谷歌DeepMind发布AlphaFold 3:可预测药物如何与蛋白质相互作用
IT之家5月9日消息,谷歌DeepMind公司近日推出了AlphaFold3,通过预测所有生命分子是如何相互作用的,加速寻找新药和探索新的治疗方法,治疗癌症、帕金森氏症、疟疾、肺结核等疾病。IT之家从报道中获悉,AlphaFold3能够预测人体每个细胞分子的复杂形状,以及如何相互连接,以及其中最小的变化如何影响可能导致疾病...
...王道营研究员:肌内磷脂与蛋白质相互作用机制及其对禽肉品质的...
肌内磷脂与蛋白质相互作用机制及其对禽肉品质的影响以鸭肉为材料,对热休克蛋白(heatshockprotein,Hsp)90进行分离纯化;采用荧光光谱、红外光谱和表面等离子共振分析,探究鸭肉中Hsp90绑定磷脂的微观结构特征和影响因素,推测Hsp90的磷脂保护效应;再运用高效液相色谱-蒸发光散射、气相色谱等手段,分析水相和肌肉内环境模拟...
PRC2和其他广泛报道的染色质蛋白在体内似乎不直接与RNA结合
RNA-蛋白相互作用是细胞内发生的一种基本生物学过程,对RNA的生物合成、加工、运输、定位和功能至关重要。然而最近对这些相互作用的研究发现,许多新的RNA结合蛋白(RBP)并不含有经典的RNA结合结构域,例如染色质和转录调节因子以及代谢蛋白。这些发现引起了科学家对非典型RNA-蛋白相互作用功能重要性的广泛兴趣。许多...
Trends in Neurosci综述:张振涛团队总结蛋白质相互作用调控α...
α-Syn可以与细胞内其他蛋白质发生多样且复杂的相互作用,形成具有不同结构和毒性的毒株(Strain),导致不同的疾病表型。因此,蛋白间相互作用的多样性以及“交叉接种”可能是导致疾病异质性的重要原因。3α-Syn与微生物蛋白质的相互作用某些微生物蛋白能够在特定条件下形成聚集体,包括大肠杆菌的Curli、酵母菌淀粉样蛋白...
精度媲美AlphaFold,EPFL的AI方法从序列中匹配蛋白质互作
EPFL的Anne-FlorenceBitbol团队开发了一种配对相互作用蛋白质序列的方法,该方法利用了在多序列比对(MSA)上训练的蛋白质语言模型的强大功能,例如MSATransformer和AlphaFold的EvoFormer模块。这使它能够高度准确地理解和预测蛋白质之间的复杂相互作用。
Nature Methods | 解码RNA与蛋白质相互作用的新视角:TREX技术的突破
01RNA与蛋白质相互作用是调控基因表达的重要机制之一,影响细胞的命运和生理状态(www.e993.com)2024年9月7日。02TREX技术是一种创新的实验方法,能够精确识别出与特定RNA区域相互作用的蛋白质。03TREX技术具有高特异性、高灵敏度和操作简便等优势,可应用于不同细胞类型和疾病研究。
解密蛋白质互作网络的关键方法:深入解析GST Pull-Do
蛋白质互作网络是由大量蛋白质相互作用所构成的复杂网络。GSTPull-Down实验被广泛应用于研究蛋白质互作网络中的关键节点和功能模块。通过这种实验方法,可以筛选和鉴定与目标蛋白特异性结合的互作伙伴,从而揭示蛋白质相互作用的动态调控机制。此外,GSTPull-Down实验还可用于研究蛋白质复合物的组成和结构,以及信号传导通路...
科学家揭示非洲猪瘟病毒MGF300-2R蛋白通过募集TOLLIP促进IKKα和...
为研究MGF300-2R是否可以与IKK复合物中的任何蛋白相互作用,作者在HEK293T细胞进行了co-IP试验,结果发现,MGF300-2R与IKKα和IKKβ特异性免疫共沉淀,通过GSTpulldownassay试验进一步验证了MGF300-2R与IKKα和IKKβ的互作。共聚焦显微镜观察结果显示,MGF300-2R与IKKα或IKKβ在胞质共定位。
...Communications》发表零样本药物靶标相互作用预测研究成果
近日,上海交通大学电子信息与电气工程学院自动化系潘小勇副教授团队在《NatureCommunication》(自然-通讯)上以“ZeroBind:Aprotein-specificzero-shotpredictorwithsubgraphmatchingfordrug-targetinteractions”(基于子图匹配的蛋白特异性零样本药物靶标相互作用预测器)为题发表了最新的研究成果。该研究针对药物...
仅根据蛋白质序列便可预测相互作用界面,一种基于Transformer的...
蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)对于生物过程至关重要,预测这些相互作用的位点对于计算和实验应用都很重要。杜克大学(DukeUniversity)和康奈尔大学(CornellUniversity)的研究人员提出了一种与结构无关的语言Transformer和肽优先级(Structure-agnosticLanguageTransformerandPeptidePrioritization,SaLT&PepPr)管线,用于仅根...