AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴
在蛋白质结构预测领域,Folding@Home便是一项知名的“模拟派”项目,它由斯坦福大学教授VijayPande于2000年发起,联合全世界志愿者的计算机来构成一个超大的分布式计算机,它同时也是全世界第一台exaflops级别(每秒进行1018次双精度浮点数计算)的超级计算机。这样强大的算力使得Folding@Home能够对蛋白质折叠过程进行原子...
深入解析蛋白质表征研究的实验步骤
由于生物体内蛋白质的复杂性,需要通过一系列的纯化步骤将目标蛋白质从其他杂质中分离出来。常用的纯化方法包括离心、层析、电泳等。离心可以根据蛋白质的大小和密度进行分离,层析则可以根据蛋白质的特性选择合适的分离介质,电泳则可以根据蛋白质的电荷和大小进行分离。步骤二:蛋白质结构预测在蛋白质表征研究中,蛋白质结...
关于公示北京市绿色低碳先进技术推荐目录(2024年)的通知
3绿色低碳能源无骨架天然气滤芯结构该技术应用于国内高压天然气站场天然气净化产品中,技术核心是使用不同精度的高分子化纤材料通过新型一体制造工艺复合而成的梯度型过滤本体,其滤材替代了传统的玻璃纤维滤材,滤芯内部支撑金属骨架移装至过滤分离器内部成为可重复使用部件,滤芯本体无金属成份,高效低阻、拆装高效快捷、...
AI 对科学探索推动的边界在哪?蛋白质、气象等领域专家共话AI4S |...
蛋白质工程是通过优化蛋白质中5-20个位点的特定性质,以实现其在工业、医药等领域的应用。目前,主要采用以下两种方式来实现这一目标:1.理性设计/半理性设计:通过结构解析和氨基酸改造来优化蛋白质性能,但耗时长且改造区域受限;2.定向进化:通过高通量随机突变和筛选找到符合应用需求的蛋白,但成本高、耗时长且效率...
「AlphaFold 3」要来了?DeepMind推出新一代蛋白质结构预测工具,已...
第一大升级:预测蛋白质数据库(PDB)中大多数分子类型的结构,达原子精度。根据DeepMind的说法,AlphaFold可以预测蛋白质数据库(一个广泛使用的科学数据库)中几乎所有分子的结构。DeepMind声称,该模型通常以“原子精度”生成这些预测。AlphaFold新版本不仅可以估计蛋白质的形状,还可以估计其他生物分子的形状。包括:小分子...
复旦团队开发新型AI算法“看清”蛋白质精细结构,可与AlphaFold...
该算法不但能够成功地解析冷冻电子显微镜(Cryo-EM)结构解析技术中因传统方法无法分辨而缺损的生物大分子(比如蛋白质、核酸或蛋白质/核酸复合物等)结构,并且高效精准地分辨出柔性结构域在受测样品中的构象分布(www.e993.com)2024年9月16日。这一新方法能有效建立高精度的生物大分子结构模型,帮助解决药物设计中因目标蛋白结构不准而导致的新药研发...
人工智能终结了蛋白质研究吗?一文读懂蛋白质折叠的前世今生
蛋白质是具有数亿种不同结构的分子。每一种都具有特定的生物功能,有些负责在血液中输送氧气,有些则负责引发化学反应。具体功能通常由其形状或结构决定。上:从左往右依次为SARS-COV-2刺突蛋白、新冠疫苗靶点;5-羟色胺受体、管控情绪与消化;血红蛋白、输送血液中的氧气;细胞因子、调节免疫防御。
2024 AI+蛋白质行业研究报告|智药研究
2021年7月,DeepMind开源了AlphaFold2.0,并推出了一个包含350,000种三维蛋白质结构的数据库。几个月后又公布了另一个包含2亿种蛋白质结构的数据库,几乎覆盖了所有科学上已知的蛋白质。这一进展几乎颠覆了传统蛋白质研究的方式,将解析一个蛋白质结构的时间缩短了十万倍。
为什么说想了解AI+合成生物学,必须先搞懂蛋白质?
在过去60多年的历史中,科学界最开始主要利用名为“合理设计”的方法来解析蛋白质。这种方法需要先根据蛋白质实际3D结构对蛋白质进行建模,再识别出可能影响蛋白质功能的氨基酸,解析水平严重受限于相对稀缺而难于得到的可分辨3D蛋白质结构。为了获得更多可分辨的3D蛋白质结构,蛋白质结构生物学应运而生。
Cell | 结构之美:探索结构生物学的真相与幻象
作为一种先进的人工智能算法,AlphaFold2能够预测蛋白质的三维结构,其准确度令人惊讶。这一技术的成功应用,不仅为那些难以通过传统方法解析结构的蛋白质提供了新的希望,也为药物发现提供了新的思路。通过高精度的结构预测,研究人员可以更快速地识别潜在的药物靶点,加速药物设计和筛选过程。然而,尽管AlphaFold2的预测结果...