从头设计蛋白的“上帝之手 ”David Baker,极大地推动了蛋白质结构...
而蛋白质可以看做是一种自然界的语言,Baker希望通过Rosetta这个软件来解决把蛋白质的序列翻译成结构的难题。当然,Baker并不是唯一这么想的科学家。随着人类基因组计划的进步,1990年代科学家们突然获得了大量基因的序列,并据此推导出大部分人类蛋白质的序列。但科学家对这些序列所对应的蛋白质结构还所知甚少。依靠传...
专访隋森芳院士:解析超大蛋白复合物原位结构,达成细胞切片样品最...
“在这项研究中,我们第一次在细胞水平上将光合系统完整的超大蛋白质复合物的原位结构解析,推进到3.3埃(angstrom,??)的近原子分辨率水平。”中国科学院院士、清华大学隋森芳教授表示。我们都知道,氧气乃生命之源。而光合作用,即绿色植物通过吸收光能,将水和二氧化碳转化为有机物,并释放氧气的过程,则是地球上氧气...
注射医美材料全面解析—胶原蛋白
目前在医学美容整形领域中常用的胶原蛋白主要是经过高度纯化、去除致敏性后制得的人源或动物源胶原蛋白和通过基因工程技术获得的重组人源胶原,该类胶原蛋白的生物相容性较好、免疫原性较低、亲水性较强、可吸收降解性较好,但重组人源胶原产品在表达系统的选择、蛋白质表达产量、产品纯度、结构特性和蛋白活性等方面仍有...
复旦学者提出蛋白解析新算法,相关代码已在GitHub开源
蛋白质结构测定的最终目的之一在于实现药物设计,而测出更精确的蛋白结构,将能有效降低新药研发中因蛋白结构测定不准而导致的研发失败概率。从蛋白质结构解析的两种测定方法说起据了解,蛋白质结构解析——分为实验蛋白测定和计算蛋白预测。实验蛋白测定,顾名思义就是在实验室里通过精密操作来测定蛋白质的结构情况,...
复旦团队开发新型AI算法“看清”蛋白质精细结构,可与AlphaFold...
OPUS-DSD具有卓越的数据处理能力和鲁棒性,能在更低信噪比的数据上保持较高的解析准确性。此外,它不仅仅局限于单颗粒冷冻电镜技术,也可推广到更高端更低信噪比的冷冻断层扫描电镜(Cryo-ET)的研究中。对于任何运用冷冻电镜解析生物大分子结构的团队,是否具备且会运用先进数据处理算法软件,尤其是针对柔性结构的算法软件,...
科学家解析光合玫瑰菌反应中心-捕光复合体结构,助推原核生物光合...
这给了该团队很大的启发(www.e993.com)2024年7月23日。在浙江大学脑与脑机融合前沿科学中心师扬研究员的帮助下,他们基于剑桥大学舍尔斯·谢雷斯(SjorsScheres)教授开发的自动建模软件和序列检索与比对,共同鉴定出了X、Y和Z蛋白的氨基酸序列。“师扬也是我们2018年发表的光合玫瑰菌反应中心-捕光复合体4.1埃分辨率结构文章的共同第...
2024 AI+蛋白质行业研究报告|智药研究
其中,英伟达、AMD等产业龙头为AI提供了坚实的算力基础;谷歌云、亚马逊云和阿里云等成熟云服务供应商则为AI应用提供了稳定、高效的软件支持。在蛋白质相关的人工智能算法领域,国内大部分公司在AI研发方面选择采用开源的算法底层框架,如TensorFlow、PyTorch等。常用的包含蛋白质信息的数据库,比如,蛋白质结构信息...
从头设计出自然界中不存在的蛋白质,他让人类离“上帝之手”越来越近
2005年,大卫团队启动了一个做Rosetta@home的项目,基于他们开发的Rosetta软件包,利用分布式计算的力量来解析蛋白质结构。令人感到意外的是,这些“网友”们还给大卫发去了反馈意见,表示计算机折叠没有他们手动折叠来得更好。更巧的是,当他与一名计算机科学家聊起这些话题时,俩人灵感迸发,决定从Rosetta@home出发开发一款游...
《食品科学》:中国海洋大学赵雪副教授等:鳀鱼蛋白肽和大豆蛋白肽...
采用超高效液相色谱-高分辨多级质谱对蛋白肽进行分析,利用PeaksOnline1.7软件分析蛋白肽产品中所有多肽的序列和相对含量。超高效液相色谱能够将6000条多肽进行分离,四极杆-轨道阱超高分辨质谱可检测总离子强度为4.79×103~2.67×108的所有多肽。根据多肽的二级质谱,本研究从鳀鱼蛋白肽和大豆蛋白肽中分别解析出5...
哪些方法适用于泛蛋白修饰组学技术的实施?
这种技术的优势在于其高通量性和灵敏度,使得研究人员能够全面了解蛋白质修饰的谱系和调控网络。3.蛋白质结构解析蛋白质结构解析是另一种适用于泛蛋白修饰组学技术的重要方法。通过解析蛋白质的三维结构,可以揭示蛋白质修饰的空间位置和相互作用。X射线晶体学、核磁共振(NMR)和电子显微镜等技术可以用于蛋白质结构的解析...