清华大学张数一团队开发EvoAI系统,实现对蛋白质序列-功能空间的的...

侧重在优良蛋白质元件的计算机辅助从头理性设计、自动化平台赋能的高通量表征、连续定向进化系统辅助的快速精准优化等,实现蛋白质序列-结构-功能映射的建立;以及将这些设计和改造后的元件有机耦合基因线路和调控网络,从头搭建能自我复制的生命系统,从而实现对生命的重构理解和认知,并有效地应用于疾病诊断和治疗等领域。课题...

Nature:我国学者开发通用的临床功能蛋白质组学策略,为胰腺癌诊断...

通过多维生物信息学分析和时空整合分泌蛋白和质膜(S-PM)的功能蛋白质组,研究团队开发了一种普遍适用的临床功能蛋白质组学策略——TMEPro,用于在蛋白质组学规模上全面探索PDAC-TME中癌细胞和基质细胞之间配体-受体相互作用介导的全面信号图谱。PDAC中S-PM蛋白质组的深度分析研究团队对100个人类胰腺组织样本的糖基化...

中国科大在人类癌症细胞的多药耐药蛋白的结构和功能研究领域取得...

ABC转运蛋白具有广泛的底物谱,能够从细胞外排许多外源性化学物质,包括长春花生物碱、鬼臼素、蒽环类药物、紫杉烷类和激酶抑制剂等。因此,在一线临床化疗过程中,由于它们对药物的外排,使得治疗效果大大减弱甚至消失。人类ABC转运蛋白C亚家族成员ABCC3(亦称多药耐药蛋白MRP3)广泛表达于各种组织,如肾上腺、肝脏、胰腺、...

皮肤发黄、没力气、厌油、恶心呕吐?你的肝可能出问题了

脂肪越烧越少,人也就消瘦了。脂肪烧无可烧之际,蛋白质就被盯上了。身体开始消耗蛋白质来供应能量,于是肌肉就这样被消耗下去,“乏力”也就登场了。乙肝病人出现消瘦、乏力的症状,你是不是也明白了呢?直接列出肝脏的五大功能、十大作用?太LOW了,深读君干不出来。直接列出乙肝几大症状?弱爆了,不是深读君的风...

2024年诺贝尔生理学或医学奖揭晓,专家解读微小RNA对基因调控的作用

所以突变掉lin-4后，lin-14会增加，Lin-14蛋白的大量富集会使得成年线虫长出幼嫩的皮肤。于文强表示，早期，VictorAmbros以为lin-4是某种蛋白质，结果这种具有调控功能的分子竟是一种只有21个碱基的RNA分子，这让他感到非常意外，这个研究发表在了著名的Cell杂志上。这一发现开拓了科学家们对细胞内非编码RNA也就是...

...不是维生素D|脂肪|凝血|营养素|蛋白质|维生素d|骨质疏松症...

对维生素K生理功能的认识主要集中在凝血功能和骨钙代谢方面(www.e993.com)2024年11月28日。维生素K既作用于凝血功能相关蛋白质参与凝血功能,也作用于抗凝血功能相关蛋白质参与抗凝血功能,对两个过程均有影响,因此维生素K对凝血功能的作用是双向的。维生素K还参与调节骨代谢,骨组织中含有的骨钙蛋白是一种维生素K依赖蛋白,生理功能与骨矿化作用和骨...

利用遗传密码扩展解读蛋白质琥珀酰化和戊二酰化的功能作用

瑞士苏黎世联邦理工学院Lang,Kathrin研究团队报道了,利用遗传密码扩展解读蛋白质琥珀酰化和戊二酰化的功能作用。相关研究成果发表在2024年3月26日出版的国际知名学术期刊《自然—化学》。翻译后修饰(PTMs)动态调节细胞过程。赖氨酸经过一系列酰化反应,包括丙二酰化、琥珀酰化(SucK)和戊二酰化(GluK)。这些PTMs过程增...

...魏文胜团队实现蛋白质组中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点的功能解析

此外,研究团队还分析了突变在蛋白质结构中的分布,发现丝氨酸到脯氨酸的替换广泛影响不同类型的蛋白质结构域功能,尤其是WD重复结构域中的两个高度保守的丝氨酸,暗示这些位点在维持蛋白质结构方面具有关键作用。最后,研究发现,筛选出的促进细胞生长的突变与临床癌症患者的基因数据存在高度关联性(图3)。由于RPE1细胞系是...

分析蛋白质功能结构域的策略和步骤

蛋白质的功能结构域(Functionaldomains)是蛋白质序列中的特定区域,它可以独立地完成某种生物学功能。分析蛋白序列的功能结构域通常涉及以下几个步骤:1.序列比对使用如BLAST之类的工具,将目标蛋白序列与已知的蛋白数据库进行比对,寻找相似的已知结构或功能的区域。

清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法

蛋白质语言模型,通过对大量序列的自监督学习,能够捕捉到氨基酸残基之间复杂的相互作用和模式。这些模型不仅能够预测蛋白质的三维结构,还能够揭示其功能和动态特性,并展现出优于经典计算生物学方法的表现。田博学课题组开发了一系列的基于蛋白质语言模型的方法,在抗体结构、蛋白质与DNA结合位点、细胞色素450酶活性预测等工作...