Nat Commun :原佳沛/张蔷/杨扬团队揭示基因启动子选择调控新机制
该研究从遗传变异位点影响基因启动子选择的角度出发,揭示了组织发育中的关键生物学问题,为理解遗传变异位点的功能提供了新的维度。启动子在基因的转录起始过程中扮演着关键角色。在人类基因组中,蛋白编码基因通常拥有多个启动子,选择不同的启动子会产生不同的转录本1。启动子选择的失衡与多种组织发育异常及疾病的...
...中鉴定到一个调控活性成分α-甜没药醇合成的组织特异性启动子
该研究从母菊基因组中克隆了MrBAS基因的长度为1327bp的启动子序列,顺式作用元件的分析表明,其具有对多种激素和外部应激响应的潜力。对MrBAS启动子序列分析发现其含有多个光响应元件,黑暗处理后,花中的α-甜没药醇含量显著降低。同时,5'端缺失分析结果表明,MrBAS启动子序列能够驱动β-葡萄糖醛酸酶(GUS)基因在烟...
淫羊藿素的药理作用及机制研究进展
发现淫羊藿素和淫羊藿苷对自由基具有较强的清除作用,其中淫羊藿素清除活性氧的能力更强,并且可通过抑制皮肤炎症和诱导胶原蛋白的生物合成防止UVB诱导的皮肤老化,其作用机制为淫羊藿素激活核因子E2相关因子2(nuclearfactorE2relatedfactor2,Nrf2),提高了抗氧化应激能力,并且抑制核因子-κB(nuclearfactor-κB,NF-κ...
Nat Methods丨scNanoSeq-CUT&Tag技术:可精准检测单细胞基因组复杂...
在哺乳动物基因组中,有三类关键的调控元件:启动子(Promoter)、增强子(Enhancer)和绝缘子(Insulator)。这些元件之间通过相互作用,如增强子-增强子相互作用、增强子-启动子相互作用来调控基因表达。已往对基因组不同功能元件之间相互作用的研究都是基于二代短读段测序推断的,常常没有直接证据支持而且假阳性率较高。单分子长...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
富集5??端RNA(7-methylguanosine5??-cappedRNA)的测序的方法常用来鉴定启动子和转录起始位点(TSSs),可以做为DGE分析的补充。有多种方法都可以实现这个操作,但很少作为常规使用。在CAGE(capanalysisofgeneexpression)和RAMPAGE(RNAannotationandmappingofpromotersforanalysisofgeneexpression)...
边界堆叠相互作用促进肢体发育过程中跨拓扑关联域增强子-启动子间...
美国斯坦福大学医学院AlistairN.Boettiger团队取得一项新突破(www.e993.com)2024年10月17日。他们发现边界堆叠相互作用促进肢体发育过程中,跨拓扑关联域(TAD)增强子-启动子间的通信。2024年1月18日出版的《自然—遗传学》杂志发表了这项成果。为了验证跨TAD相互作用的假设,研究人员利用染色质结构的光学重建来揭示发育中小鼠四肢单条染色体上Pitx1基...
2024年诺贝尔奖中的生命科学
除了上述在细胞质中发挥作用的miRNA外,最近的研究还发现了一类在细胞核中具有激活基因表达作用的miRNA,称为NamiRNA。它们可通过结合基因的启动子而影响转录起始。更多相关内容请阅读以下图书BOOK《小RNA——植物生命过程的关键密码》郭惠珊,赵建华主编
Immunity:邹伟平等综述铁死亡在免疫相关疾病中的作用
自身抗体和IFNα会增强一种转录调控因子与GPX4启动子的结合,从而导致GPX4表达减少,最终导致脂质过氧化增加。此外,具有GPX4一个等位基因缺失的小鼠会出现自身抗体、中性粒细胞减少症、皮肤病变和蛋白尿,这些都是人类SLE的症状。给易感小鼠使用铁死亡抑制剂可降低疾病的严重程度。因此,中性粒细胞铁死亡可能在SLE的病理中...
...皂苷生物合成的机制及其在缓解镉诱导的氧化损伤中的作用提供见解
bHLH家族是最大的转录因子家族之一,在多种生物过程,特别是萜类化合物的生物合成中起着至关重要的作用。bHLH家族中的转录因子MYC2与TPS11和TPS21-合成酶基因的启动子区相互作用,加速倍半萜的合成并促进其表达,从而促进了拟南芥中倍半萜的释放。在长春花中过表达bHLH可能会提高单萜吲哚生物碱的生成。我们的结果表明...
【前沿进展】Nature︱解码RAS剂量效应:改变肿瘤衰老状态和影响...
通过使用不同强度的启动子来调控RAS蛋白的表达水平,IHC结果显示使用较弱的启动子(PGK和UBC)相比于强启动子(CAGGS)能够产生更低且更均匀的NRAS表达水平。研究人员发现,在PGK-NRAS(G12V)或UBC-NRAS(G12V)小鼠中,免疫细胞的募集减少,这与低表达NRAS的肝细胞的免疫逃逸有关。同时,低剂量的致癌性RAS有助于...