肺发育的奥秘,快来了解下吧!Cell Research,单细胞RNA测序解锁肺...
除了内在的转录因子,由中胚层衍生的间充质细胞所形成的微环境对于肺上皮形态发生至关重要。为了进一步了解间质细胞的空间特性,特别是它们与上皮层的距离,研究者利用空间转录组测序技术,将分子特征映射到解剖尺度上(图3d)。通过该技术,研究者观察到在近端和远端上皮中分布的不同上皮亚型,包括SOX2hi/ETV5lo和SOX9hi/...
卵巢衰老的秘密,你知道么?Nature子刊揭秘|人卵巢衰老的时空转录组...
随后,将单细胞测序数据与通过空间转录组数据整合,成功地定位了这些细胞在卵巢内的具体分布情况(图1c-d)。结果显示,DNA损伤响应通路在卵细胞衰老中扮演了重要角色,而FOXP1则作为一种新的调控因子,其表达水平随着年龄增长而下降,并且能够抑制CDKN1A基因的转录。图2:细胞类型特异性的转录时空变化对差异表达基因进行分...
安徽农大张照亮团队首次报道木本植物根系单细胞转录组图谱
影响因子:7.7涉及的欧易生物服务产品:10×Genomics单细胞转录组测序单细胞样本情况:茶树(Camelliasinensisvar.sinensiscv.Shuchazao)根尖区1.茶树根细胞簇的scRNA-seq鉴定茶树根系可以合成和积累大量的茶氨酸(图1A和1B)。茶树根的细胞类型,包括皮层(Co)、木质部(Xy)、韧皮部(Ph)、形成层(Ca...
浙科大:综合转录组和代谢组分析为浙麦冬皂苷生物合成的机制及其在...
5.共表达网络分析确定关键基因和转录因子我们根据以上21个基因的表达趋势与转录因子之间的关系,进一步分析了转录和基因调控之间的相关性,以筛选参与皂苷生物合成的候选转录因子(图9A),结果显示基因和转录因子的表达水平在第三象限上调。我们发现,在Cd-HvsCd-0中,有234个转录因子与18个基因呈显著正相关,而在Cd...
Nat Methods:谢晓亮课题组新测序技术解析嗅觉受体选择机制
结合单细胞转录组、单细胞染色质开放性检测技术METATAC3和LiMCA技术,研究团队构建了不同发育阶段的嗅觉神经元多组学图谱,以研究嗅觉受体选择的染色质基础(图2a-c)。根据高分辨率染色质开放性图谱,研究团队鉴定到了27个新的嗅觉受体增强子,并发现这些增强子与之前鉴定到的63个增强子具有相似的转录因子结合特征和LHX...
中药高分案例: 五味子醇B靶向p53相关的炎症和衰老抑制主动脉瓣钙化
转录组测序鉴定出p53信号通路是SolB的关键分子靶点,表明SolB在小鼠双微体2(MDM2)-p53相互作用中发挥分子胶的作用,从而促进p53的泛素化和降解,进一步抑制p53相关的炎症和衰老反应(www.e993.com)2024年10月18日。这些结果揭示了SolB通过抑制p53信号通路对CAVD的治疗潜力,并揭示了SolB新的分子机制,为CAVD的治疗机制提供了新的见解。
追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?
研究团队利用最新的第三代长读长测序技术对发育中的人类大脑皮层两个主要区域——原胚区(germinalzone,GZ)和皮层板(corticalplate,CP)——进行了全长转录组测序。这项技术使研究人员能够捕捉到214,516种独特的异构体,其中72.6%是新发现的。这些异构体主要通过选择性剪接(alternativesplicing)产生,这一过程在...
《食品科学》:浙江科技学院蔡海莺副教授等:咖啡酸苯乙酯对HepG2...
浙江科技学院生物与化学工程学院的刘畅、常超、蔡海莺*等人用CAPE处理油酸诱导的HepG2细胞高脂肪模型,通过转录组测序,对2.5μmol/LCAPE及高脂肪组的细胞进行测序,拟从转录组水平分析CAPE处理后HepG2细胞的基因表达差异,进而对基因进行富集分析,同时筛选出与脂代谢相关的基因,以期揭示CAPE调节脂代谢的潜在机理,为改...
多组学大数据与医学发展 | 科技导报|高通量|转录组|遗传学|生物学...
转录组学研究特定细胞或组织中所有核糖核酸(ribonucleicacid,RNA)分子(即转录组)的表达,提供分子动态变化的整体视角。RNA转录组的检测包括编码蛋白的RNA(messengerRNA,mRNA)、长非编码RNA、短非编码RNA(如microRNA、小干扰RNA、小核RNA、piwi互作RNA和增强子RNA)及环状RNA。RNA测序(RNAsequencing,RNA-seq)是常用的...
单细胞测序+空间转录组测序解析溶瘤腺病毒多种协同抗肿瘤机理
猜你想看1、SCIADV|欧易单细胞测序助力解析转录因子c-Maf介导细胞代谢调控γδT17细胞发挥效应功能的作用机制2、免疫研究工具天花板—IOBR包说明书来啦~3、IJBM│“无惧遗忘”酵母双杂交研究阿尔茨海默症的病理机制4、ACTAPHARMSINB|空间分辨代谢组学揭示糖尿病肾病中具有组织异质性的代谢重编程...