肺发育的奥秘,快来了解下吧!Cell Research,单细胞RNA测序解锁肺...
一项发表在CellResearch的前沿研究Single-cellRNAsequencingrevealsthedevelopmentalprogramunderlyingproximal–distalpatterningofthehumanlungattheembryonicstage,通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)与空间转录组技术的强强联合,为人类肺脏早期发育提供了前所未有的精细视图。本文将为您揭示这项技术如何帮助...
复旦团队单细胞测序上分 Cell,高手都怎么设计实验和分析数据的?
①细胞活性:单细胞测序一般要求细胞活性保证80%以上,因此在酶消化法处理组织时,控制酶的浓度和时间,防止消化过度;物理方法解离组织时,避免操作用力过大等机械损伤。②细胞数量:细胞活性影响细胞数量,在保证细胞活性的情况下,可增加组织量以获得目标量细胞。③细胞悬液粘稠:组织中杂质干扰或细胞裂解释放的DN...
【快讯】第四届单细胞测序技术应用研讨会暨单细胞&空间组学研讨会...
为了加强国内外单细胞和空间生物技术学术交流,促进单细胞&空间组学基础研究、转化与临床研究深入发展。2023年12月19-20日,第四届单细胞测序技术应用研讨会暨单细胞&空间组学研讨会在北京完美收官。本次研讨会吸引了领域内知名研究者、技术专家、应用专家参加,会议为期两
Sci Adv:单细胞RNA测序和空间转录组学绘制金鱼端脑细胞类型图谱
一般细胞类别包含106种明确的转录组细胞类型(图1F),其中40种是GABA能细胞,48种是谷氨酸能细胞,18种是非神经元细胞(即神经胶质细胞和免疫细胞;图S3)。研究者根据分层聚类(即从GABA1~GABA40,从GLUT1~GLUT48)用数字句柄讨论神经元细胞类型,并在图中细胞类型名称中突出显示1到3个标记基因(如GABA6-PCDH8-ZIC1)。
Genome Biol | 李薛鑫团队及合作者创建人类单细胞多组学图谱及...
结果显示,成人和胎儿组织显示出不同的DEG聚类模式:成人组织中,免疫细胞(即B细胞、T细胞、单核细胞和NK细胞)与血细胞、基质细胞、神经元等形成了不同的细胞簇;而胎儿组织中的分离特征相对不明显。接下来,研究团队确定了每个组织不同细胞类型的活跃转录因子(TFs),以分析了成人和胎儿组织的潜在基因调控网络(GRN)。
...低成本、高信噪比CH-ATAC-seq技术并绘制跨物种单细胞染色质可...
候选顺式调控元件(cCREs)包括启动子、增强子和绝缘子,通过提供转录因子(TFs)的结合位点,在基因调控中起关键作用(www.e993.com)2024年11月15日。通过解读TFs及其相应cCREs在物种间的保守基因组调控模式,可以深入了解细胞类型演化。尽管已有工作通过单细胞转录组测序(singlecellRNA-seq,scRNA-seq)识别了多个物种的细胞特异TFs,但低表达水平的TFs的...
「快讯」第三届长三角单细胞组学技术应用论坛暨空间组学前沿论坛...
2024年3月1日，“第三届长三角单细胞组学技术应用论坛暨空间组学前沿论坛”在上海隆重开幕。本次论坛汇聚了来自长三角地区及全国各地的专家学者，共同探讨单细胞组学和空间组学在疾病诊断、药物研发、精准医疗等领域的最新进展和应用前景。与会者们纷纷表示，这些技术的快速发展将为生命科学领域带来革命性的变革，现场气氛...
【Cell子刊】北京大学汤富酬、昌晓红联合发文:单细胞技术应用新进展
在这项研究中,我们利用高精度单细胞RNA测序,分析了34个个体在增殖期和分泌期的正常、真位和异位子宫内膜。我们观察到异位和异位子宫内膜中纤毛细胞的比例增加,其特征是雌激素磺基转移酶表达减少,这可能赋予细胞凋亡抗性。在转位到异位病变后,子宫内膜上皮上调烟酰胺N-甲基转移酶表达,通过促进转录因子叉头盒蛋...
Cancer Immunol Res| 谢琦/祝向东/秦智勇用单细胞转录组学技术...
近日,西湖大学生命科学学院谢琦研究员,联合浙二医院神经外科祝向东主任、华山医院神经外科秦智勇主任,在CancerImmunologyResearch上发表题为“Single-celltranscriptomicsrevealstheheterogeneityoftheimmunelandscapeofIDH-wildtypehigh-gradegliomas”的研究论文,利用单细胞转录组测序技术,对IDH-野生型高级别胶...
Nature:科学家揭示抑制衰老胶质细胞活性减少大脑非衰老细胞脂滴...
单细胞测序实验结果表明每周1次间歇性抑制AP1活性不影响神经元线粒体功能基因的变化,但显著下调脂质代谢相关基因。免疫荧光实验发现随着年龄增加,果蝇大脑中脂滴逐渐增多,并异常聚集在胶质细胞周围。每周1次间歇性抑制AP1活性可减少这种脂滴的形成。果蝇从20天龄开始阻断胶质细胞或神经元脂肪生成转录因子SREBP后结果发现...