NEJM | 研究首次证实lncRNA CHASERR基因单拷贝缺失可导致新型神经...

lncRNA是一类长度大于200个核苷且不具备蛋白质编码能力的核糖核酸分子,可在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用。由于临床上因lncRNA表达缺陷而导致遗传学疾病的直接证据较少,其在人类疾病中的重要性尚未得到充分研究。研究团队首先对Emma进行基因组测序分析,发现其存在...

蒋卫团队揭示基因荒漠区lncRNA HIDEN调控内胚层分化的分子机制

然而，目前大部分研究关注的是临近蛋白编码基因（PCG）的lncRNA，对于位于远离PCG的基因荒漠区的lncRNA的功能报道较少。尤其是，这类lncRNA是否以及如何在人类早期发育中发挥作用我们还知之甚少。

Science:肠道微生物组通过促进宿主肠道细胞释放Snhg9 lncRNA分子...

一系列实验表明Snhg9产生的lncRNA分子与一种名为CCAR2的蛋白结合,启动了一系列分子反应,从而阻止肠道细胞摄入食物中的脂肪。进一步的研究表明,产生这种lncRNA的肠道细胞通过免疫系统调控的一个反馈回路提醒到肠道微生物的存在时,就会减少这种lncRNA的合成。lncRNASnhg9的二级结构。图片来自Science,2023,doi:1...

学会lncRNA+肿瘤免疫的常规套路,10+文章新手也能发!

得到了17个NSCLC的肿瘤浸润的免疫相关lncRNA。作者将模型输出结果的中位数(0.0429)作为风险临界值,将293名患者分为高风险组(n=146)和低风险组(n=147),进行生存分析、单样本GSEA分析(估算高危和低危组患者的19个免疫亚群的浸润)。结果发现,较高得分对应于较少的免疫细胞浸润和较差的预后,新算法构建成功...

免疫相关lncRNA分型竟然发表在14分Nature子刊!

为了进一步验证IRLS模型在临床中的性能,通过qRT-PCR评估了这些lncRNA在232名CRC患者队列中的表达。Kaplan-Meier表明,IRLS高的患者的OS和RFS显著降低(图5A、B)。在控制了混杂变量(包括年龄、性别、T分期、N分期、M分期、AJCC分期、微卫星状态、化疗和ICI治疗)后,IRLS模型对于OS而不是RFS仍然具有统计学意义(图5C...

LncRNA和circRNA在肿瘤免疫治疗中PD-1/PD-L1通路中的作用

PD-1是一种55kDa的I型跨膜糖蛋白,有288个氨基酸,有三个不同的结构域:细胞外的N端结构域,跨膜结构域和位于N和C端细胞内的尾部(www.e993.com)2024年11月15日。PD-1与CD28有15%的相似性,与CTLA4有20%的相似性,与诱导的t细胞共刺激因子有13%的相似性。PD-1是一种主要的免疫检查点受体,属于免疫球蛋白基因超家族,在不同的免疫细胞上...

6+免疫相关lncRNA特征构建!

小编总结对lncRNA表达谱和临床特征的分析,确定了结肠癌中的DEirlncRNA。构建LncRNA对并用于预后特征的发展,所构建的signature可以有效地评价结肠癌患者的预后,指导临床治疗。这是一个经典的特征构建思路,小伙伴们可以在更多的基因集和疾病中进行尝试分析!

【科研套路】一篇文章教会你如何验证LncRNA的功能

图2LncRNAKB-1980E6.3维持BCSCs干细胞特性3)研究者在乳腺癌细胞悬浮培养中发现缺氧可显著刺激悬浮培养中乳腺癌细胞的球体形成,LncRNAKB-1980E6.3的敲低可显著消除缺氧条件下乳腺癌细胞的球体形成能力(图2f–h)。研究结论:缺氧增强型LncRNAKB-1980E6.3可维持BCSCs干细胞特性。

狂犬病毒等会诱导lncRNA表达,对宿主相关基因进行表观调控

本研究作者利用狂犬病毒作为研究对象,在感染神经元细胞系N2a细胞后通过RNA-seq的技术手段找到了大量差异表达的lncRNA,并通过表达lncRNA抑制病毒的筛选实验发现狂犬病毒诱导产生的一种全新的lncRNA,由于该lncRNA能够特异性导致EZH2的降解,所以我们将其命名为EDAL(EZH2degradationassociatedlncRNA)。

Nat Comm丨晏光荣团队揭示lncRNA编码癌多肽调控RNA m6A修饰识别

4.HuangJZ,ChenM,ChenD,GaoXC,ZhuS,HuangH,HuM,ZhuH,YanGR.APeptideEncodedbyaPutativelncRNAHOXB-AS3SuppressesColonCancerGrowth.MolCell.2017Oct5;68(1):171-184.5.MengN,ChenM,ChenD,ChenXH,...