「快讯」2024第五届单细胞技术应用研讨会暨空间组学前沿研讨会在...
接下来，分享的嘉宾是贝瑞基因高级产品经理伍露露女士，伍经理在单细胞测序领域深耕多年，拥有丰富的单细胞/空间/多组学等产品的产品开发、推广及优化经验，熟知单细胞转录组及空间转录组的应用场景，目前负责贝瑞基因单细胞、空间方向全产品的推广及应用，致力于给广大科研工作者提供最优的解决方案。她报告的主题是“从...
ATVB 蔡哲钧/宋伸/宋江平/杨劲合作利用单细胞转录组测序解析小鼠...
为了揭示炎症细胞之间的调控路径，研究人员应用CellChat分析，对小鼠单细胞测序数据进行分析，确定了不同时间点AAA组织中的细胞间相互作用。结果表明，炎症细胞在AAA诱导后的相互作用不断增加。通过多重免疫组化验证了人类动脉瘤组织中的相似发现，进一步支持了这些免疫细胞在AAA发病机制中的重要作用(图7)。图7.CellChat分...
用单细胞与空间转录组测序技术解析膝关节骨性关节炎软骨细胞异质
为了建立膝关节骨性关节炎患者和正常对照软骨细胞的细胞图谱景观,研究人员首先对8例骨关节炎患者中承重区(磨损严重区域,WB)与非承重区(轻度磨损区域,NWB),以及3例正常对照个体膝关节软骨进行了scRNA-seq单细胞转录组测序(10XGenomics)分析,研究发现前肥大软骨细胞(preHTC)、纤维软骨性软骨细胞(FC)、稳态性软骨细胞(...
Sci Adv:单细胞RNA测序和空间转录组学绘制金鱼端脑细胞类型图谱
单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够完全基于全基因组基因表达谱(转录组)来比较不同物种间特定组织细胞类型的分子相似性和差异。而空间转录组(ST)可以保留mRNA分子在组织中的位置信息,并实现基因谱的空间定位。本研究结合这两种技术,生成了金鱼端脑的空间注释细胞类型图谱(图1A)。首先,研究者对完整的金鱼端脑进行scRNA-seq。
单细胞测序系统一站式解决方案——走访新格元生物
导读:新格元推出全球首款自动化单细胞cDNA合成平台SingleronJavaTM,旨在提高实验室单细胞数据生产效率,加速单细胞测序技术在精准医疗领域的应用。细胞是生命活动的基本单位,随着精准医疗的发展和测序水平的提高,人们越来越深刻地认识到组织水平反应的信息有限。单细胞测序技术在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行...
98页重磅综述!单细胞组学技术、数据分析与应用
图1单细胞组学技术总概综述第一章“Single-celltranscriptomesequencing”,详细介绍了单细胞转录组技术的发展历程、当前可用的scRNA-seq技术(图2)及数据分析方法,并概述了单细胞转录组测序技术在胚胎发育、组织和器官发展研究、肿瘤生物学、免疫系统研究以及传染病研究等领域的应用(www.e993.com)2024年11月15日。借助于scRNA-seq技术,科学家们能...
Nat Methods | 基于测序的11种空间转录组学方法的系统比较
单细胞转录组测序(scRNA-seq)在剖析细胞异质性方面发挥了重要作用,目前已被作为研究关键生物医学难题的重要手段。但scRNA-seq在获取组织结构、细胞相互作用和功能状态所必需的空间背景方面仍存在不足。为了解决这一挑战,空间转录组技术(Spatialtranscriptomics,sST)应运而生,现在已经成为一种关键的补充方法,其可以在...
...子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物组单细胞转录组学技术
图1.微生物组单细胞转录组研究流程基于MscT,研究团队构建了一个涵盖17,4531个微生物细胞和2,534个物种的瘤胃微生物单细胞转录组图谱,揭示了瘤胃微生物在单细胞水平上的功能分工;共鉴定出12个功能类群,每个类群由表达特定代表性功能基因的细胞组成。例如,功能类群“HSP90+HMACs”中的细胞特异性表达HSP90蛋白,这...
【CSCB2024】分会场回顾之重大疾病单细胞转录组与空间转录组分会场
廖奇教授团队基于单细胞转录组测序技术,对不同方法治疗后的患者的组织样本进行了单细胞图谱解析,系统刻画了食管鳞癌患者肿瘤上皮细胞和肿瘤微环境对新辅助治疗耐受的机制,为食管鳞癌精准治疗方案的建立提供了重要支撑。四川大学华西医院的郭安源教授就《肿瘤生物信息学——免疫治疗药物预测及CAR-T单细胞》进行了报告。
...一键式自动化,百奥益康发布CelCode??高通量单细胞测序系统
CelCode??系统首先利用微流控芯片,将单个细胞、带有Barcode和引物的单个凝胶微球,以及逆转录反应体系包裹在油滴中,然后进行逆转录反应产生携带Barcode的cDNA,之后对cDNA进行回收建库和高通量测序,即可一次性获得成千上万个单细胞的基因表达数据,基于这些数据,即可进行细胞亚群重建、细胞群体间标记物筛选等一系列分析。实...