超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用
AlphaFold3提高了蛋白-蛋白相互作用结构的准确性,为设计新的治疗模式(如抗体或其他治疗性蛋白质)打开了可能性。通过观察目标蛋白在完整生物环境中(与其他蛋白质、DNA、RNA或配体的结合)的结构,可以更深入地了解新靶点,有助于开发更有效的临床药物。科学界可以免费使用DeepMind推出了AlphaFoldServer平台,全世界的科...
西湖大学李子青/深圳湾实验室周耀旗等解读AI赋能的蛋白质结构与...
结果表明,拓扑结构可显著提升蛋白的稳定性和耐酶切稳定性、抗变性、抗聚集能力,提示其在蛋白质药物和工业酶等方面具有广泛的应用前景。进一步地,我们认为可能存在着与目前线型蛋白质序列宇宙空间相平行的多元拓扑蛋白质序列宇宙空间。这大大拓宽了蛋白质分子的范畴,为蛋白质工程提供了崭新的维度。傅晓智瑞典查尔姆斯大...
...Nature揭示:可卡因与人类多巴胺转运蛋白相互作用的精细结构...
近日,一篇发表在国际杂志Nature上题为“Structureofthehumandopaminetransporterincomplexwithcocaine”的研究报告中,来自哥本哈根大学等机构的科学家们揭示了可卡因与人类多巴胺转运蛋白相互作用的精细结构。这项发现有望助力更进一步地理解药物成瘾背后的分子机理。研究的领导者,JeppeCederholmNielsen教授解释说...
清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法
蛋白质语言模型,通过对大量序列的自监督学习,能够捕捉到氨基酸残基之间复杂的相互作用和模式。这些模型不仅能够预测蛋白质的三维结构,还能够揭示其功能和动态特性,并展现出优于经典计算生物学方法的表现。田博学课题组开发了一系列的基于蛋白质语言模型的方法,在抗体结构、蛋白质与DNA结合位点、细胞色素450酶活性预测等工作...
Nature速递:AlphaFold 3 预测所有生命分子的结构和相互作用
AlphaFold2的问世引发了蛋白质结构及其相互作用建模的革命,使得在蛋白质建模和设计领域有了广泛的应用。GoogleDeepMindandIsomorphicLabs团队在5月8日Nature的最新论文“AccuratestructurepredictionofbiomolecularinteractionswithAlphaFold3”描述了最新推出的AlphaFold3模型,采用了一个大幅更新的基于扩散的架...
AlphaFold 3问世:所有生命分子的结构和相互作用,都被AI预测了
据介绍,AlphaFold3以前所未有的精确度成功预测了所有生命分子(蛋白质、DNA、RNA、配体等)的结构和相互作用(www.e993.com)2024年11月29日。与现有的预测方法相比,AlphaFold3发现蛋白质与其他分子类型的相互作用至少提高了50%,对于一些重要的相互作用类别,预测准确率甚至提高了一倍。
知耕PI专辑|AlphaFold 3 预测了所有生命分子的结构和相互作用
随着AlphaFold的发展,蛋白质结构预测取得了巨大进展,该领域也随之迅速发展,并有多种后续方法建立在AlphaFold的思想和技术基础之上。几乎在AlphaFold推出后不久,就显示出简单的输入修改能够实现出人意料的准确蛋白质相互作用预测,并且专门针对蛋白质相互作用预测进行AlphaFold2的训练得到了一个高度准确的系统。
刚刚,AlphaFold 3 登上 Nature:所有生命分子的结构和相互作用,都...
据介绍,AlphaFold3以前所未有的精确度成功预测了所有生命分子(蛋白质、DNA、RNA、配体等)的结构和相互作用。与现有的预测方法相比,AlphaFold3发现蛋白质与其他分子类型的相互作用至少提高了50%,对于一些重要的相互作用类别,预测准确率甚至提高了一倍。
AlphaFold3来了!全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构...
针对AlphaFold3的结构预测设计小分子,有助于设计出能有效结合靶蛋白的分子。AlphaFold3提高了蛋白-蛋白相互作用结构的准确性,为设计新的治疗模式(如抗体或其他治疗性蛋白质)打开了可能性。通过观察目标蛋白在完整生物环境中(与其他蛋白质、DNA、RNA或配体的结合)的结构,可以更深入地了解新靶点,有助于开发更有效的...
Nature|Alphafold 3.0:AI 蛋白质预测器的升级
分子生物学的核心问题是理解并最终调节生物系统中复杂的原子相互作用。AlphaFold3模型在这个方向上迈出了一大步，它证明了在一个统一的框架中准确预测大范围生物分子系统的结构是可能的，而无需在蛋白质结构预测和配体对接之间进行人工分离。AlphaFold3模型还证明，缺乏跨实体进化信息并不是预测这些相互作用进展的实质性...