突破瘦肉型种猪基因组育种技术 吴珍芳劳模创新工作室获省科技进步...
同时，还创新了高通量、低成本的基因组SNPs分型技术，创建了瘦肉型猪基因组育种技术体系，解决了基因芯片依赖进口的“卡脖子”技术难题。从引进基因芯片，到先后自主创建了简化基因组测序、固相芯片、液相芯片、低深度重测序四种基因组SNPs分型技术。获得我国首例采用基因组选择技术选育的杜洛克特级种公猪；率先创制出针对...
经典荟萃|近期植物泛基因组研究集锦
该团队基于前期的150份菠菜种质资源的亲缘关系，筛选出12份代表性材料，包括7个栽培种，2个与其亲缘关系更近的野生种S.turkestanica（分化时间～0.8百万年前）和3个亲缘关系更远的野生种S.tetrandra（分化时间～6.3百万年前）。结合前人发表的菠菜参考基因组，该团队利用13个菠菜参考基因组构建了泛基因组，...
华智视界:畜禽全基因组选择育种技术解决方案
全基因组选择首先要建立一个参考群体(或训练群体),对参考群体中每个个体都进行表型和基因型鉴定,通过合适的统计方法构建基于基因型的表型预测模型;然后对候选群体(或育种群体)每个个体进行基因型检测,利用参考群体构建的预测模型计算候选群体中每个个体的基因型估计育种值(GEBV,简称基因型育种值),根据基因型育种值排名...
超13万人大规模循环代谢标志物与全基因组关联研究
有研究将基因组学和基于核磁共振波谱的高通量代谢组学平台的详细代谢谱分析相结合,发现了数十个与循环脂质、脂蛋白和脂肪酸以及氨基酸等小分子相关的基因位点7。近日,来自芬兰奥卢大学的MinnaK.Karjalainen课题组在Nature上发表了研究论文Genome-widecharacterizationofcirculatingmetabolicbiomarkers,该课题组...
解决“卡脖子”难题,温氏一技术成果获广东省科技进步奖一等奖
同时,还创新了高通量、低成本的基因组SNPs分型技术,创建了瘦肉型猪基因组育种技术体系,解决了基因芯片依赖进口的“卡脖子”技术难题。从引进基因芯片,到先后自主创建了简化基因组测序、固相芯片、液相芯片、低深度重测序四种基因组SNPs分型技术。获得我国首例采用基因组选择技术选育的杜洛克特级种公猪;率先创制出针对瘦肉...
Nat Genet | 黄三文院士高度评价北京大学现代农学院西瓜驯化史研究
与SNPs相比,SV对基因组多态性和功能基因变异的影响更大(www.e993.com)2024年11月20日。通过将27个新基因组与G42参考基因组比对,将>20bp的SV分为缺失、插入、重复、倒位和易位5类。所有461,987个非冗余SVs包括217,076个(46.99%)缺失,239,698个(51.88%)插入,3,122个(0.67%)重复,1,278个(0.28%)倒位和813个(0.18%)易位(图3a)。当...
迪安诊断泛癌种实体瘤Panel OncoPrime再升级!
OncoPrimeTMv2.0通过分析检测到的单核苷酸变异(SNVs)和小片段Indels得到潜在的突变肽段,并对突变肽段以及相应野生型肽段与HLA的亲和力进行预测,同时计算Neoantigen分值,最后在报告中筛选出得分较高的肿瘤新抗原进行展示。迪安诊断临床基因组中心迪安诊断是国家首批肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床应用试点单...
Cancer Cell | 2万字长文综述全面总结p53领域研究进展
p53SNPs:twinsaredifferentP72R多态性是p53研究最广泛的SNP。与R72变体相比,P72变体诱导细胞凋亡的能力较弱,因此与R72变体相比,其个体寿命更长,但癌症死亡率更高。然而,也有报道称,携带R72变体的小鼠比P72的小鼠表现出更高的代谢功能障碍倾向,但它们也表现出雌性胚胎着床率的提高。p53基因中还有一些种族特异...
NPJ PD:珠江医院王青团队报道视网膜厚度与帕金森病非运动症状的关联
并采用了一系列质量控制步骤对SNPs进行筛选,包括:挑选全基因组关联性显著的SNPs(P值图1所示。图1.孟德尔随机化分析流程图(图源:HangZhouetal.,NPJParkinson’sdisease,2023)SNPs工具变量特征根据图1所示流程筛选SNPs后,用于进一步分析的与RNFL或GCIPL厚度相关的SNPs数量介于7到21个。所有SNPs的F...
Cancer Cell:顾伟/刘彦卿等2万字长文综述全面总结p53领域研究进展
另一方面,未能消除受损细胞会导致基因组不稳定。p53的缺失,包括失杂合性(LOH)和双等位基因失活或缺失,会促进基因组不稳定并驱动肿瘤细胞基因组的进化。p53被誉为“基因组的守护者”。p53可以直接促进DNA伤修复。事实上,许多p53靶基因有助于DNA修复过程。然而,目前仍不清楚p53介导的这些DNA修复相关靶基因的激活是否...