经典入门 | 高级转录组分析和R数据可视化 (2024.12)

转录组是很常规的分析,也是入门高通量测序分析的基础。这部分涵盖整个高通量测序技术的应用,高通量测序技术的实验原则包括测序通量、测序批次、测序原理等。转录组学研究技术介绍转录组学实验设计和测序原则、注意事项转录组学文章案例分析在线基因表达资源数据库转录组分析流程实战基于比对的差异基因分析转录本组...

快速、稳定、高性价比,揭秘博奥晶典国产自研单细胞转录组平台...

其中,单细胞转录组测序可以揭示细胞间的异质性,鉴定及发现新的细胞亚群,对于理解组织中不同细胞类型的功能至关重要,为解决临床问题提供了有力支持。随着技术的迅速发展,通量不断提高,成本也不断降低,这使得越来越多优秀的单细胞测序平台涌现出来。作为国内最早引入单细胞技术进行研究与应用的机构,博奥晶典在单细胞组学...

Genome Biol | 突破传统直接RNA测序局限!新方法可同时检测多类...

综上,NERD-seq能够同时研究脑组织及其他组织中的mRNA和ncRNA表观转录组。02NERD-seq方法标准的直接RNA-seq方法依赖于poly(A)选择,可对poly(A)转录组(主要是mRNA)进行测序,但无法有效检测没有poly(A)尾的短ncRNA。为改善这一局限性,同时保持对poly(A)转录组进行测序的能力,研究团队开发了一种名为NERD-seq...

肺发育的奥秘,快来了解下吧!Cell Research,单细胞RNA测序解锁肺...

空间转录组技术则有助于确定这些细胞在体内的确切位置,这对于指导细胞移植和组织重建具有实际意义。临床应用与展望从临床角度看,单细胞RNA测序与空间转录组技术通过精确定位基因表达变化,促进了肺疾病如先天性肺发育不良和慢性阻塞性肺病的深入理解,有望催生更精准的诊断与治疗方案。这两项技术不仅推进了基础科学研究,...

中国生命科学领域的又一台光刻机:华大集团发布纳米孔基因测序仪

它能用于数据通量需求更高的应用场景，比如用于大基因组、人基因组重测序、全长转录组测序和表观遗传学检测等。华大集团表示，WY01的多项关键性能均处于全球领先水平，故能加速相关疾病的研究和诊断，促进跨学科研究合作，并能支持生物多样性和生态学研究，它的出现填补了国内纳米孔测序领域高通量芯片的空白。另据...

用单细胞与空间转录组测序技术解析膝关节骨性关节炎软骨细胞异质

关节骨性关节炎患者和正常对照软骨细胞的空间不同分层细胞景观,研究人员接着对4例骨关节炎患者中WB与NWB,以及1例正常对照样本膝关节软骨进行了空间转录组测序(Geo-seq)数据分析,即对软骨组织中的软骨膜(AS)、表层(SZ)、中层(MZ)及深层(DZ)的软骨细胞进行测序分析,构建了KOA患者与正常对照膝关节软骨的空间转录组...

华大集团发布中高通量纳米孔测序产品,由旗下华大智造全球经销

WY01是一台高通量纳米孔测序仪,配套高通量高密度芯片,不仅具有超长读长和持久续测等性能,更能够全面覆盖复杂基因组序列。该产品填补了国内纳米孔测序领域高通量芯片的空白,可应用于数据通量需求更高的应用场景,比如大基因组、人基因组重测序、全长转录组测序和表观遗传学检测等。

北京医院张瑞团队:首次揭示真实世界多中心转录组测序的研究结果

转录组测序(RNA-seq)为探索全球表达模式,以及识别可变剪接事件,拓宽了新途径。转录组学数据的差异表达分析,能够全基因组鉴定与感兴趣的生物学条件相关的基因或亚型表达变化。这极大地促进了疾病诊断生物标志物的发现、预后和治疗选择。这些证据有助于RNA-seq在临床常规中的应用。

...叠满的粘膜相关不变T细胞(MAIT)检测:多色流式+单细胞转录组+...

而通过带有oligo寡核苷酸的抗体能够在单细胞测序实验中同时细胞表面marker和全转录组检测,所以本文在BDRhapsody平台上使用寡聚偶联抗体(Abseq)结合单细胞mRNA测序(scRNAseq)比较了29个表面蛋白的表达水平和259个mRNA检测。有助于加深对蛋白质生物学的理解,并加速单细胞研究。

【单细胞测序系列】只做转录组不做蛋白组,意义少一半?

带有oligo寡核苷酸的抗体能够在单细胞测序实验中同时检测蛋白质和mRNA表达,有助于加深对蛋白质生物学的理解,并加速单细胞研究。40个指标选择意义向上滑动3、RNA捕获、文库、测序三实验结果说明1、mRNAcellmap细胞图谱结果从三类样本健康、COVID-19感染者和康复者收集到的124,726细胞,通过T-SNE做可视化...