云南省农业科学院农业环境资源研究所2024年至2026年基因测序采购...
最高限价(万元):100采购需求:标的名称:基因测序1批检测类别为:基因组测序(细菌基因组测序、真核生物基因组(500M)),转录组测序(真核转录组)、微生物测序(16S/18S/ITS扩增子、宏基因组测序)、常规分子项目(Sanger测序、引物合成、菌种鉴定)、绝对定量(绝对定量实验)、转录组测序(互作转录组测序)、植物全基因...
鸭茅基因组测序完成 我国牧草“生命天书”被破译
“我们旨在建立一个质量较好的鸭茅基因组数据库,因为其相关质量指标是黑麦草基因组的50倍以上。”该论文第一作者黄琳凯称,“这些特有基因大多和草类植物适应能力强、抗旱耐寒相关,通过比较发现鸭茅和小麦较为近缘。因此,这些基因资源也可用于近缘作物小麦抗寒、抗旱等品质的遗传改良技术中。”如今,鸭茅基因组数据库已...
第十一届全国功能基因组学高峰论坛会议通知
本会场汇集顶尖学者,通过主题演讲传递植物多组学最新研究成果,交流先进技术和宝贵经验,共绘植物多组学未来蓝图。动物多组学应用研究会场:在数据驱动的科研新时代,动物多组学技术(如三代基因组/转录组测序、HIC以及时空组学)迅速发展,已经为动物基因组学和功能研究带来了革命性的进步。如何充分利用这些大数据资源,深入挖掘...
昆明植物所成功解析茶果樟的全基因组
其基因组大小为1.06Gb,contigN50长度92.10Mb,约99.92%的组装序列可以定位到12条染色体上(2n=24),组装结果仅1个gap,同时共注释发现30497个基因,其中28681个基因为蛋白质编码基因。基于该研究结果,团队在国际期刊ScientificData在线发表了题为Chromosome-levelgenomeassemblyofthethreatenedresourceplant??Cinn...
首个对叶榕完整基因组发布为榕属植物性别演化提供重要资源
对叶榕是一种广泛分布于我国南方的植物。近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队发布首个对叶榕的完整基因组,修正了此前学界对其基因组测序绘制中存在的大量间隙和组装错误,大幅提升了对叶榕基因组的连续性、完整性和准确性,为榕属植物性别演化提供了重要资源。
神奇植物在哪里?华大破译植物基因组超700种,助力多样性保护
作为EBP的发起方之一,华大在该项目中承担了多个子项目,成果累累(www.e993.com)2024年9月11日。截至2024年2月,华大已完成超四千个物种的基因组测序组装,占全球贡献值38%以上。其中,破译动物基因组累计全球贡献值占比约41%、植物基因组累计全球贡献值占比约38%,成果发表于Nature及其系列子刊,Science及其系列子刊和Cell等。
辰山植物园药用植物与健康组发表黄芩T2T gap-free基因组
黄芩(图1A)拥有丰富的黄酮类化合物,具有良好的药物活性,作为药用植物在我国已有数千年使用历史。高质量的基因组将为黄芩分子生物学及代谢生物学提供重要信息,然而,目前已报道的黄芩基因组仍存在大量的间隙(gap)和碱基错误,影响了后续基因功能的研究。本研究结合PacbioHiFi、ONTultra-long和Hi-C等测序技术...
10年将基因组测序成本降至100美元!华大智造韦炜:生命健康永远是...
华大智造的努力让人人都拥有自己的基因组成为可能,但在过去,这需要高昂的费用——在2003年,需要高达到38亿美元完成一个人的全基因组测序。2023年2月,华大智造推出超高通量测序仪T20后,人类单个人全基因组测序成本降低至100美元。从公开数据来看,华大智造的主要竞争对手测序成本为200美元。图源:华大智造据...
Nature Commun | 中科院植物所焦远年团队开发基因组组装质量评估...
此外,一些reads比对还会出现明显的“clippedmapping”的特征(测序片段的一部分比对到基因组特定位置,但另一部分无法比对或比对到基因组其他位置),这通常暗示了组装的基因组序列存在嵌合片段(misjoin)。因此,通过检测原始reads在组装基因组上的比对特征,我们可以准确检测到基因组中的组装错误位点或区域,为基因组组装质量...
抗癌第一本草-苦参基因组公布了!
揭秘苦参基因组(一)基因组测序、组装和注释2023年8月29日振东中-澳分子中医药学研究中心DavidL.Adelson教授团队、屈志鹏、王伟博士发表在《ScientificData》(自然科学Nature旗下期刊,IF=9.4)上的《药用植物苦参染色体水平基因组组装》。DavidL.Adelson教授表示大部分中药是基于中国人的传统经验,中药在一些治疗过程中...