张友明:同源重组酶介导的DNA编辑技术

我们根据这个需求,我们就用Red/ET重组酶的操纵技术,用Red的同源重组的体系进行基因操纵,这个体系非常简单的、快速的把大的基因进行改造,而且在你所需要的位置上,不管是在任何的位置上都可以基因调控和改造,这样就可以实现大分子DNA的操纵,像传统的技术都能做,因为它是细胞类的重组,不需要酶的限制,这样给我们大的DN...

深度学习人工智能可从组织学切片预测同源重组缺陷和铂反应

美国加州大学圣地亚哥分校Bergstrom等报告,通过多个外部队列的苏木精和伊红(H&E)染色常规切片、切片扫描仪和组织固定变量,DeepHRD可以直接预测乳腺癌和卵巢癌的同源重组缺陷(HRD)。与分子检测相比,DeepHRD将1.8~3.1倍多的HRD患者分类,这些患者在高级别浆液性卵巢癌中表现出更好的总生存期(OS),在转移性乳腺癌中表现出...

双酶切和同源重组法构建载体

因为PCR产物可以直接用于重组连接,不需要酶切产生粘性末端,而且重组酶的重组能力强于T4DNA连接酶的连接能力,一般只需要一步即可重组连接成功,因此可以在重组反应之后进行测序鉴定。总之,两种方法各有利弊,双酶切构建过程比较繁琐,同源重组构建过程相对简单,可以省去很多的时间和精力,但假阳性率略高。

FMRP调控RNA m5C修饰并促进同源重组分子机制

细胞实验显示FMRP可以招募TET1到损伤位点,并且FMRP依赖的去甲基化与TET1介导的m5C去甲基化处于同一通路。所以FMRP可以通过招募并协助TET1行使m5C去甲基化功能,并促进同源重组修复。利用TCGA中乳腺癌病人的RNA转录组数据进行分析显示,FMRP低表达细胞具有更高的放射敏感性。值得指出的是TRDMT-FMRP-TET1介导的同源重组修复是...

??Cell:突破性进展,北京大学孔道春团队揭示DNA同源重组关键机制

蛋白帮助,Rad51包裹3'-单链DNA形成核酸-蛋白复合体,该复合体侵入同源DNA链,3'-单链DNA作为引物进行DNA合成;3)解开HollidayJunction(HJ)结构(resolutionofHollidayJunction):3'-单链DNA侵入同源DNA模板链后,随后进行的DNA合成及链交换反应,导致HJ结构形成,相关核酸酶解开HJ结构,并最终完成DNA同源重组过程...

没了它真不行:北大团队发现DNA同源重组过程的关键角色

近日,北京大学生命科学学院孔道春实验室对保护末端绝对完整的这一机制获得了进展,发现了同源重组过程中的一个必须中间体:RNA-DNA杂交链,以及一个必须因子:RNA聚合酶III(www.e993.com)2024年11月3日。研究团队确定了对3链突出端的保护是通过暂时形成的RNA-DNA杂交链来实现的:通过RNA聚合酶III合成RNA链,再与3’链的DNA突出端合成,形成RNA-DNA杂...

分子细胞卓越中心发现心内膜起源的成纤维细胞调控心脏纤维化

周斌研究组开发了双同源重组酶介导的遗传谱系示踪系统来特异性追踪心内膜起源的成纤维细胞(Endocardium-derivedfibroblast,EndoFb),揭示了EndoFb是调节心脏纤维化的独特成纤维细胞亚群。研究利用EndoFb-tracer系统发现,在心脏发育和成体稳态情况下EndoFb具有明显的区域性分布特征,在心脏压力负荷下(TAC模型)EndoFb比其...

中科院团队提出DNA链交换新模型,或给已有经典模型带来变革

但是,对这一过程中的具体机制,人们理解得依然不够全面,尤其仍旧不清楚同源重组酶到底是如何克服或拒绝异源区域的。而汪海林团队设计的这种有趣的DNA底物,对于生理条件下不连续核蛋白纤维丝介导DNA链交换的机制的理解,可以起到一定促进作用。汪海林表示:“我们的成果是在基础研究之上的发现,可以带来思想性的启示...

海大骆清铭研究组成果被国际期刊刊发

该项研究利用多种单/双同源重组酶介导的谱系示踪技术,并结合荧光显微光学切片断层成像fMOST技术,清晰地展示了新生期小鼠心脏中冠状动脉生成新方式,为损伤心脏的血管修复和治疗提供了新的研究方向,也为心血管再生医学提供了新的思路。

《自然·癌症》:中国科学家发现“癌王”对“合成致死”敏感的标志!

总的来说,这项研究发现了METTL16的一项全新功能,即METTL16会通过与DNA同源重组关键酶MRE11的相互作用来抑制DNA的同源重组修复。同时,该研究揭示了METTL16的水平是一个潜在的胰腺癌预后指标,且吉西他滨+奥拉帕利的联合使用可能是治疗高表达METTL16胰腺癌的有效策略。