《iMeta》综述 | 多组学在肿瘤微生物研究中的应用
样本中代谢物的提取可以通过物理方法,手工研磨或使用组织匀浆器实现,其中基于甲醇、氯仿和乙腈等的有机溶剂萃取由于提取效率高而常用于代谢物的提取,此外有机溶剂提取法对LC-MS的离子抑制效应也更小;基于NMR的分析方法无需对样本进行处理,样品制备简单。LC-MS和NMR在微生物相关代谢物检测分析方面各有其自身的优缺点,...
华大智造2023年年度董事会经营评述
MGIEasy总RNA提取套装采用高盐法裂解释放样本中的RNA,结合超顺磁性的纳米磁珠技术,通过特配的洗涤液去除杂质,得到的总RNA不仅产量高、纯度高、质量好,并且操作过程简单方便,提取过程中不含有对人体有伤害的苯酚、氯仿等试剂。MGIEasy植物基因组DNA提取试剂套装,能够获取高纯度、高得率和完整性好的高质量植物样本中的D...
PCR反应的几大要素(各组分和条件)
SDS的主要功能是:溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,SDS还能与蛋白质结合而沉淀;蛋白酶K能水解消化蛋白质,特别是与DNA结合的组蛋白,再用有机溶剂酚与氯仿抽提掉蛋白质和其它细胞组分,用乙醇或异丙醇沉淀核酸。提取的核酸即可作为模板用于PCR反应。一般临床检测标本,可采...
...mSphere:多菌种肠道微生物群落中病原菌与共生菌个体间相互作用...
当PMA被光激活时,它与双链DNA(dsDNA)共价结合,交联两条链,这种结合可以防止在PCR的过程中的DNA扩增。因此,生物膜样本首先用优化浓度的PMA进行处理,然后进行基因组DNA提取,然后用QPCR进行分析(图1)。表1用于构建肠道微生物群落的有代表性的物种一览表图1用于量化混合生物膜中单个物种管道的示意图。样本为PMA(...
实验帖-DNA提取那点事儿~~
在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。一般采用氯仿与异戊醇为24:1之比。也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即...
上新| CUT&Tag、CUT&RUN双来袭,让你更快hold住蛋白质与DNA互作!
??实验流程简单:包含DNA提取模块,告别酚氯仿抽提(www.e993.com)2024年9月30日。??产品性能好:常/异染色质无差别切割,实验结果更真实。??结果更准确:含有Spike-in组分,校正组间差异。??区分下游实验:可建库可qPCR,满足不同实验需求。02Vazyme#HD10102
大白鼠肝DNA的提取与鉴定材料和步骤
在本实验的提取DNA反应体系中,SDS(十二烷基磺酸钠)破坏细胞膜和核膜,并使蛋白质变性,将核蛋白中的DNA与蛋白质分开,EDTA及SDS抑制细胞中的DNA酶的活性。用酚、氯仿抽提的方法进一步除去蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀除净小分子化合物。提取出的DNA制品进一步用含溴乙锭的琼脂糖凝胶电泳加以鉴定。
RNA的提取与提纯
DNA的主要功能是记录遗传信息,而RNA主要功能是转录和翻译DNA的遗传信息,其实RNA还有其他的一些功能,比如RNA是很多病毒的遗传信息,RNA也具有一定的催化作用。本人最近在做RNA相关实验,因此需要用到RNA的提取和纯化,今天就和大家分享一下我用到的RNA提取和纯化的方法和心得,如果大家有更好的意见,也欢迎指正。
高通量测序之RNA提取那点事~~
2.氯仿在RNA抽提过程中的作用苯酚对蛋白质的变性作用远大于氯仿,但是酚的比重略比水重,碰到高浓度的盐溶液,离心后酚相会跑到上层,不利于含RNA的水相的回收;但加入氯仿后可以增加比重,使得酚/氯仿始终在下层,方便水相的回收;另外酚与水有很大的互溶性,如果单独用酚抽提,抽提后仍有大量的酚溶解到水相中,其会抑...
iMeta|俄亥俄州立大学郑庆飞组发表多组学方法研究肿瘤微生物组综述
DNA、RNA和组蛋白共价修饰的动力学是控制特定基因激活和抑制的表观遗传调控的关键机制。表观遗传调控在复制、转录和DNA损伤修复过程中对染色质结构和功能的调节起着重要作用,与许多人类疾病特别是癌症密切相关。具体来说,DNA甲基化改变了基因转录而不改变基因组序列,这可能导致肿瘤发生,当肿瘤抑制基因被关闭时。大量...