如果你看一下我们从母亲那里继承的染色体上的任何一个点,迈卡有50%的机会继承了与我...
瞭望|警惕基因编辑“武器化”
基因编辑技术,则是以改变基因序列为目的,实现定点突变、插入或敲除的技术。借助该技术,人类能够根据自己的意愿来对目标基因进行“编辑”,有目的地删除或加入DNA片段,从而影响其功能或表型。从医学上讲,基因编辑技术将能够治愈许多疾病并延长人们的生命。比如,被称为“生物导弹”的分子靶向治疗技术,就是在分子水平上针...
成本下跌8个“0”!我的基因我来测,真的行吗?
1999年9月1日,杨焕明在第五次人类基因组测序战略会议上表示,中国有能力在2000年4月完成1%的任务,并递交了已经完成的人类基因组序列的70万个碱基对测序结果,让与会者相信中国有能力参与和完成申领的任务(www.e993.com)2024年10月16日。最终,中国得到完成人类3号染色体短臂上一个约30Mb区域的测序任务。该区域约占人类整个基因组的1%。“首先...
癌症研究五十年历程,这些里程碑你都知道吗?
这标志着癌症研究从关注癌细胞内部机制转向了更全面考量肿瘤与其微环境的相互作用。而只有通过全面考量肿瘤的复杂性,研究人员才有望把从基础生物学中学到的知识更好地进行临床转化。5.人类全基因序列初稿的完成2003年,伴随着多种高通量测序技术的诞生,全球的科学家们联手完成了人类全基因序列的初稿,标志着生物...
“青春痘”疫苗来了?!Nature:突破痤疮预防难关,可以从这个基因...
痤疮假单胞菌菌株被分为不同的系统型,这些系统型与痤疮的关联程度不同。基于全基因组序列的分析结果显示,系统分支IA-1、IA-2、IB-1、IB-2和IC与痤疮密切相关,而分支II与皮肤的健康程度紧密相关(图1a)。基于16SrRNA测序的皮肤微生物组分析显示,核糖体(RT)2/6与健康密切相关,而RT4/5与痤疮疾病密切相关(详...
《自然》2024最值得关注的七大技术:ChatGPT未入选
Baker实验室开发的RFdiffusion软件[3]以及马萨诸塞州GenerateBiomedicines开发的工具Chroma便是这种策略的集大成者。Baker团队使用RFdiffusion改造能与靶标形成紧密界面的新型蛋白,得到能与界面完美结合的设计,Baker说道。RFdiffusion的一种新型“全原子”迭代[5]让设计师能用计算机围绕非蛋白靶标(如DNA、小分子,甚至是...
【科学强国】2023年世界十大科技进展新闻揭晓
5月10日,《自然》杂志发表了人类泛基因组参考的“初稿”,在3篇论文的合集中,人类泛基因组参考联盟(HumanPangenomeReferenceConsortium)发布了首张人类泛基因组参考草图,以及两个以这一参考图为基础的新遗传学研究发现。2003年,科学家们宣布,人类基因组序列图谱绘制成功。2022年,首个完整人类基因组序列发布,填补了人...