Cell:时空组学迎来革新性突破!华大团队等开发时空算法,将全面支撑...

编辑丨王多鱼排版丨水成文空间转录组学技术,尤其是华大时空组学技术Stereo-seq的出现,能够准确反映细胞的空间排布和RNA的原位表达,帮助科研人员从时间和空间维度上认知每个基因、每个细胞,有望带来生命科学领域的第三次科技革命,成为重新认知器官结构、生命发育、物种

Science:我国学者首次绘制跨物种小脑单细胞时空组学图谱,发现灵长...

而该研究的基础,时空组学技术Stereo-seq能够以约500纳米的高分辨率和全小脑覆盖的超大视角来绘制小脑的空间基因表达谱,这也让后续更深入的研究成为了可能。跨物种小脑空间转录组图谱发现灵长类特有的细胞亚型,或与学习能力相关通过深入研究,研究团队在这张“高清地图”上发现了两种新的细胞亚型——在灵长类动物(...

孤独症相关基因Nlgn3有新发现!深圳科学家揭示其在星形胶质细胞中...

为了探究Nlgn3在星形胶质细胞中发挥作用的机制，研究人员利用华大时空组学技术Stereo-seq技术，结合高精度DNBSEQ测序平台，对小鼠大脑进行了“高清扫描”，发现Nlgn3在星形胶质细胞的胞体区域而非末梢，这一发现也有助于解释为何敲除Nlgn3不影响突触数量和功能。那这个基因又是如何影响信号传递的呢？更进一步研究发现，敲除...

【Cell】华大基因徐讯团队:时空组学在生物学和医学的应用

这包括:(1)定性—通过调控基因表达产生的细胞类型的多样性;(2)定量—每种细胞类型的计数、比例和密度;(3)空间—每种细胞类型的空间布局及其相互作用和细胞生态系统;(4)时间—细胞类型和状态变化的具体时间;(5)方向—每种细胞类型可能经历的潜在转化路径。2009年,单细胞测序技术的出现,及其在通量...

肿瘤诊治的最大难题!永远绕不开的“肿瘤异质性”

如组蛋白甲基化修饰可在具有自我更新能力的肿瘤干细胞样细胞(cancerstemlikecell,CSLC)和已分化的细胞间实现细胞可塑性,促进耐药性肿瘤克隆的局部生长。表观遗传ITH与遗传变异相关,基因组和表观基因组间的复杂作用有助于单个肿瘤产生表型异质性。有研究表明,体细胞突变可能是早期致癌事件,而DNA甲基化改变显著地...

Cell 50周年专刊:华大发表长篇综述,解析时空组学在生物学和医学中...

在分子水平,时空组学通过精确定位分子,研究这些分子的空间分布及其在组织功能中的作用(www.e993.com)2024年11月23日。例如,识别空间可变基因(SVGs)可以帮助寻找特定细胞类型、区域或功能相关的分子特征。这些分析有助于揭示基因表达的调控机制,并在更广泛的层面上帮助理解基因调控网络(GRNs),从而揭示生命过程中的关键调控特征;在细胞水平,基本分析包括...

追问|“透视”肝脏:中国科学家构建小鼠肝脏高精度时空图谱

借助时空组学技术Stereo-seq,我们不但发现这一在肝脏中随机分布的免疫微结构主要由T细胞和单核细胞组成,也发现这些细胞具有响应干扰素γ的下游基因特征。因此,我们猜测这一结构的存在能够维持肝脏快速响应外源病原体感染的能力,使得肝脏能够快速清除病原体。我们挖掘了过去的研究,发现类似的免疫微结构也在皮肤、结直肠中...

中国科学院自动化研究所揭示人类小脑功能层级背后的时空分子谱

综上,该研究提供了构成人类小脑SA轴的时空分子特征证据,揭示了小脑形成SA轴的微观-宏观相交互的组织模式。研究通过整合关于人类小脑功能的多层次发现,沿着SA轴,小脑神经递质传递相关基因的表达增加,发育进程产生差异,受演化有关的生物过程的影响增加,且与精神疾病的关联增加。

成本下跌8个“0”!我的基因我来测,真的行吗?

“在三维成像、虚拟现实等技术的支撑下，或许将来可以亲眼看到纳米级生命大分子之间的相互作用。”詹启敏说，超分辨可视化的前沿技术正在路上，获得基因序列只是初步了解，如果能够亲眼看到自己一段一段基因的“动作”，甚至看到蛋白分子与它们的动态“交流”，将有利于形成更具象的认知。新科技的浪潮奔涌而来。它们广泛...

人类基因组计划已完成二十年 DNA何时实现“随手测”

“在三维成像、虚拟现实等技术的支撑下,或许将来可以亲眼看到纳米级生命大分子之间的相互作用。”詹启敏说,超分辨可视化的前沿技术正在路上,获得基因序列只是初步了解,如果能够亲眼看到自己一段一段基因的“动作”,甚至看到蛋白分子与它们的动态“交流”,将有利于形成更具象的认知。