Science | 浙大林世贤团队开发一种稀有密码子重编码技术,实现非...
哺乳动物细胞中ncAA结合的罕见密码子编码示意图(Credit:Science)通过系统的工程改造和核酸序列的大数据模型预测,稀有密码子重编码技术以接近天然氨基酸的编码效率高效合成系列带有非天然氨基酸的功能蛋白质,并在哺乳动物细胞中首次成功合成带有6个位点非天然氨基酸和4种不同类型非天然氨基酸的蛋白质,充分展示了稀有密码子...
“冷门”密码子编码为非天然蛋白质制造提供新平台
它有点类似于人类的语言系统:携带遗传信息的mRNA(信使RNA)上排列的碱基像一个个“字母”,每3个碱基形成一个密码子“单词”,它们由tRNA(转运RNA)和合成酶“翻译”成氨基酸“单词”,一个个氨基酸连接起来就形成了蛋白质“句子”。经过数十亿年的演化,地球上的几乎所有生物都“参照”同一张密码子表。从细菌到大...
Science:浙江大学林世贤团队报道稀有密码子重编码技术
且在61种有义密码子中,存在一类使用频率低于1%的密码子——稀有密码子,稀有密码子往往对应较低水平的解码tRNA(Decoding-tRNA,Dec-tRNA)。研究团队提出通过设计鲁棒性强的重编码tRNA(Recoding-tRNA,Rec-tRNA)用来竞争较弱的解码tRNA,以实现将稀有密码子高效重编码成为非天然氨基酸。图2.稀有密码子重编码体系的原理...
浙大细胞“黑客”技术登上《科学》:改写氨基酸“代码”,创造全新...
每个密码子由3个碱基组成,A、C、U、G四种碱基按不同的排列组合方式形成了64个密码子,其中61个对应编码了20种天然氨基酸,还有3个意味着终止符。这张密码子表是几乎所有生物都通用的“单词表”,从细菌到大象、从爬虫到人类,都用这20个氨基酸“单词”。一个个氨基酸连接起来,再加上“句号”,就形成了蛋白质“句子...
领创北京 | 武装蛋白
“我们的基因密码子扩展技术,就是通过对寄主细胞进行改造,让终止密码子来编码人工合成的非天然氨基酸。”刘涛解释。改造后,“建筑师”遇到“此路不通”的标志,不再停下脚步,而是继续施工。这样一番操作后,就会合成非天然氨基酸,成为构建蛋白质药物武器库中的新成员。
“黑客”系统让非天然氨基酸“入编”
为此,研究人员通过大数据模型预测和系统工程改造,得到了高质量的重编码tRNA与合成酶,而数量的优势则通过大量添加外源非天然氨基酸达成(www.e993.com)2024年10月28日。在这项研究中,曾经的“冷门”密码子表现出令人惊叹的效率,对于大多数测试模型和功能蛋白质而言,其编码非天然氨基酸的效率达到80%~90%,接近于天然氨基酸。此外,这一技术还强调了过程...
专家点评Science丨林世贤团队报道稀有密码子重编码技术
而有义密码子的冗余性为重新分配简并密码子用于编码新的氨基酸提供了操作空间。且在61种有义密码子中,存在一类使用频率低于1%的密码子——稀有密码子,稀有密码子往往对应较低水平的解码tRNA(Decoding-tRNA,Dec-tRNA)。研究者提出通过设计鲁棒性强的重编码tRNA(Recoding-tRNA,Rec-tRNA)用来竞争较弱的解码tRNA,...
陆剑/谭文杰等合作揭示猴痘病毒蛋白质序列和密码子使用分子演化规律
生物体内的蛋白质主要由61个密码子编码的20种常见氨基酸组成。除蛋氨酸和色氨酸外,剩下的18种氨基酸由至少2种密码子编码,这种现象称为遗传的简并性。编码同一种氨基酸的密码子互称为同义密码子。尽管同义密码子编码相同的氨基酸,但是在基因组中的使用频率并不一致,因此产生了密码子使用偏好性。由于同义突变不改变氨基...
两个圈外人的前卫实验,引发了一场不凡俗的科学革命
多聚(AG)将包含等量的A和G,但序列未知。尼伦伯格的目标是将多聚核苷酸置于他的无细胞蛋白质合成体系中,并利用其产出物来解读遗传密码的本质,首先是要确定编码一个氨基酸所需的碱基数量:应该可以得到足够的信息来确定密码中的碱基数上限……如果需要全部4种碱基的话,那就不可能是三位密码了。
基因工厂云探秘系列2--免费序列优化,提升载体构建成功率 解锁高效...
DNA序列通过转录和翻译产生蛋白质,而每个密码子由三个核苷酸组成,指定一个特定的氨基酸。这种对应关系在密码子表中明确列出,例如,密码子"ATG"编码甲硫氨酸(Met),开始蛋白质的合成。苯丙氨酸(Phe)对应的密码子有UUU和UUC,而终止密码子包括UAA、UAG和UGA。这种精确的编码方式确保了蛋白质合成的准确性和特异性??。