Nature Methods丨陈玲玲组利用CRISPR-dCas12系统实现非重复基因组...
通过与RNA适配体(RNAaptamers)结合,CRISPRdelight还可以成为多色系统用于同时观察多个DNA位点,为进一步研究DNA环相互作用(DNAloopinteractions)比如增强子-启动子、增强子-增强子、启动子-启动子、启动子-终止子等相互作用及其功能奠定了良好的基础。进一步迭代CRISPRdelight多色系统,将来也可以在活细胞中示踪环挤压...
Nature Methods | 突破蛋白质功能研究瓶颈:ORFtag高效标记与筛查...
ORFtag是一种创新的方法,通过使用含有启动子、选择基因、功能标签和剪接供体序列的逆转录病毒载体,实现了对内源开放阅读框(ORFs)的融合标记。ORFtag技术的多功能性、成本效益高且效率高,能够在蛋白质组范围内进行大规模平行标记和功能研究。(7月5日NatureMethods“Proteome-scaletaggingandfunctionalscreeningin...
【前沿进展】专家点评Nat Methods丨陈玲玲组利用CRISPR-dCas12...
通过与RNA适配体(RNAaptamers)结合,CRISPRdelight还可以成为多色系统用于同时观察多个DNA位点,为进一步研究DNA环相互作用(DNAloopinteractions)比如增强子-启动子、增强子-增强子、启动子-启动子、启动子-终止子等相互作用及其功能奠定了良好的基础。进一步迭代CRISPRdelight多色系统,将来也可以在活细胞中示踪环挤压(loop...
从科研院所到市场:一家生物育种头部公司是如何诞生的
从2013年项目正式启动,到拿到转基因安全证书,我们用了整整十年时间。转基因是一项系统性工程,通过不同的目的基因、启动子、终止子和标记基因等的排列组合,最终筛选出性状优良的种子,BFL4-2就是从30多个不同的组合中筛选出来的表现优异的转化体。而种子性状如何,要等农作物成熟才能显现。通常庄稼生长一季需要4个月的...
华南理工团队利用多重工程化策略高效表达GGT
枯草芽孢杆菌是γ-谷氨酰转肽酶更为安全有效的宿主细胞,但仍然存在分泌效率低、表达量低等问题,无法满足工业化大规模生产。需要进行优化增加目标蛋白的分泌和积累,比方说优化调控元件,包括启动子、终止子和信号肽等。同时,可能也面临着因使用抗生素标记物导致出现污染的风险。
简化甲基化测序(RRBS)在植物表观基因组学中的机遇
三、RRBS位点的功能注释RRBS片段中的DNA序列可以显示DNA甲基化差异基因组区域功能信息(图1),尤其是增强子元件的表观遗传变化可以驱动基因表达改变并产生功能性作用(www.e993.com)2024年10月17日。RRBS最初为哺乳动物研究而开发,其中大部分基因启动子与GC富集区域(CpG岛)相关,这些区域的甲基化状态对基因调控具有功能性影响。使用偏向GC富集位点(如Msp...
CDE II 3连发之《体外基因修饰系统药学研究与评价技术指导原则...
可以根据目的基因的表达量、预期作用和持续时间以及目的细胞的类型等合理选择和设计调控元件,相关的调控元件可能包括信号肽、转录启动子、增强子、终止子、隔离子、5’非翻译区、3’非翻译区、多聚腺苷酸信号区、内含子、其他增强转录及翻译效率相关元件、复制起始位点、额外引入的基因序列等。各调控元件的序列来源及...
【衡道丨RET】精准聚焦——非小细胞肺癌融合基因的诊断
融合基因由染色体结构重排引起,造成两个或多个不同基因的编码区首尾相连,置于同一套调控序列(包括启动子、增强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成新的嵌合基因[2]。基因融合是肿瘤发生发展的常见机制之一,有研究表明在多达17%的实体瘤中鉴定出至少一种基因融合体,基因融合会导致激酶持续性激活从而引发癌症,...
先玉335不含转基因成分
关于启动子的问题:每个基因都是由能够编码蛋白质的编码区和具有调控作用的非编码区(启动子和终止子等)组成,只要有基因存在就会有启动子。35S启动子来源于花椰菜花叶病毒,常用于转基因载体构建。如果在不感染花椰菜花叶病毒的植物中检测到35S启动子,在排除检测过程污染的前提下,可以怀疑该植物是转基因植物。但要确定是...
Nature Genetics | RNA聚合酶II在增强子-启动子相互作用中发挥...
PolII在促进增强子-启动子接触中发挥作用的模型提供了进一步的支持,通过阻断暂停释放,FLV不仅阻止了主动延长的PolII进入基因体,而且在大多数启动子的TSS附近留下了暂停的PolII。这些观察结果表明,转录周期的不同步骤可能对增强子-启动子接触产生根本不同的影响,这是基于它们对TSS附近PolII密度的影响。增强子-启动...