超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
AlphaFold3能够通过对药物分子(例如与蛋白质结合的配体和抗体)的预测,为药物设计赋能,从而改变人类健康和疾病过程中蛋白质的相互作用方式。AlphaFold3在预测药物相互作用方面达到了前所未有的准确度,包括蛋白质与配体的结合以及抗体与靶蛋白的结合。AlphaFold3在不使用任何结构信息的情况下,比最好的传统方法在PoseBusters...
打破AlphaFold大模型局限,世界最大蛋白质相互作用数据集AlphaSeq...
当这些蛋白质相互作用时,它们会导致细胞粘在一起,促进配对并形成二倍体细胞。AlphaSeq正是利用了这个自然过程。研究人员对酵母细胞进行基因改造,让相关的蛋白质暴露在细胞表面,MATa细胞搭载一组蛋白质,而MATα细胞搭载另一组蛋白质。将改造过的细胞进行混合时,它们配对的可能性就取决于表面蛋白质相互作用的强度。
AI+合成生物学,世界最大蛋白质相互作用数据库!
与抑制蛋白质功能的传统药物不同,分子胶的工作原理诱导或增强两种蛋白质之间的相互作用,导致靶蛋白降解。因此开发分子胶药物的一大痛点在于能够测量靶点和连接酶之间的相互作用。而AlphaSeq非常适合通过发现和表征E3泛素连接酶与靶蛋白之间的弱相互作用来发现分子胶的新靶标。在DynoTherapeutics的高级机器学习工程师...
...Methods | 突破传统方法:DeepPBS模型助力蛋白质-DNA相互作用研究
DeepPBS在预测蛋白质-DNA复合体的建模技术改进方面起到了指导作用。
SOTA性能,多尺度学习,中山大学提出蛋白质-药物相互作用AI框架
蛋白质功能的特点是与蛋白质、药物和其他生物分子的相互作用。了解这些相互作用对于破译生物过程的分子机制和开发新的治疗策略至关重要。然而,与实验相互作用相关的需求和成本的大幅增长,需要计算工具来自动预测和理解生物分子之间的相互作用。纯粹从结构预测这些相互作用是结构生物学中最重要的挑战之一。目前的计算方法大...
Nature Methods | 解码RNA与蛋白质相互作用的新视角:TREX技术的突破
01RNA与蛋白质相互作用是调控基因表达的重要机制之一,影响细胞的命运和生理状态(www.e993.com)2024年10月17日。02TREX技术是一种创新的实验方法,能够精确识别出与特定RNA区域相互作用的蛋白质。03TREX技术具有高特异性、高灵敏度和操作简便等优势,可应用于不同细胞类型和疾病研究。
质谱解码蛋白质之间的密语:蛋白相互作用质谱技术深度解析
蛋白质相互作用是生命体内调控生物过程的重要机制之一,对于了解细胞信号传导、代谢调控和疾病发生机制具有重要意义。在蛋白质研究领域,蛋白质相互作用质谱技术是一种强大的工具,可以解码蛋白质之间的密语。本文将深入解析蛋白质相互作用质谱技术,强调其在蛋白质研究领域的重要性和相关知识。
AlphaFold3来了!全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构...
AlphaFold3能够通过对药物分子(例如与蛋白质结合的配体和抗体)的预测,为药物设计赋能,从而改变人类健康和疾病过程中蛋白质的相互作用方式。了解我们体内的生物分子世界,以及我们细胞内复杂的分子网络如何相互作用,是理解疾病和理性设计药物治疗疾病的关键起点。
Nature:新研究深入揭示酵母的蛋白-蛋白相互作用网络
与靶蛋白直接相互作用的蛋白的亲和力也会导致它们被拉出来。然后,质谱仪可以精确地测量哪些蛋白参与其中。这样,这些蛋白就能被确定为目标蛋白的直接相互作用伙伴。就像渔夫根据自己喜欢的猎物选择鱼饵一样,这些组着用小型荧光蛋白(鱼竿)标记目标蛋白(鱼饵),然后由抗体充当垂钓者,拖着其他蛋白(鱼)从蛋白质组(海洋)中拉...
6.6亿美元!礼来与PRISM就蛋白-蛋白相互作用小分子抑制剂达成合作
PRISM是一家处于发现阶段的生物技术公司,利用专有的PepMetics??技术开发靶向蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的口服小分子抑制剂,并改变患有癌症、自身免疫、纤维化和其他疾病的患者的生活。2、技术平台PepMetics??开发一类独特的小分子,可模拟α螺旋和β转角的三维结构,这是细胞内PPI间期和受体-...