iMeta | 高被引分子系统发育树分析教程PhyloSuite_腾讯新闻
在RAxML/ExaML,PhyML,IQ-TREE和FastTree等5种常用的基于ML法的系统发育树重建的软件中,IQ-TREE在多基因串联的数据集中表现最好,得到了最大的似然值。如何在PhyloSuite中使用IQ-TREE?图25.使用IQ-TREE软件重建ML法系统发育树1.10.1.右键单击PCGsRNA数据集的PartitionFinder2或ModelFinder结果文件夹,选择“Impor...
贝叶斯法建树的新进展—用简约值作建议向导可大幅提高贝叶斯算法...
NEWRESEARCH贝叶斯法建树绝大多数情况下通过马尔可夫链蒙特卡洛(MarkovchainMonteCarlo,MCMC)算法估计参数的后验分布。系统发生树作为重要参数之一,准确并高效地估计其分布一直是贝叶斯建树方法的焦点与挑战。传统的建议方法往往是对当前的树进行微小的随机变化,而得到的新树往往后验概率很低使得该建议被拒绝,导致...
重建系统发育关系==分子数据建树?
培养一个特定生物类群分类学家需要几年甚至几十年,提DNA、测序、然后用现成的软件建树只需要几个月。现在我们来说把系统发育等同于用分子数据建树是片面的第二点原因,那就是重建生物系统发生关系也并不等同于建二叉树。目前普遍使用的二叉树是经济适用树,是我们向现实妥协的结果,并不能完全反映真实的系统发生关系,...
在知乎,看见ChatGPT变革的第一束光|算法|谷歌|人工智能技术_网易...
「在盘古气象大模型文章中,我们将NWP限定为『基于同化数据进行预测的方法』,而不是指代整个『数值气象预报领域』。盘古确实首次在同化数据上超越了传统方法:我们使用了与英伟达FourCastNet完全相同的测试环境,确保对比的公平性和结论的可信度。」研究发布后,谢凌曦团队接到不少交流邀请,包括中国气象局做报告。欧...
综述| 结核分枝杆菌全基因组测序数据分析方法与应用进展
系统发育树是进化研究的核心,主流建树软件众多,其中MEGA属于图形化软件,因界面友好而被广泛使用,方法包括距离法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法,其中距离法又包括最少进化法和邻接法。由于邻接法建树极快,通常用于建树尝试阶段,而正式建树常选用可靠性高的最大似然法。其他常用的进化树构建软件还有RAxML、IQ-TREE...
全球边缘计算大会深圳站要来啦!
顺丰物联网平台负责人,ZETA联盟工业物联网高级顾问,哈尔滨工业大学软件学院企业导师,主要负责顺丰物联网平台建设及产品化工作,在物联网、边缘计算、工业大数据领域从业10余年,有丰富的实践经验(www.e993.com)2024年10月17日。已出版专著《工业物联网:平台架构、关键技术与应用实践》、《TestStand工业自动化测试管理》,牵头起草行业标准《邮政业物联...
大帝是如何炼成的?走进76人青年军背后的男人
比如:当他和阿丽夏天飞去帕罗奥图选房子的时候,他会用飞机上的无线网,通过一家汽车运输公司的软件来制定优化他们的路线。他的逻辑是:他们远程挑选的24间房子中,有的地方被相中的概率,可能仅仅会因为开车经过这些地方就没了,因为有的时候你就是知道。所以萨姆选择了一个最佳路线,第二天早晨,在还没有和房产经纪人...
搜索引擎到人工智能的终极演进
上文提到,搜索引擎构建了人与信息的意识主动化的连接,而且用户与搜索引擎的每次交互都是一种相互了解、共同成长的过程。与其他互联网服务不同,用户在使用搜索引擎时也是在作为一个“开发者”参与其中,这也就是在百度“大数据引擎”开放日上北航校长讲到的,“一种超越众包的、融合计算机与人群”的软件开发新思路。
未来已来,人工智能万亿市场一触即发
基础层分为硬件和软件。硬件即具备储存、运算能力的芯片,以及获取外部数据信息的传感器;软件则为用以计算的大数据。技术层主要是人工智能技术,能够用于解决不同类别的问题。人工智能算法主要是机器学习的算法,含有线性模型、逻辑回归、决策树模型、支持向量机、贝叶斯分类器、聚类算法等广泛用于统计分类的方法;近年来开发...