中国儿童急性呼吸道感染中,4型腺病毒(HAdV-4)危害有多大?BMC:前瞻...
且群内平均遗传距离非常接近(<0.002),表明本研究获得的菌株与来自不同国家和地区的大多数菌株具有较高的相似性,并且HAdV-4基因组在时间和地理空间上相对稳定,这将促进疫苗的免疫保护作用,与Li等所发现的一致。
快讯!南京理工大学临床医学进入ESI全球前1%!
在面向基因组及转录组的数据挖掘方面,项目组开展了一系列变异位点保守性及功能效应预测的深入研究,提出了针对跨膜蛋白疾病相关突变的预测方法,深入探讨了位于膜外、膜内以及跨膜螺旋区不同突变的致病性差异;开发了基于多尺度特征与深度融合的非同义单核苷酸变异致病性预测模型;构建了大规模中性与功能获得(GOF)/功能...
【Nature Reviews】二级药理学的最新进展、及新药安全性影响综述
靶标是确定超出预期药物靶点的蛋白质相互作用,驱动药理作用,可能对患者造成严重或剂量限制性不良反应。除了对药物发现和开发项目总体成功的影响之外,公司还有责任最大限度地提高安全性,并防止患者或健康的临床试验志愿者因脱靶药理学而面临不必要的并发症风险。二级药理学评估应用的实践和经验,并根据Bowes等人发表以来...
【文献解读】利用Cas12a敲除技术探索跨物种lncRNA功能保守性
该研究使用CRISPR-Cas12a对人类细胞中预测有斑马鱼同源物的coPARSE-lncRNAs进行基因敲除以产生细胞增殖缺陷,通过功能救援实验(KO-rescue)将预测的斑马鱼同源物引入敲除人类lncRNA的细胞中尝试修复该缺陷,同时在斑马鱼胚胎中进行类似实验,证明lncRNAs在跨物种中的功能保守性,揭示lncRNAs在细胞增殖和发育中的功能,为癌症治疗领...
通过多种甘蓝黑腐病菌,研究其基因的克隆,与功能分析有何重要性
细菌相互粘附或附着在生物或非生物表面时形成的生物膜,起到保护菌体的作用,使细菌能够在恶劣的条件下生存。在火疫病病菌和橡树叶枯病病菌中生物膜的形成在植物致病性中的作用已有报道,在Xcc中也发现有多种毒力因子与生物膜形成相关,有科学家发现icd2基因编码功能性异柠檬酸脱氢酶,并且参与细胞毒力表达以及细菌附着...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
RNA-seq的广泛应用促进了对许多生物层面的理解,如揭示了mRNA剪接的复杂性、非编码RNA和增强子RNA调控基因表达的机制(www.e993.com)2024年10月17日。RNA-seq的发展和进步一直离不开技术发展的支持(湿实验方面和计算分析方面),且与先前的基于基因芯片的技术比起来,获得的信息更多、偏好性更小。到目前为止,已从标准的RNA-seq流程中衍生出多达100种不...
Nature | 免疫细胞之间的相互作用促进免疫特征演化
此外,细胞反式基因在造血干细胞中的表达暗示了它们在分化谱系中对特定细胞类型频率的上游调控作用。这些结果表明,细胞反式基因在建立多个信号通路参与的复杂细胞间相互作用网络中发挥重要作用。进一步分析显示,调节多种免疫细胞类型频率的基因在演化中的保守性较低,相反,仅影响单一免疫细胞类型的基因受到更强的保守性约束...
...宁夏大学李亚蕾教授等:牛HSPA6蛋白特性分析及蛋白互作网络构建
表3为牛HSPA6蛋白相互作用的蛋白质及可能性预测得分。结果显示,聚类系数:0.814;PPI富集P值:1.29×10-11;HSPA6蛋白可能与BAG1、DNAJA4、DNAJB1、DNAJC2等蛋白相互作用。GO富集分析表明,牛HSPA6互作基因主要参与腺苷酸交换因子活性、ATP酶调节活性、伴侣绑定等分子功能;京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析...
Nature Medicine | 揭开人类大脑之谜:全新细胞图谱揭示脑细胞异质性
细胞间通信网络示意图:该图展示了前额叶皮质和海马区内神经发生微环境中细胞间通信网络的概览。通过CellChat程序分析了细胞间可能的配体-受体相互作用。通信通路的数量和分布:展示了60条通信通路(980个基因)参与了神经细胞环境的细胞-细胞通信网络构建。其中包括45条保守的通信通路,12条前额叶皮质特异的通路和3条海马...
学者开发出跨物种单细胞组学数据分析的新工具
CACIMAR的保守性分析主要包含三个步骤:第一步,CACIMAR基于每个物种内的单细胞聚类结果确定每个物种的细胞类型、标志基因、细胞内调控和细胞间相互作用。该策略不用进行跨物种的单细胞聚类,有效避免了跨物种的批次效应;第二步,基于标志基因的统计值和物种同源性,CACIMAR计算细胞类型的保守性分值。此外,CACIMAR还建立...