Nature:计算蛋白质设计,AI如何重塑生物学的未来

蛋白质不仅可以作为酶类,其还能够作为构建模块,用于自组装成能够携带货物进入细胞、产生机械力,或展开错误折叠的蛋白质等复杂结构。通过合理设计,蛋白质可以被赋予多种新颖的功能,用于解决实际的生物医学问题。在COVID-19大流行期间,韩国和英国相继批准了基于计算设计的蛋白质制成的疫苗SKYCovione的紧急使用,这标志着计...

Nature:AI仍需发力这5个蛋白质设计问题

预测蛋白质-蛋白质相互作用的算法之所以成功,是因为所有天然蛋白质都由相同的20种氨基酸组成。蛋白质数据库(PDB)中已有数十万种结构和蛋白质-蛋白质相互作用。但训练模型的数据如果过少,结果会不可靠,用于结合药物和其他小分子的蛋白质就是这种情况。许多制药公司都有自己的小分子结构数据库以及它们如何与蛋白...

...河南中医药大学揭示皂角抗喘息性支气管炎的成分及作用机制

蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的拓扑分析确定了IL6、TNF、ALB、AKT1和SRC为核心靶点。富集分析显示,GSF治疗支气管哮喘主要涉及AGE-RAGE信号通路和PI3K-Akt信号通路等。主要活性成分包括13(s)-HOTRE、亚麻酸和乙酰胆碱。分子对接结果表明,GSF的关键成分与核心靶点之间具有良好的结合活性。动物实验研究表明,GSF有效改善...

Nature Methods | 基因变异与蛋白质功能的动态链接:G2P平台推动...

API功能:G2P3DAPI允许通过基因、转录本、蛋白质序列和结构的标识符,实现从基因变异到蛋白质结构的无缝映射,从而帮助研究者分析变异对蛋白质功能的影响。平台基于React.js前端和GoogleCloud后端架构,支持用户与广泛的数据资源交互。通过集成gnomAD(GenomeAggregationDatabase)、ClinVar和HGMD(HumanGeneMutationDat...

深度对话吴玉章院士:人工智能细胞分析技术的科研与临床应用前景

人工智能技术因ChatGPT的广泛应用而深入人心,并在本月初的诺贝尔奖评选中荣获物理学和化学两个奖项,特别是物理学奖授予蛋白质从头设计与结构预测的突破性成就,充分展示了人工智能在生命科学领域的应用已经为科学家的研究方法和科研效率带来了革命性的影响。

科学家利用AlphaFold-Multimer首次发现精卵结合的关键三聚体蛋白

,与现有技术相比,精度提升了至少50%,个别类别精度翻倍(www.e993.com)2024年11月10日。可以说,AI彻底颠覆了结构生物学的底层代码。今日,AlphaFold家族再登顶刊。维也纳生物中心(VBC)科研团队在《细胞》杂志发文,研究者们利用AlphaFold-Multimer成功预测了脊椎动物中保守的精卵结合的关键蛋白结构,由Izumo1、Spaca6和Tmem81形成的三聚体。

知耕PI专辑|AlphaFold 3 预测了所有生命分子的结构和相互作用

AlphaFold3(AF3)是一个能够高准确度预测包含几乎所有在蛋白质数据银行(PDB)中的分子类型的复合物的模型。在除了一个类别之外的所有情况下,它的性能都显著高于专门针对特定任务的强大方法,包括蛋白质结构和蛋白质-蛋白质相互作用的更高准确性。这是通过对AlphaFold2架构和训练过程的重大演进实现的,既适应更一般...

基因检测在疾病确诊、家系遗传模式分析与再生育计划中的重要作用

多达数百万个）经过质量过滤，并使用来自多种资源（基因组测序数据库、出版物、生物信息过滤器、预测算法等）的证据进行注释，以分离出可能对蛋白质功能和相关蛋白产生致病作用的变体，与正在研究的表型临床科学家对每个分离的变异进行分析，以确定其引起所研究表型的可能性检测到的变异的致病性根据标准化分类系统进行报告...

喝雪莲茶的功效、作用及禁忌全解析

喝雪莲茶的功效、作用及禁忌全解析喝雪莲茶有什么功效喝雪莲茶的蛋白质功效序言:茶是中国的痛经特产之一,有着丰富的泡水品种和功效。其中,雪莲茶是一种优质的以及茶叶,因其独特的哪些口感和药用价值而受到大茶友们的人们喜爱。本文将详细介绍喝雪莲茶的高原功效,希望能给大家带来一些茶文化的雪山乐趣。

...皂苷生物合成的机制及其在缓解镉诱导的氧化损伤中的作用提供见解

先前的研究报道,Terminaliafagifolia皂苷具有抗癌特性;从番薯块茎中提取的皂苷具有显著的抗氧化活性,对健康有益;大豆皂苷可以减少DNA断裂,提高膜蛋白活性,以维持适当的含水量。此外,低浓度的皂苷可干预大豆种子萌发,提高大豆抗氧化系统以对抗NaCl诱导的氧化损伤。我们的研究发现,在Cd胁迫下,根中的ROS水平显著低于叶中...